MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	GA	3	6	541	546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015063	CG	3	6	5496	5501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015063	TG	4	8	11142	11149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015063	TC	3	6	11182	11187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015063	CA	3	6	11353	11358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015063	GA	4	8	11683	11690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015063	GT	3	6	11770	11775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015063	AC	3	6	13641	13646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015063	GC	3	6	14016	14021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015063	CG	3	6	14407	14412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015063	GC	3	6	24717	24722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015063	AT	3	6	25845	25850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015063	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015063	CA	3	6	28747	28752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015063	TC	3	6	28803	28808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015063	GA	3	6	30029	30034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015063	TG	3	6	30152	30157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015063	CA	3	6	30586	30591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015063	GT	3	6	40742	40747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015063	TC	3	6	41460	41465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015063	TG	3	6	41769	41774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015063	TC	3	6	43774	43779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015063	AG	3	6	44327	44332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015063	AT	3	6	44588	44593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015063	AT	3	6	46807	46812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015063	GA	4	8	52234	52241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015063	GT	3	6	52493	52498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015063	AC	3	6	52602	52607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015063	AT	3	6	53020	53025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015063	AT	3	6	54512	54517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015063	AT	3	6	55037	55042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015063	TC	3	6	55886	55891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015063	AT	3	6	58082	58087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015063	GA	3	6	65584	65589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015063	AT	3	6	67226	67231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015063	AC	3	6	69523	69528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015063	GC	3	6	75116	75121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015063	TA	4	8	75682	75689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015063	TA	3	6	76225	76230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015063	AG	3	6	82683	82688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015063	TA	3	6	83981	83986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015063	TG	3	6	84159	84164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015063	TC	3	6	88233	88238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015063	TG	3	6	93709	93714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015063	TG	3	6	93841	93846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015063	AG	3	6	96121	96126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015063	TA	3	6	98391	98396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015063	TA	3	6	101005	101010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015063	TG	3	6	102239	102244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015063	AG	3	6	104900	104905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015063	GA	3	6	107007	107012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015063	TG	3	6	107173	107178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015063	TG	3	6	109060	109065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015063	CG	3	6	111974	111979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015063	AT	3	6	113171	113176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015063	AT	3	6	113432	113437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015063	TG	3	6	115917	115922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015063	AT	3	6	116639	116644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015063	TA	3	6	116756	116761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015063	TA	3	6	116770	116775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015063	CT	3	6	120510	120515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015063	CT	3	6	120696	120701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015063	CA	3	6	120880	120885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015063	CG	4	8	121926	121933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015063	CA	3	6	124236	124241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015063	TA	3	6	124367	124372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015063	AG	3	6	130202	130207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.