MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015062	AAT	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015062	ATC	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015062	CCG	2	6	182	187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015062	ATT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015062	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015062	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015062	ATG	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015062	CTG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015062	TGC	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015062	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015062	AAT	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015062	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015062	GCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015062	TGA	2	6	9361	9366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015062	GAT	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015062	GCA	2	6	13181	13186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015062	CAG	2	6	17770	17775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015062	TAT	2	6	20619	20624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015062	GAA	2	6	20710	20715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015062	ATA	2	6	20730	20735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015062	TAA	2	6	21230	21235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015062	TAT	2	6	21276	21281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015062	AGT	2	6	22095	22100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015062	TAA	2	6	22127	22132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015062	CGC	2	6	22133	22138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015062	CAG	2	6	26074	26079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015062	GGC	2	6	26082	26087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015062	AAT	2	6	27347	27352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015062	TGA	2	6	27496	27501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015062	CAT	2	6	27518	27523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015062	TGA	2	6	27590	27595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015062	CAG	2	6	27601	27606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015062	TAA	2	6	31037	31042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015062	TCC	2	6	31161	31166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015062	ATG	2	6	31173	31178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015062	TAA	2	6	31194	31199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015062	TGA	2	6	34595	34600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015062	ATC	2	6	35407	35412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015062	TGC	2	6	35420	35425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015062	GCT	2	6	36912	36917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015062	ATG	2	6	36920	36925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015062	ATT	2	6	37872	37877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015062	TAT	3	9	38011	38019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015062	CCG	2	6	38044	38049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015062	GAC	2	6	38507	38512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015062	GCA	2	6	38644	38649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015062	GCA	2	6	45496	45501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015062	GTC	2	6	47446	47451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015062	GTC	2	6	48148	48153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015062	GGT	2	6	51964	51969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015062	TGT	2	6	51982	51987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015062	ATC	2	6	55161	55166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015062	ACT	2	6	55369	55374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015062	GCT	2	6	57631	57636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015062	ATT	2	6	58478	58483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015062	CTT	2	6	59196	59201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015062	ATT	2	6	59423	59428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015062	TGA	2	6	59433	59438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015062	CGG	2	6	59484	59489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015062	TTA	2	6	63996	64001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015062	AAT	2	6	64595	64600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015062	ATT	2	6	64618	64623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015062	ATC	2	6	64765	64770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015062	TTG	2	6	64781	64786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015062	ATC	2	6	64801	64806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015062	CAG	2	6	64813	64818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015062	TTG	2	6	64853	64858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015062	TAA	2	6	64862	64867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015062	GTT	2	6	64906	64911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015062	CCT	2	6	65150	65155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015062	GTC	2	6	65177	65182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015062	GAT	2	6	65201	65206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015062	TAC	2	6	65265	65270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015062	AGA	2	6	65370	65375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015062	CTA	2	6	65392	65397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015062	AAG	2	6	65502	65507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015062	TGC	2	6	65686	65691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015062	CAA	2	6	65713	65718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015062	ACA	2	6	67467	67472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015062	AGT	2	6	67729	67734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015062	AGC	2	6	68107	68112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015062	TCT	2	6	68141	68146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015062	CCG	2	6	68153	68158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015062	CAA	2	6	68224	68229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015062	TGA	2	6	68264	68269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015062	CTC	2	6	68280	68285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015062	GCC	2	6	68472	68477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015062	CCA	2	6	68510	68515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015062	ATG	2	6	68576	68581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015062	CTT	2	6	68582	68587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015062	ATT	2	6	70304	70309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015062	TTC	2	6	70427	70432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015062	AAT	2	6	70452	70457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015062	ACC	2	6	70514	70519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015062	GAG	2	6	70582	70587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015062	ATG	2	6	70605	70610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015062	TGC	2	6	70693	70698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015062	CTG	2	6	70707	70712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015062	ATT	2	6	70792	70797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015062	ATT	2	6	72156	72161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015062	AAC	2	6	72442	72447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015062	AAT	2	6	73267	73272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015062	TCG	2	6	73322	73327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015062	TGA	2	6	73331	73336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015062	TAT	2	6	73471	73476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015062	GCC	2	6	76728	76733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015062	GAG	2	6	86113	86118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015062	TAA	2	6	92458	92463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015062	GAT	4	12	92481	92492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015062	CCG	2	6	92530	92535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015062	CCA	2	6	92706	92711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015062	CTG	2	6	92718	92723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015062	GTA	2	6	94401	94406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015062	GCC	2	6	94466	94471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015062	CCA	2	6	94486	94491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015062	ATT	2	6	94677	94682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015062	CAT	2	6	95972	95977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015062	CGC	2	6	95981	95986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015062	GCC	2	6	96093	96098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015062	TGA	2	6	96442	96447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015062	GAT	2	6	96578	96583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015062	ATT	2	6	96810	96815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015062	ACT	2	6	96886	96891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015062	AAG	2	6	97490	97495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015062	GCT	2	6	97521	97526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015062	CCA	2	6	97545	97550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015062	TCA	2	6	97727	97732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015062	AAT	2	6	97765	97770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015062	TCT	2	6	97823	97828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015062	GCT	2	6	99844	99849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015062	TTA	2	6	103748	103753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015062	AAC	2	6	103754	103759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015062	AAT	2	6	103763	103768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015062	TGA	2	6	103807	103812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015062	CTA	2	6	105853	105858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015062	CAA	2	6	105939	105944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015062	TAT	2	6	106169	106174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015062	GAT	2	6	106240	106245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015062	AGC	2	6	106269	106274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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