MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015061	GAT	2	6	635807	635812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015061	TTA	2	6	635821	635826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015061	GAA	2	6	637579	637584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015061	TGA	2	6	637900	637905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015061	ATT	2	6	642589	642594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015061	T	6	6	642850	642855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015061	GAA	2	6	642871	642876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015061	AAG	2	6	642877	642882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015061	GGGGA	2	10	642883	642892	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015061	A	6	6	642951	642956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015061	TGG	2	6	643005	643010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015061	TGT	2	6	643165	643170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015061	ATA	2	6	643217	643222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015061	CCT	2	6	643735	643740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_015061	TTA	2	6	643742	643747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015061	ATG	2	6	643772	643777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015061	ATT	2	6	643778	643783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015061	TTA	2	6	643784	643789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015061	TTGGTT	2	12	643799	643810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015061	ATT	2	6	643821	643826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015061	AGC	2	6	643837	643842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015061	CT	3	6	643849	643854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_015061	AGC	2	6	643960	643965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015061	AGT	2	6	643968	643973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015061	TTC	2	6	643986	643991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015061	A	7	7	644120	644126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015061	CAT	2	6	644136	644141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015061	TGG	2	6	644181	644186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015061	ATT	2	6	644196	644201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015061	GGAG	2	8	644221	644228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015061	AGG	2	6	644497	644502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015061	AC	3	6	644531	644536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_015061	ATT	2	6	644538	644543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015061	TCAT	2	8	644547	644554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_015061	TCA	2	6	645181	645186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015061	TTAC	2	8	645194	645201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_015061	TGAC	2	8	645720	645727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_015061	GTCG	2	8	647616	647623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_015061	CAA	2	6	647635	647640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015061	CCA	2	6	647671	647676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_015061	GGC	2	6	647678	647683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015061	T	6	6	647727	647732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015061	AGT	2	6	647733	647738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015061	CTA	2	6	649603	649608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_015061	GTTT	2	8	649906	649913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015061	TGT	2	6	649919	649924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015061	CGT	2	6	649967	649972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_015061	GCG	2	6	650051	650056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_015061	TA	3	6	650059	650064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015061	CAAT	2	8	650066	650073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_015061	GCA	2	6	650126	650131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_015061	CCG	2	6	650133	650138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015061	TG	3	6	650144	650149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015061	GC	3	6	650157	650162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_015061	ATG	2	6	650182	650187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015061	TGC	2	6	651264	651269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015061	TCTCGC	2	12	651294	651305	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_015061	TCAG	2	8	651306	651313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_015061	GCTG	2	8	651314	651321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_015061	A	7	7	651327	651333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015061	A	6	6	651339	651344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015061	T	7	7	651362	651368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015061	TAA	2	6	652038	652043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015061	ATA	2	6	652071	652076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015061	CTG	2	6	652085	652090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_015061	AAG	2	6	652537	652542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015061	ATG	2	6	652595	652600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015061	T	6	6	652605	652610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015061	TG	3	6	652613	652618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015061	AGGGT	2	10	652655	652664	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015061	CGG	2	6	653544	653549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015061	TCA	2	6	654849	654854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015061	CTGA	2	8	654879	654886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_015061	TCT	2	6	655627	655632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015061	GAC	2	6	655708	655713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1577	NC_015061	GCA	2	6	655816	655821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015061	T	8	8	657184	657191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015061	GATTT	2	10	660104	660113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_015061	CTTTT	2	10	661614	661623	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_015061	TCAA	2	8	661631	661638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_015061	CTG	2	6	662941	662946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_015061	TGA	2	6	662960	662965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015061	AGG	2	6	663272	663277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015061	TGCTC	2	10	663352	663361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1588	NC_015061	CGG	2	6	663418	663423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_015061	CAG	2	6	663503	663508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_015061	T	6	6	663595	663600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_015061	CCT	2	6	663636	663641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1595	NC_015061	T	6	6	667304	667309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_015061	A	8	8	667410	667417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015061	TTG	2	6	668970	668975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_015061	TGT	2	6	668984	668989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015061	TATG	2	8	668990	668997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015061	AAC	2	6	669104	669109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_015061	ATT	3	9	669114	669122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015061	TCA	2	6	669132	669137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015061	CAA	3	9	670257	670265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_015061	TGCT	2	8	671724	671731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1611	NC_015061	TGG	2	6	674735	674740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015061	AAT	2	6	674822	674827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_015061	TGT	2	6	674858	674863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015061	GAT	2	6	674920	674925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_015061	CG	3	6	674965	674970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_015061	TAA	2	6	677417	677422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015061	AAT	2	6	678285	678290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_015061	GGC	3	9	678352	678360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_015061	GTT	2	6	679816	679821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015061	A	7	7	679831	679837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015061	CCG	2	6	680732	680737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_015061	A	6	6	680823	680828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_015061	AAT	2	6	681901	681906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015061	AAG	2	6	681917	681922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_015061	GAT	2	6	682069	682074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015061	TC	3	6	682109	682114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_015061	AATG	2	8	682156	682163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015061	TG	3	6	682162	682167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_015061	GTT	2	6	785212	785217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1915	NC_015061	AGGCT	2	10	785467	785476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1948	NC_015061	CT	3	6	790258	790263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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