MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	GAT	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015693	ATC	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015693	ATC	2	6	99	104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015693	TGA	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015693	ATT	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015693	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015693	TGC	2	6	3099	3104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015693	ATC	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015693	GCG	2	6	3355	3360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015693	CTT	2	6	3398	3403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015693	TTG	3	9	4568	4576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015693	CGG	2	6	4590	4595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015693	ATT	2	6	4637	4642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015693	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015693	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015693	GGT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015693	CTT	2	6	4946	4951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015693	GTT	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015693	GCG	2	6	5058	5063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015693	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015693	TTG	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015693	ATC	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015693	ATG	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015693	TGT	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015693	CGA	2	6	5709	5714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015693	CTG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015693	CTT	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015693	ATG	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015693	TAA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015693	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015693	ATT	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015693	CTT	2	6	8811	8816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015693	TGA	2	6	10706	10711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015693	TGA	2	6	10724	10729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015693	TCT	2	6	11562	11567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015693	GAA	2	6	13220	13225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015693	GCA	2	6	15384	15389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015693	ATT	2	6	15440	15445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015693	AAG	2	6	16911	16916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015693	CTT	2	6	18081	18086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015693	ATT	2	6	18096	18101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015693	AAG	2	6	19162	19167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015693	TTA	2	6	19230	19235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015693	AAG	2	6	20349	20354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015693	TAT	2	6	20724	20729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015693	TAA	2	6	20744	20749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015693	CAA	2	6	20768	20773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015693	AAG	2	6	25177	25182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015693	TAG	2	6	25819	25824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015693	AAG	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015693	ATC	2	6	32457	32462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015693	AGT	2	6	32513	32518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015693	CAA	2	6	32569	32574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015693	CAA	2	6	32664	32669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015693	AGG	2	6	32676	32681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015693	CTG	2	6	32698	32703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015693	AGA	2	6	32706	32711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015693	TCA	2	6	32767	32772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015693	GAT	2	6	35784	35789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015693	GAG	2	6	35794	35799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015693	TAA	2	6	35820	35825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015693	TTC	2	6	35832	35837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015693	ATT	2	6	37404	37409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015693	TGA	2	6	41348	41353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015693	GAA	2	6	41384	41389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015693	TTG	2	6	41413	41418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015693	TTA	2	6	41557	41562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015693	TGA	2	6	42452	42457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015693	GAT	2	6	42476	42481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015693	CTT	2	6	47483	47488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015693	TGT	2	6	54663	54668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015693	GAT	2	6	54685	54690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015693	GTT	2	6	57711	57716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015693	TAT	2	6	57735	57740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015693	ATT	2	6	57815	57820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015693	GAA	2	6	57879	57884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015693	ATC	2	6	58671	58676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015693	ATT	2	6	58705	58710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015693	GCC	2	6	59606	59611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015693	CAA	2	6	59655	59660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015693	TAT	2	6	59720	59725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015693	TGG	2	6	61229	61234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015693	ATA	2	6	61263	61268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015693	GGT	2	6	61279	61284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015693	AAT	2	6	61343	61348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015693	TAA	2	6	61354	61359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015693	AAC	2	6	61390	61395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015693	GTC	2	6	61613	61618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015693	ATA	2	6	61812	61817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015693	ATA	2	6	63750	63755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015693	TAT	2	6	63989	63994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015693	AGA	2	6	64054	64059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015693	CAA	2	6	64067	64072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015693	ACA	2	6	64289	64294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015693	ATG	2	6	65279	65284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015693	TTG	2	6	65318	65323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015693	CTT	3	9	65354	65362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015693	TGT	2	6	65384	65389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015693	TTC	2	6	65549	65554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015693	GCG	2	6	65764	65769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015693	ATG	2	6	65793	65798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015693	TCT	2	6	65908	65913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015693	GCC	2	6	65920	65925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015693	ACC	2	6	65963	65968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015693	GTT	2	6	66244	66249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015693	ATT	2	6	66269	66274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015693	ATG	2	6	66286	66291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015693	CAA	2	6	66391	66396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015693	ACA	2	6	66882	66887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015693	TGA	2	6	68221	68226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015693	CTT	2	6	68243	68248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015693	AAT	2	6	68249	68254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015693	TTA	2	6	68397	68402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015693	TAA	2	6	69104	69109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015693	ATT	2	6	69144	69149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015693	GAG	2	6	69373	69378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015693	ATC	2	6	69472	69477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015693	TTC	2	6	70583	70588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015693	CAT	2	6	70593	70598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015693	CTT	2	6	70636	70641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015693	GGC	2	6	70858	70863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015693	CTG	2	6	71117	71122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015693	TTC	2	6	71141	71146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015693	CGA	2	6	73307	73312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015693	ATT	2	6	73441	73446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015693	TTA	2	6	73460	73465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015693	CTT	2	6	74476	74481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015693	GAA	2	6	79051	79056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015693	GGT	2	6	79120	79125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015693	ACC	2	6	79235	79240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015693	ATT	2	6	79998	80003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015693	GGC	2	6	80058	80063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015693	GAA	2	6	81449	81454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015693	ATT	2	6	81474	81479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015693	AAC	2	6	81480	81485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015693	CCT	2	6	82842	82847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015693	CTT	2	6	83100	83105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015693	AGC	2	6	83200	83205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015693	CGT	2	6	83206	83211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015693	AAC	2	6	87204	87209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015693	AGG	2	6	89860	89865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015693	GTA	2	6	89872	89877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.