MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015061	GCG	2	6	4817235	4817240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_015061	ATT	2	6	4817282	4817287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_015061	TTC	2	6	4817298	4817303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_015061	GTT	2	6	4817337	4817342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_015061	T	6	6	4817402	4817407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_015061	AC	3	6	4817475	4817480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_015061	AGG	2	6	4820197	4820202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_015061	ATG	2	6	4824128	4824133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_015061	AAT	2	6	4824165	4824170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_015061	T	6	6	4826150	4826155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_015061	ATG	2	6	4826193	4826198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_015061	ATA	2	6	4826296	4826301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_015061	CAA	2	6	4826318	4826323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_015061	CAA	2	6	4826376	4826381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_015061	TAT	2	6	4829889	4829894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_015061	CCT	2	6	4829933	4829938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_015061	AAC	2	6	4830473	4830478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_015061	CTT	2	6	4830568	4830573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_015061	A	6	6	4830595	4830600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_015061	TAA	2	6	4830639	4830644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_015061	TAAA	2	8	4830653	4830660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_015061	A	6	6	4830658	4830663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_015061	TCT	2	6	4830666	4830671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_015061	CTC	2	6	4830728	4830733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_015061	AAAG	2	8	4830746	4830753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_015061	CT	3	6	4832676	4832681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_015061	GCG	2	6	4832705	4832710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_015061	A	6	6	4833436	4833441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_015061	TA	3	6	4833489	4833494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_015061	T	6	6	4833520	4833525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_015061	TTTTA	2	10	4833552	4833561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_015061	TCA	2	6	4833598	4833603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_015061	TGT	2	6	4833633	4833638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_015061	GTT	2	6	4833649	4833654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_015061	AGA	2	6	4833682	4833687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_015061	TTA	2	6	4833707	4833712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_015061	TA	3	6	4833776	4833781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_015061	CTT	2	6	4833817	4833822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_015061	TGA	2	6	4833830	4833835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_015061	AAT	2	6	4833912	4833917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_015061	TGC	2	6	4833983	4833988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_015061	GA	3	6	4834056	4834061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_015061	ACT	2	6	4835287	4835292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_015061	AAAC	2	8	4835305	4835312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12545	NC_015061	AAT	2	6	4835599	4835604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_015061	TGC	2	6	4838215	4838220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_015061	AGC	2	6	4838238	4838243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_015061	GAG	2	6	4838259	4838264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_015061	TTG	2	6	4840559	4840564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_015061	GA	3	6	4840566	4840571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_015061	T	9	9	4841035	4841043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_015061	TAA	2	6	4841049	4841054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_015061	T	7	7	4841137	4841143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_015061	GCGG	2	8	4841186	4841193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12555	NC_015061	GTA	2	6	4841211	4841216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_015061	ATA	2	6	4842651	4842656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_015061	CT	3	6	4842665	4842670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_015061	TCAGG	2	10	4842722	4842731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12559	NC_015061	A	6	6	4842736	4842741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_015061	TGT	2	6	4844669	4844674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_015061	CT	4	8	4844682	4844689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_015061	CAG	2	6	4844694	4844699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_015061	TTCTC	2	10	4844710	4844719	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12564	NC_015061	CCG	2	6	4845675	4845680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_015061	TAA	2	6	4845684	4845689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_015061	TCC	2	6	4845802	4845807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_015061	TTAA	2	8	4845821	4845828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_015061	ACC	2	6	4845855	4845860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12569	NC_015061	TCT	2	6	4846945	4846950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_015061	CCGG	2	8	4846965	4846972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12571	NC_015061	AG	3	6	4846997	4847002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_015061	TAT	2	6	4848860	4848865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_015061	GCG	2	6	4848915	4848920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12574	NC_015061	CG	3	6	4848919	4848924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12575	NC_015061	AG	3	6	4848929	4848934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_015061	A	6	6	4850477	4850482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_015061	CGC	2	6	4851270	4851275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12578	NC_015061	ACT	2	6	4851302	4851307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_015061	C	6	6	4852943	4852948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12580	NC_015061	A	7	7	4854344	4854350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_015061	TGA	2	6	4854380	4854385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_015061	ACG	2	6	4855026	4855031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_015061	CA	4	8	4855877	4855884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12584	NC_015061	TTC	2	6	4855885	4855890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_015061	CATAAA	2	12	4855909	4855920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12586	NC_015061	ATG	2	6	4855971	4855976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_015061	AT	3	6	4856011	4856016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_015061	CTA	2	6	4856017	4856022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_015061	AGC	2	6	4856064	4856069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_015061	GCT	2	6	4856076	4856081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_015061	AATAA	2	10	4859675	4859684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_015061	A	6	6	4859683	4859688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_015061	TTC	2	6	4859695	4859700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_015061	TGC	2	6	4859716	4859721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_015061	CTTT	2	8	4861153	4861160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12596	NC_015061	T	6	6	4861158	4861163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_015061	ATC	2	6	4861164	4861169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_015061	ATT	2	6	4863608	4863613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_015061	A	6	6	4863645	4863650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_015061	AAG	2	6	4863678	4863683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_015061	TAA	2	6	4863692	4863697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_015061	ATG	2	6	4863904	4863909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_015061	T	6	6	4863933	4863938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_015061	TGA	2	6	4863947	4863952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_015061	TGC	2	6	4864003	4864008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_015061	GGA	2	6	4864043	4864048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_015061	GTG	2	6	4864161	4864166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_015061	GCGG	2	8	4864187	4864194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.