MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015061	TTAT	2	8	1211361	1211368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015061	TTTG	2	8	1211372	1211379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015061	ATT	2	6	1211430	1211435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015061	TG	3	6	1211437	1211442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015061	TGC	2	6	1211446	1211451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015061	GCA	2	6	1211533	1211538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015061	TCAG	2	8	1212584	1212591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_015061	TCT	2	6	1212602	1212607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015061	GCC	2	6	1212613	1212618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_015061	TGC	2	6	1212620	1212625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015061	GAA	2	6	1212644	1212649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015061	GGCG	2	8	1213477	1213484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_015061	TTA	2	6	1215301	1215306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015061	T	6	6	1217329	1217334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015061	CCTG	2	8	1218206	1218213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_015061	CAGG	2	8	1218908	1218915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_015061	ATT	2	6	1218932	1218937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015061	TGT	2	6	1221027	1221032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015061	TGGA	2	8	1221162	1221169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015061	A	7	7	1221656	1221662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015061	GTC	2	6	1222568	1222573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015061	CCCTG	2	10	1224087	1224096	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3023	NC_015061	ATTTT	2	10	1224156	1224165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015061	ATA	2	6	1224233	1224238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015061	GGT	2	6	1224245	1224250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015061	TTAT	2	8	1224301	1224308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015061	AAATT	2	10	1224359	1224368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015061	TAA	2	6	1224393	1224398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015061	CTT	2	6	1224563	1224568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015061	CGC	2	6	1224586	1224591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_015061	AG	3	6	1224673	1224678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015061	TG	3	6	1224698	1224703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015061	ATT	2	6	1224704	1224709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015061	TGA	2	6	1224823	1224828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015061	ACG	2	6	1224845	1224850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015061	CAG	2	6	1224896	1224901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015061	GTG	2	6	1224923	1224928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015061	TA	3	6	1224933	1224938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015061	TCCC	2	8	1225963	1225970	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3040	NC_015061	GAG	2	6	1225981	1225986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015061	T	8	8	1226013	1226020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015061	CTC	2	6	1229763	1229768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_015061	GAG	2	6	1229783	1229788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015061	TC	3	6	1232541	1232546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_015061	CGT	2	6	1232555	1232560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015061	GCC	2	6	1232641	1232646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_015061	TGCCA	2	10	1232651	1232660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3048	NC_015061	TA	3	6	1232777	1232782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015061	ATGTC	2	10	1232816	1232825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_015061	AGC	2	6	1235181	1235186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015061	CGC	2	6	1236930	1236935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_015061	A	7	7	1240538	1240544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015061	GAC	2	6	1241131	1241136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015061	CTG	2	6	1241158	1241163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015061	TAA	2	6	1241194	1241199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015061	TAT	2	6	1241206	1241211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015061	TG	3	6	1241236	1241241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015061	AT	3	6	1241292	1241297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015061	ATT	2	6	1241314	1241319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015061	TCT	2	6	1241334	1241339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015061	TTA	2	6	1241409	1241414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015061	GC	3	6	1245062	1245067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_015061	CGC	3	9	1245065	1245073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_015061	TTC	2	6	1245098	1245103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015061	GTT	2	6	1248196	1248201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015061	CAG	2	6	1248616	1248621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015061	GAT	2	6	1248641	1248646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015061	CCATC	2	10	1250861	1250870	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3069	NC_015061	ATT	2	6	1250906	1250911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015061	T	7	7	1251882	1251888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015061	T	7	7	1252766	1252772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015061	GTT	2	6	1254028	1254033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015061	A	9	9	1254036	1254044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015061	ATT	2	6	1254047	1254052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015061	A	6	6	1254080	1254085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015061	TAA	3	9	1257479	1257487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015061	ATA	3	9	1257503	1257511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015061	TCA	2	6	1259633	1259638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_015061	AGGG	2	8	1259676	1259683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015061	T	6	6	1259752	1259757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015061	CTT	2	6	1259758	1259763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015061	T	6	6	1259780	1259785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015061	TCC	2	6	1259798	1259803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_015061	T	6	6	1259838	1259843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015061	A	7	7	1259848	1259854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015061	A	6	6	1260739	1260744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015061	T	6	6	1260759	1260764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015061	TTA	2	6	1260769	1260774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015061	GAG	2	6	1263777	1263782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015061	AT	3	6	1263810	1263815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015061	GC	3	6	1263833	1263838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_015061	GCA	2	6	1263913	1263918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015061	CAC	2	6	1263979	1263984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_015061	AG	3	6	1264036	1264041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015061	T	6	6	1264076	1264081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015061	AAT	2	6	1264924	1264929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015061	CGG	2	6	1264987	1264992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_015061	TAA	2	6	1265036	1265041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015061	AGAAA	2	10	1265046	1265055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015061	TAT	2	6	1265348	1265353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015061	GTA	2	6	1265377	1265382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015061	TAA	2	6	1265403	1265408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015061	TAC	2	6	1265421	1265426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015061	GTA	2	6	1265451	1265456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015061	TAC	2	6	1265499	1265504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015061	GTA	2	6	1265519	1265524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015061	TAC	2	6	1265573	1265578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015061	TAA	3	9	1265585	1265593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015061	AAAG	2	8	1269384	1269391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015061	ATA	2	6	1270613	1270618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015061	TTG	2	6	1270628	1270633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015061	ATA	2	6	1270650	1270655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015061	GGT	2	6	1270659	1270664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015061	AAT	2	6	1270671	1270676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015061	T	6	6	1270756	1270761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015061	GAA	2	6	1270824	1270829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015061	TGTT	2	8	1270837	1270844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015061	ATTGTG	2	12	1270863	1270874	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015061	TTA	2	6	1270878	1270883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015061	ATA	2	6	1270927	1270932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015061	A	6	6	1272246	1272251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015061	T	6	6	1272321	1272326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015061	TGT	2	6	1272340	1272345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015061	AGG	2	6	1272397	1272402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015061	GTA	2	6	1272458	1272463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015061	TAA	3	9	1272479	1272487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015061	GTT	2	6	1273442	1273447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015061	A	6	6	1273528	1273533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015061	AGA	2	6	1273573	1273578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015061	ATG	2	6	1273654	1273659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015061	ATT	2	6	1275044	1275049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015061	AGA	2	6	1275069	1275074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015061	A	6	6	1275074	1275079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015061	AAT	2	6	1275131	1275136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3256	NC_015061	CCTG	2	8	1330144	1330151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3264	NC_015061	TAA	2	6	1335657	1335662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3401	NC_015061	CGC	2	6	1410087	1410092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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