MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015062	CG	3	6	119	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015062	TC	3	6	6192	6197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015062	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015062	TA	3	6	8247	8252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015062	AC	3	6	21047	21052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015062	TA	3	6	22108	22113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015062	AG	3	6	25973	25978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015062	TA	3	6	26026	26031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015062	TC	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015062	CA	3	6	31185	31190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015062	GT	3	6	35385	35390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015062	CG	3	6	38048	38053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015062	GC	3	6	38669	38674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015062	CA	3	6	45507	45512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015062	TA	3	6	47432	47437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015062	TA	3	6	48290	48295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015062	AC	3	6	65721	65726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015062	TG	3	6	70639	70644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015062	AG	3	6	73427	73432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015062	TG	3	6	95897	95902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015062	TC	3	6	96047	96052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015062	AT	3	6	96511	96516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015062	GA	3	6	97649	97654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015062	TG	3	6	97699	97704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015062	CT	3	6	99822	99827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015062	AG	3	6	99943	99948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015062	TA	3	6	106130	106135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015062	TG	3	6	106906	106911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015062	CA	3	6	106959	106964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015062	TG	3	6	107137	107142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015062	AT	5	10	110617	110626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015062	TA	3	6	110792	110797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015062	GA	4	8	110994	111001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015062	AG	3	6	111025	111030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015062	TC	3	6	111130	111135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015062	CT	3	6	111959	111964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015062	GC	3	6	112129	112134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015062	TA	3	6	114230	114235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015062	TA	3	6	116017	116022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015062	TC	3	6	116038	116043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015062	TA	3	6	116206	116211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015062	AT	3	6	116549	116554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015062	CA	3	6	120218	120223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015062	TG	3	6	120282	120287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015062	TA	3	6	124234	124239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015062	GT	3	6	124257	124262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015062	AC	3	6	124380	124385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015062	GA	3	6	136020	136025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015062	CT	3	6	141753	141758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015062	GT	3	6	146711	146716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015062	CA	3	6	162741	162746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015062	CG	3	6	162958	162963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015062	AC	3	6	163086	163091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015062	CA	3	6	177994	177999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015062	GT	3	6	191375	191380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015062	TA	4	8	195654	195661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015062	GT	3	6	195794	195799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015062	TG	3	6	203015	203020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015062	GC	3	6	203231	203236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015062	CT	3	6	206982	206987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015062	TC	3	6	217657	217662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015062	TC	3	6	219689	219694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015062	CA	3	6	228777	228782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015062	CA	3	6	228796	228801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015062	AT	3	6	229226	229231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015062	GC	3	6	238148	238153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015062	GT	3	6	265377	265382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015062	GT	3	6	265551	265556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015062	TC	4	8	277003	277010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015062	GA	3	6	299991	299996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015062	GA	3	6	301802	301807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015062	TG	3	6	315487	315492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015062	CA	3	6	315501	315506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015062	GC	3	6	315722	315727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015062	CG	3	6	322452	322457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015062	TA	3	6	323339	323344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015062	CA	3	6	327314	327319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015062	TG	3	6	327370	327375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015062	AG	3	6	327575	327580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015062	AC	3	6	337351	337356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015062	AC	3	6	340002	340007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015062	AC	3	6	342075	342080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015062	TC	3	6	342092	342097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015062	GT	3	6	345531	345536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015062	GA	3	6	346221	346226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015062	CT	3	6	357857	357862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015062	TC	3	6	359411	359416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015062	CT	3	6	361380	361385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015062	TG	3	6	390746	390751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015062	TC	3	6	390857	390862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015062	TC	3	6	396537	396542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015062	AT	3	6	397687	397692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015062	AT	3	6	407183	407188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015062	AT	3	6	415186	415191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015062	AG	3	6	415215	415220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015062	AT	3	6	417654	417659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015062	TA	3	6	417664	417669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015062	AT	4	8	422560	422567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015062	TC	3	6	431031	431036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015062	AT	3	6	431322	431327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015062	AT	4	8	431664	431671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015062	TC	3	6	431719	431724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015062	AT	3	6	432031	432036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015062	TC	3	6	432311	432316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015062	TA	3	6	454079	454084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015062	AT	3	6	454144	454149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015062	AT	3	6	454519	454524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015062	GA	3	6	454604	454609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015062	CA	3	6	464127	464132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015062	CT	3	6	465298	465303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015062	AT	3	6	467976	467981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015062	AG	3	6	473917	473922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015062	AC	3	6	473941	473946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015062	GC	3	6	473979	473984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015062	TA	3	6	477531	477536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015062	TG	3	6	477618	477623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015062	AT	3	6	484388	484393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015062	TG	3	6	484564	484569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015062	TA	3	6	495588	495593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015062	TG	3	6	497728	497733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015062	TG	3	6	498609	498614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015062	TA	4	8	501318	501325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015062	TG	3	6	501514	501519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015062	TC	3	6	503855	503860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015062	GA	3	6	527121	527126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015062	AC	3	6	533597	533602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015062	GA	3	6	533696	533701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015062	AC	3	6	537218	537223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015062	CG	3	6	538938	538943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015062	AC	3	6	539203	539208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015062	AG	3	6	539241	539246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015062	TA	3	6	539540	539545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015062	AT	3	6	539659	539664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015062	AG	3	6	547297	547302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015062	AT	3	6	547378	547383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015062	TA	3	6	556112	556117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015062	GA	3	6	571446	571451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015062	TG	3	6	583463	583468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015062	TA	3	6	585720	585725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015062	GC	3	6	590811	590816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015062	AT	3	6	590978	590983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015062	TA	3	6	598691	598696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015062	GC	3	6	599205	599210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015062	GA	3	6	605362	605367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015062	TG	3	6	607313	607318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015062	AT	3	6	616461	616466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.