MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015061	CTGT	2	8	451792	451799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015061	T	6	6	451799	451804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015061	TTG	2	6	451832	451837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015061	T	8	8	451888	451895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015061	ATTTTT	2	12	451914	451925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015061	GC	3	6	459810	459815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015061	T	6	6	459819	459824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015061	ATTT	2	8	459830	459837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015061	ACAA	2	8	459860	459867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_015061	TAA	2	6	459873	459878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015061	TTATGC	2	12	460244	460255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1012	NC_015061	AAT	2	6	461619	461624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015061	CTT	2	6	463991	463996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015061	T	6	6	464350	464355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015061	T	7	7	465731	465737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015061	ATC	2	6	465815	465820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015061	ATA	2	6	465829	465834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015061	ATC	2	6	465839	465844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015061	TGT	2	6	465852	465857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015061	CAA	2	6	466338	466343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015061	CTG	2	6	466345	466350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015061	GGA	2	6	466359	466364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015061	TTC	2	6	468883	468888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015061	CG	3	6	471850	471855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_015061	CGG	2	6	473866	473871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015061	TATT	2	8	473904	473911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015061	AAAT	2	8	473938	473945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015061	TG	3	6	473951	473956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015061	T	6	6	474082	474087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015061	T	6	6	474921	474926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015061	CA	3	6	474933	474938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_015061	AGG	2	6	474979	474984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015061	AAT	2	6	474988	474993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015061	ATG	2	6	476508	476513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015061	AAG	2	6	476528	476533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015061	GAC	2	6	477249	477254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015061	CT	3	6	477255	477260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_015061	TGC	2	6	477290	477295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015061	GCT	2	6	477458	477463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015061	TGC	2	6	477465	477470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015061	TTCC	2	8	478125	478132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_015061	T	6	6	478168	478173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015061	AGAA	2	8	478939	478946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015061	A	6	6	478945	478950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015061	CGGG	2	8	478956	478963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_015061	GAT	2	6	480950	480955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015061	A	8	8	481079	481086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015061	AGC	2	6	483012	483017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015061	ATT	2	6	484492	484497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015061	TTG	2	6	484499	484504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015061	A	6	6	484524	484529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015061	AGA	2	6	484546	484551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015061	A	6	6	484551	484556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015061	AGC	3	9	484630	484638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015061	GCC	2	6	484648	484653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015061	GTT	2	6	485323	485328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015061	AAC	2	6	485370	485375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015061	CA	3	6	485417	485422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_015061	TCG	2	6	485440	485445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015061	TCA	2	6	485481	485486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015061	CGG	2	6	485530	485535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015061	GTC	2	6	491525	491530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015061	AAT	2	6	491535	491540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015061	A	7	7	491566	491572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015061	T	7	7	491591	491597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015061	TCG	2	6	492222	492227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015061	GC	3	6	492236	492241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015061	CTG	2	6	492257	492262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015061	A	6	6	494058	494063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015061	CATT	2	8	494121	494128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_015061	TGA	2	6	494132	494137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015061	T	6	6	494138	494143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015061	GATA	2	8	495183	495190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015061	TAA	2	6	495200	495205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015061	AT	3	6	495239	495244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015061	TCT	2	6	495269	495274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015061	GGA	2	6	495275	495280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015061	CAG	2	6	496742	496747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015061	T	7	7	496757	496763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015061	CCG	2	6	496775	496780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_015061	A	8	8	496800	496807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015061	GTC	2	6	496836	496841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015061	GAC	2	6	496848	496853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015061	AG	3	6	496870	496875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015061	GCAGTG	2	12	496880	496891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1086	NC_015061	TCA	2	6	497321	497326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015061	CTTCG	2	10	497467	497476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1088	NC_015061	TCG	2	6	497762	497767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015061	TAT	2	6	497772	497777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015061	CAA	2	6	497783	497788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015061	CAC	2	6	497800	497805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015061	GGT	2	6	497863	497868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015061	TG	3	6	497882	497887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015061	TAA	2	6	497892	497897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015061	TG	3	6	498021	498026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015061	T	7	7	498080	498086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015061	GCA	2	6	498099	498104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015061	AAGG	2	8	498108	498115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015061	TCT	2	6	498147	498152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015061	AGG	2	6	498179	498184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015061	TGA	2	6	498868	498873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015061	TTA	2	6	498912	498917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015061	ATG	2	6	498947	498952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015061	T	7	7	499005	499011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015061	AATT	2	8	499089	499096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015061	A	6	6	499121	499126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015061	GCC	2	6	500088	500093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_015061	GGC	2	6	500102	500107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015061	CTTC	2	8	500397	500404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015061	AATA	2	8	500420	500427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015061	ATT	2	6	500498	500503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015061	ACAA	2	8	500541	500548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_015061	TAT	2	6	500593	500598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015061	T	8	8	500635	500642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015061	ATTA	2	8	500662	500669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015061	T	6	6	500710	500715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015061	T	6	6	500721	500726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015061	TTG	2	6	500741	500746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015061	T	7	7	500755	500761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015061	TTTA	2	8	500789	500796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015061	A	8	8	500809	500816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015061	AT	3	6	500868	500873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015061	ACTC	2	8	500880	500887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_015061	A	6	6	500889	500894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015061	TCT	2	6	500902	500907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015061	ACC	2	6	500948	500953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015061	TA	3	6	500957	500962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015061	AAC	2	6	501008	501013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015061	TCTT	2	8	501016	501023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_015061	ACTT	2	8	501024	501031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_015061	AAT	2	6	501415	501420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015061	T	6	6	502441	502446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015061	TGT	2	6	502451	502456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015061	GAA	2	6	502551	502556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015061	T	7	7	502563	502569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015061	CTT	2	6	502570	502575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015061	GTC	2	6	502578	502583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_015061	T	6	6	502607	502612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015061	GAAA	2	8	505557	505564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_015061	CTTTTT	2	12	507004	507015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1142	NC_015061	GAT	2	6	510337	510342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_015061	CCTGG	2	10	510390	510399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1144	NC_015061	T	8	8	510418	510425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1146	NC_015061	AGA	2	6	510448	510453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_015061	TAA	2	6	510517	510522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_015061	T	6	6	511485	511490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_015061	AAT	2	6	511568	511573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1153	NC_015061	TGA	2	6	514315	514320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_015061	ATTG	2	8	514390	514397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_015061	A	6	6	516606	516611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_015061	CCT	2	6	516645	516650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1160	NC_015061	TGA	2	6	516701	516706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_015061	TGA	2	6	516769	516774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_015061	TAC	2	6	516828	516833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1167	NC_015061	GGT	2	6	517291	517296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1171	NC_015061	GTC	2	6	517447	517452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1176	NC_015061	TGG	2	6	517761	517766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_015061	GTT	2	6	565962	565967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_015061	T	7	7	565979	565985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_015061	ATT	2	6	566006	566011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_015061	TA	3	6	569188	569193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_015061	GA	4	8	569256	569263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_015061	CAG	2	6	571651	571656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_015061	T	6	6	616952	616957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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