MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	AGG	2	6	148	153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015063	ATA	2	6	326	331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015063	ATT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015063	CTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015063	TTA	2	6	431	436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015063	TAA	2	6	439	444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015063	AAT	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015063	GGC	2	6	490	495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015063	GCC	2	6	4709	4714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015063	TGC	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015063	AGT	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015063	ACA	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015063	TGT	2	6	5040	5045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015063	CTT	3	9	5090	5098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015063	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015063	GTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015063	ACT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015063	CGC	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015063	GAT	2	6	5352	5357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015063	CAC	2	6	5381	5386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015063	GGC	2	6	5668	5673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015063	GAA	2	6	5760	5765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015063	GTT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015063	ATA	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015063	GCT	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015063	TGA	2	6	9896	9901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015063	AAG	2	6	9936	9941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015063	GGC	2	6	10721	10726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015063	CTT	2	6	10981	10986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015063	TCC	2	6	10999	11004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015063	TGA	2	6	11028	11033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015063	CAG	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015063	GCG	2	6	11124	11129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015063	TTC	2	6	11152	11157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015063	CGA	2	6	11220	11225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015063	GCG	2	6	11283	11288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015063	GGC	2	6	11377	11382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015063	GCG	3	9	11417	11425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015063	GCC	2	6	11428	11433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015063	GAC	2	6	11539	11544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015063	CTG	2	6	11553	11558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015063	GTG	2	6	11590	11595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015063	AGG	3	9	11633	11641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015063	GCG	2	6	11721	11726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015063	GCC	2	6	11729	11734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015063	ATT	2	6	12527	12532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015063	CTG	2	6	13694	13699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015063	CGC	2	6	13741	13746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015063	GGA	2	6	13802	13807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015063	GAG	2	6	13860	13865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015063	CCG	2	6	13939	13944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015063	CGG	2	6	13990	13995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015063	CGG	2	6	14096	14101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015063	GCA	2	6	14116	14121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015063	CGA	2	6	14143	14148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015063	ACA	2	6	14231	14236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015063	AAT	2	6	14322	14327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015063	GGC	2	6	14419	14424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015063	GGA	2	6	15262	15267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015063	CGG	2	6	15322	15327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015063	CCG	2	6	15363	15368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015063	GCG	2	6	15396	15401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015063	GCA	2	6	15460	15465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015063	CCG	2	6	15571	15576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015063	ACA	2	6	16397	16402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015063	GAG	2	6	17473	17478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015063	ACG	2	6	17479	17484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015063	TCG	2	6	17852	17857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015063	CGG	2	6	18110	18115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015063	CGC	2	6	18234	18239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015063	GCA	2	6	18260	18265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015063	CGA	2	6	18286	18291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015063	ATG	2	6	18399	18404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015063	TCA	2	6	18555	18560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015063	GTC	2	6	18568	18573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015063	TTA	2	6	19706	19711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015063	CGG	2	6	19727	19732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015063	GAT	2	6	19738	19743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015063	ATC	2	6	19997	20002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015063	ACC	2	6	20480	20485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015063	ACC	2	6	20600	20605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015063	TTG	2	6	20669	20674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015063	GGC	2	6	20683	20688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015063	CCA	2	6	20844	20849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015063	CGT	2	6	20866	20871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015063	ATG	2	6	20959	20964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015063	GAT	2	6	20976	20981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015063	GTA	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015063	CAG	2	6	21108	21113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015063	ATC	2	6	21165	21170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015063	AAT	2	6	21183	21188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015063	ATA	2	6	21247	21252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015063	ATT	2	6	21261	21266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015063	GCG	2	6	21279	21284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015063	ATC	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015063	AAT	2	6	23588	23593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015063	CCT	2	6	24394	24399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015063	TAA	2	6	24418	24423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015063	CTT	2	6	24552	24557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015063	GGC	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015063	GAT	2	6	25876	25881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015063	CAC	2	6	25938	25943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015063	AAT	2	6	26008	26013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015063	GAA	2	6	26108	26113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015063	TTC	2	6	26116	26121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015063	ACT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015063	TTC	2	6	26580	26585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015063	AGC	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015063	TTG	2	6	26666	26671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015063	TAC	2	6	26700	26705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015063	ATA	2	6	26718	26723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015063	ACC	2	6	27741	27746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015063	GCT	2	6	27761	27766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015063	AAT	2	6	27775	27780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015063	ATG	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015063	TCA	2	6	28667	28672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015063	AAT	2	6	28897	28902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015063	TAA	2	6	28970	28975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015063	GAT	3	9	28982	28990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015063	AGA	2	6	29085	29090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015063	TAT	2	6	30121	30126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015063	TAC	2	6	30176	30181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015063	TGA	2	6	30260	30265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015063	TGA	2	6	30513	30518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015063	TAT	2	6	30519	30524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015063	AAG	2	6	30528	30533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015063	ACA	2	6	30714	30719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015063	GTG	2	6	30725	30730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015063	GGA	2	6	31462	31467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015063	AGT	2	6	32195	32200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015063	ACA	2	6	34936	34941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015063	AGA	2	6	35516	35521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015063	ATT	2	6	36106	36111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015063	TAA	2	6	36117	36122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015063	ATT	2	6	36150	36155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015063	CGA	2	6	37044	37049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015063	CGC	2	6	37240	37245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015063	GCA	2	6	37301	37306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015063	TAA	2	6	37328	37333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015063	ATT	2	6	37365	37370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015063	TGA	2	6	37416	37421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_015063	TAA	2	6	37729	37734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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