MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 1395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015062	GAA	2	6	206863	206868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015062	CTT	2	6	206882	206887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015062	T	7	7	206895	206901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015062	CACAA	2	10	206924	206933	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
505	NC_015062	GAA	2	6	206963	206968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015062	CT	3	6	206982	206987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015062	AGG	2	6	207042	207047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015062	GAT	2	6	207333	207338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015062	GAT	2	6	208255	208260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015062	GTAC	2	8	208328	208335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015062	A	7	7	208770	208776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015062	CAT	2	6	208830	208835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015062	TTTTA	2	10	208856	208865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015062	T	7	7	211386	211392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015062	ACA	2	6	212400	212405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015062	GCG	2	6	214220	214225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015062	AAT	3	9	216407	216415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015062	AAAT	2	8	216437	216444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015062	TC	3	6	217657	217662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015062	CGG	2	6	217680	217685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015062	GCCC	2	8	217699	217706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
522	NC_015062	GCC	2	6	219093	219098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015062	GGC	2	6	219103	219108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015062	GAA	2	6	219114	219119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015062	AAAT	2	8	219600	219607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015062	TC	3	6	219689	219694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015062	ATAA	2	8	219747	219754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015062	CAA	2	6	219775	219780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015062	ATA	2	6	220937	220942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015062	GAGT	2	8	220971	220978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015062	TAAT	2	8	220987	220994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015062	AAC	2	6	221079	221084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015062	GAA	2	6	221144	221149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015062	CAAT	2	8	221198	221205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_015062	ATTT	2	8	221297	221304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015062	A	6	6	221338	221343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015062	TAA	3	9	221344	221352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015062	TGA	2	6	222145	222150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015062	T	7	7	225264	225270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015062	ATT	2	6	227141	227146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015062	CATT	2	8	228102	228109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_015062	ACC	2	6	228659	228664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_015062	T	9	9	228722	228730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015062	CA	3	6	228777	228782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015062	CA	3	6	228796	228801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_015062	AT	3	6	229226	229231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015062	GCT	2	6	229238	229243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015062	TAT	2	6	229874	229879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015062	TAA	2	6	229883	229888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015062	TTTA	2	8	231616	231623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015062	A	6	6	231667	231672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015062	GGA	2	6	231727	231732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015062	ATT	2	6	232758	232763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015062	TCT	2	6	232787	232792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015062	ATT	2	6	232807	232812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015062	T	6	6	232862	232867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015062	ATT	2	6	233096	233101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015062	CAG	2	6	233250	233255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015062	CTCAT	2	10	233544	233553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
560	NC_015062	ATT	2	6	233560	233565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015062	T	6	6	233956	233961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015062	TCC	2	6	234423	234428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015062	CATTA	2	10	234435	234444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_015062	CAA	2	6	234524	234529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015062	CGG	2	6	234765	234770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015062	TAT	2	6	234823	234828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015062	AAT	3	9	234831	234839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015062	T	6	6	235201	235206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015062	GGAT	2	8	235232	235239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015062	AAT	2	6	235301	235306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015062	AAT	2	6	236593	236598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015062	TGC	2	6	236691	236696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015062	AGG	2	6	236724	236729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015062	ATT	2	6	238002	238007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015062	GTT	2	6	238016	238021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015062	TAA	2	6	238036	238041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015062	GC	3	6	238148	238153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_015062	TGT	2	6	238218	238223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015062	CCG	2	6	238250	238255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015062	GCG	3	9	238259	238267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015062	TGT	2	6	238728	238733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015062	ATT	2	6	238774	238779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015062	TCT	2	6	238830	238835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015062	CGG	2	6	238875	238880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015062	A	6	6	247343	247348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015062	ATG	3	9	247393	247401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015062	ATGTG	2	10	251299	251308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015062	CTC	2	6	251313	251318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_015062	GCC	2	6	260640	260645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015062	TTAA	2	8	265187	265194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015062	T	6	6	265213	265218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015062	GT	3	6	265377	265382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015062	AAT	3	9	265421	265429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015062	A	7	7	265452	265458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015062	TCA	2	6	265524	265529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015062	ATTA	2	8	265533	265540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015062	GT	3	6	265551	265556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015062	ATT	2	6	270344	270349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015062	TTA	2	6	270356	270361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015062	A	8	8	270384	270391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015062	T	6	6	270396	270401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015062	AGG	2	6	270470	270475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015062	TC	4	8	277003	277010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_015062	ACT	2	6	277020	277025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015062	ATT	2	6	278666	278671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015062	TTTAT	2	10	279833	279842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015062	ATAA	2	8	279874	279881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015062	TAATC	2	10	279882	279891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
609	NC_015062	TAA	2	6	279894	279899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015062	TAA	2	6	279988	279993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015062	GGT	2	6	279996	280001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015062	TCA	2	6	280022	280027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015062	CCG	2	6	282578	282583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_015062	CGG	2	6	282592	282597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015062	T	8	8	282600	282607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015062	TCC	2	6	284173	284178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015062	TAAAAT	2	12	284242	284253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015062	ATA	2	6	284268	284273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015062	CCT	2	6	284332	284337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015062	CACG	2	8	284357	284364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NC_015062	TAA	2	6	286307	286312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015062	GGC	2	6	286338	286343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015062	A	6	6	286445	286450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015062	ATG	2	6	286466	286471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015062	GTTT	2	8	286525	286532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015062	CTC	2	6	286554	286559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015062	AAT	2	6	286575	286580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015062	T	6	6	286584	286589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015062	ATT	2	6	288992	288997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015062	CTA	2	6	289018	289023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015062	TAT	2	6	289029	289034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015062	TGA	2	6	289040	289045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015062	GCG	2	6	293906	293911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015062	TCA	2	6	295644	295649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015062	AAC	2	6	295710	295715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015062	A	6	6	295717	295722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015062	TTTATT	2	12	295906	295917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015062	ATT	2	6	296951	296956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015062	A	6	6	296963	296968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015062	GTAAA	2	10	296976	296985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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