MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 1395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015062	TTAT	2	8	450739	450746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015062	TAAA	2	8	450766	450773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015062	T	8	8	450814	450821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015062	T	6	6	452590	452595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015062	TA	3	6	454079	454084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015062	CGG	2	6	454087	454092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015062	ATT	2	6	454095	454100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015062	TAT	2	6	454106	454111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015062	TAA	2	6	454117	454122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015062	AT	3	6	454144	454149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015062	ATC	2	6	454203	454208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015062	AAC	2	6	454238	454243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015062	CGT	2	6	454286	454291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015062	CGT	2	6	454356	454361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015062	TTA	2	6	454391	454396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015062	ATC	2	6	454439	454444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015062	ATT	2	6	454493	454498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015062	A	6	6	454510	454515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015062	AT	3	6	454519	454524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015062	TAA	2	6	454585	454590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015062	GA	3	6	454604	454609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015062	GCA	2	6	457526	457531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015062	T	6	6	457562	457567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015062	A	6	6	457619	457624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015062	TGGG	2	8	457637	457644	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015062	GCT	2	6	457673	457678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015062	CCTGT	2	10	457713	457722	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_015062	A	6	6	457736	457741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015062	CAT	2	6	457786	457791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015062	TCAC	2	8	457815	457822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015062	GCG	2	6	457866	457871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015062	ACGA	2	8	457887	457894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_015062	GGGA	2	8	458132	458139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015062	AAT	3	9	463556	463564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015062	CGC	2	6	464019	464024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015062	TAAA	2	8	464067	464074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015062	AAT	2	6	464101	464106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015062	ATA	2	6	464119	464124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015062	CA	3	6	464127	464132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015062	CT	3	6	465298	465303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_015062	ATA	2	6	466875	466880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015062	ATA	2	6	467837	467842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015062	AGA	2	6	467896	467901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015062	TTC	2	6	467937	467942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015062	AT	3	6	467976	467981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015062	CGC	2	6	470419	470424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_015062	TTA	2	6	473899	473904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015062	AG	3	6	473917	473922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015062	AC	3	6	473941	473946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015062	GC	3	6	473979	473984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_015062	G	6	6	473986	473991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015062	TTA	2	6	474027	474032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015062	GCA	2	6	474064	474069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015062	ATT	2	6	474161	474166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015062	ATCA	2	8	474189	474196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_015062	TCA	2	6	475777	475782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015062	TTTCC	2	10	475790	475799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1058	NC_015062	AAT	2	6	475814	475819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015062	TA	3	6	477531	477536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015062	TG	3	6	477618	477623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015062	TTG	2	6	477639	477644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015062	GAA	2	6	477716	477721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015062	TAA	2	6	477737	477742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015062	T	6	6	478807	478812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015062	TAA	2	6	478865	478870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015062	TGC	2	6	478877	478882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015062	CTTC	2	8	479810	479817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015062	GAT	2	6	483115	483120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015062	GCCT	2	8	484349	484356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_015062	AT	3	6	484388	484393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015062	AATA	2	8	484492	484499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015062	A	6	6	484520	484525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015062	TG	3	6	484564	484569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015062	TGC	2	6	484605	484610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015062	AATA	2	8	484640	484647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015062	ATGA	2	8	484663	484670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015062	T	6	6	484675	484680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015062	GTT	2	6	484714	484719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015062	T	8	8	484718	484725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015062	CTAT	2	8	484732	484739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_015062	AAT	2	6	484755	484760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015062	ATTC	2	8	485584	485591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_015062	TGC	2	6	485601	485606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015062	T	6	6	487627	487632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015062	TCA	2	6	487706	487711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015062	GAA	2	6	487733	487738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015062	TTGA	2	8	487740	487747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015062	AATC	2	8	493438	493445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_015062	GATT	2	8	493446	493453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015062	GGT	2	6	493506	493511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015062	CGC	2	6	493583	493588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015062	ATT	2	6	493606	493611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015062	CGC	2	6	493614	493619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_015062	CAA	2	6	493650	493655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015062	ACCA	2	8	493715	493722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_015062	A	6	6	493736	493741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015062	CGA	2	6	495119	495124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015062	ATC	2	6	495200	495205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015062	CAT	2	6	495281	495286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015062	TTG	2	6	495294	495299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015062	ATC	2	6	495354	495359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015062	GTGTT	2	10	495375	495384	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015062	TTG	2	6	495506	495511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015062	GATG	2	8	495528	495535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015062	TGC	2	6	495561	495566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015062	A	7	7	495575	495581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015062	TA	3	6	495588	495593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015062	GGT	2	6	495624	495629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015062	GACA	2	8	495653	495660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_015062	TCT	2	6	495728	495733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015062	TCT	2	6	495785	495790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015062	CTGC	2	8	495819	495826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_015062	GCC	2	6	495838	495843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_015062	CAG	2	6	495868	495873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015062	CGG	2	6	496055	496060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015062	CGC	2	6	496086	496091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_015062	GAAAT	2	10	496116	496125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015062	TTG	2	6	496155	496160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015062	TAA	2	6	496691	496696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015062	ATG	2	6	497712	497717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015062	TG	3	6	497728	497733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015062	TG	3	6	498609	498614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015062	GAT	2	6	500185	500190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015062	TCA	2	6	501281	501286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015062	TA	4	8	501318	501325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015062	ATC	2	6	501335	501340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015062	AGTT	2	8	501415	501422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015062	GAG	2	6	501479	501484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015062	TAAT	2	8	501494	501501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015062	TG	3	6	501514	501519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015062	ATCA	2	8	501529	501536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_015062	TGT	2	6	501551	501556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015062	TATT	2	8	503198	503205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015062	A	6	6	503229	503234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015062	TGA	2	6	503323	503328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015062	ATCA	2	8	503355	503362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_015062	CGC	2	6	503454	503459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_015062	TGA	3	9	503470	503478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015062	AGGTAC	2	12	503479	503490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1141	NC_015062	AAATG	2	10	503595	503604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_015062	AAT	2	6	503609	503614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_015062	A	6	6	503651	503656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1147	NC_015062	AAT	2	6	503721	503726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_015062	T	6	6	503750	503755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_015062	A	7	7	503759	503765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1154	NC_015062	TTA	2	6	523432	523437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_015062	CGG	2	6	526284	526289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_015062	A	6	6	533036	533041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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