MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015061	TCA	2	6	2485313	2485318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_015061	ATT	2	6	2485340	2485345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015061	CAT	2	6	2485354	2485359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_015061	TCC	2	6	2485388	2485393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_015061	GAT	2	6	2485435	2485440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015061	ATT	2	6	2485451	2485456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015061	GGC	2	6	2485475	2485480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015061	GGC	2	6	2485511	2485516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015061	TTC	2	6	2485621	2485626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_015061	GAA	2	6	2487399	2487404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015061	ACTG	2	8	2487481	2487488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_015061	ATAAC	2	10	2488425	2488434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_015061	GTAAG	2	10	2488467	2488476	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015061	GTG	2	6	2491658	2491663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015061	ATC	2	6	2493103	2493108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015061	CG	3	6	2493132	2493137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_015061	ACGC	2	8	2493153	2493160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_015061	GCCA	2	8	2494732	2494739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_015061	ATT	2	6	2494740	2494745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015061	AGT	2	6	2494757	2494762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015061	GGT	2	6	2494812	2494817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015061	TTC	2	6	2494856	2494861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015061	TTTTG	2	10	2495838	2495847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015061	T	7	7	2495893	2495899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015061	AAG	2	6	2495907	2495912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015061	CTG	2	6	2496247	2496252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_015061	CAGA	2	8	2496315	2496322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_015061	GC	3	6	2496469	2496474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_015061	AAG	2	6	2496491	2496496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015061	AGC	2	6	2496508	2496513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_015061	CTC	2	6	2497107	2497112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_015061	T	6	6	2497114	2497119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015061	AGT	2	6	2499067	2499072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015061	A	6	6	2503132	2503137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015061	CGCAG	2	10	2503143	2503152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6036	NC_015061	T	6	6	2503233	2503238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015061	A	6	6	2504838	2504843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015061	ACA	2	6	2504899	2504904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_015061	GGC	2	6	2504907	2504912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015061	CA	3	6	2506140	2506145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_015061	T	6	6	2506173	2506178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015061	C	7	7	2506181	2506187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6043	NC_015061	AT	3	6	2506239	2506244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_015061	TCCGC	2	10	2506646	2506655	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6045	NC_015061	TCC	2	6	2506656	2506661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_015061	T	6	6	2506712	2506717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015061	ATG	2	6	2506718	2506723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015061	ATA	2	6	2506808	2506813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015061	TAA	2	6	2509109	2509114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015061	TTTC	2	8	2509158	2509165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_015061	ATC	2	6	2509174	2509179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015061	CGA	2	6	2510246	2510251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_015061	ATT	2	6	2510255	2510260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015061	A	6	6	2510303	2510308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015061	AAGC	2	8	2510407	2510414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_015061	CAT	2	6	2510416	2510421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015061	AAATCA	2	12	2510422	2510433	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6058	NC_015061	A	6	6	2510441	2510446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015061	TCA	2	6	2512382	2512387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015061	GAT	2	6	2512472	2512477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015061	TAG	2	6	2521204	2521209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015061	T	6	6	2521238	2521243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015061	TG	3	6	2521261	2521266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015061	CGG	2	6	2521290	2521295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015061	GGC	2	6	2521350	2521355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_015061	AAT	2	6	2521364	2521369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015061	A	7	7	2521410	2521416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015061	CCGG	2	8	2522077	2522084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_015061	TGA	2	6	2522119	2522124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015061	TAT	2	6	2522136	2522141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015061	ATA	2	6	2522238	2522243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015061	TTTA	2	8	2522253	2522260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015061	A	8	8	2522260	2522267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015061	T	6	6	2524974	2524979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_015061	GCG	2	6	2525897	2525902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_015061	CCG	2	6	2525910	2525915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_015061	CCT	2	6	2525926	2525931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_015061	AAATAT	2	12	2525945	2525956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015061	GAA	2	6	2525991	2525996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015061	A	7	7	2525995	2526001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_015061	A	6	6	2526034	2526039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015061	AGA	2	6	2530217	2530222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015061	TGGG	2	8	2530277	2530284	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_015061	CTAAGC	2	12	2530300	2530311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015061	TGT	2	6	2531009	2531014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_015061	AAT	2	6	2531027	2531032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_015061	CCA	2	6	2531057	2531062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_015061	AAAC	2	8	2531070	2531077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_015061	AACA	2	8	2531078	2531085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_015061	GAT	2	6	2532510	2532515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015061	T	8	8	2532557	2532564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_015061	ATC	2	6	2532613	2532618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015061	GAAG	2	8	2532707	2532714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_015061	T	8	8	2532735	2532742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015061	GTTG	2	8	2532845	2532852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015061	TCA	2	6	2532999	2533004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_015061	T	6	6	2533024	2533029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_015061	TAA	2	6	2533131	2533136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_015061	TAT	2	6	2533356	2533361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015061	TAA	2	6	2533389	2533394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015061	ATG	2	6	2533511	2533516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015061	A	7	7	2533545	2533551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015061	TTAC	2	8	2537853	2537860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_015061	A	6	6	2537864	2537869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015061	TTAA	2	8	2537876	2537883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015061	ATTT	2	8	2537922	2537929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015061	GTT	2	6	2537975	2537980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_015061	ATG	2	6	2538022	2538027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015061	A	6	6	2538058	2538063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_015061	ATT	2	6	2538139	2538144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015061	ATAA	3	12	2538148	2538159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015061	GAAA	2	8	2538294	2538301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015061	CCT	2	6	2539934	2539939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015061	CTTTT	2	10	2540653	2540662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6115	NC_015061	TA	3	6	2540695	2540700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015061	AT	3	6	2540703	2540708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015061	GAA	2	6	2550002	2550007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015061	AT	3	6	2550021	2550026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015061	CCG	2	6	2550056	2550061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_015061	TAAT	2	8	2550081	2550088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015061	CTGC	2	8	2550133	2550140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_015061	GTC	2	6	2550191	2550196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_015061	GCA	2	6	2550208	2550213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015061	G	6	6	2550217	2550222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015061	ATAA	2	8	2550241	2550248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015061	TAA	3	9	2550304	2550312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015061	AAT	2	6	2550369	2550374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015061	TAA	2	6	2550394	2550399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015061	ATG	2	6	2551059	2551064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015061	CGCT	2	8	2551092	2551099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_015061	C	6	6	2551140	2551145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6132	NC_015061	ATT	2	6	2551156	2551161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_015061	CCG	2	6	2551194	2551199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_015061	CTGT	2	8	2551208	2551215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_015061	CCT	2	6	2551342	2551347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_015061	TTA	2	6	2551425	2551430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_015061	TC	3	6	2552189	2552194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_015061	AC	3	6	2552240	2552245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6139	NC_015061	GTC	2	6	2554134	2554139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6143	NC_015061	C	6	6	2555126	2555131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6144	NC_015061	CGCT	2	8	2555204	2555211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6148	NC_015061	ACTC	2	8	2555560	2555567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6243	NC_015061	CCAG	2	8	2579012	2579019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6384	NC_015061	A	6	6	2632192	2632197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6387	NC_015061	CTC	2	6	2634368	2634373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6388	NC_015061	ACCCC	2	10	2634459	2634468	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6389	NC_015061	AGGGG	2	10	2634484	2634493	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_015061	CTGAA	2	10	2634495	2634504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6391	NC_015061	ATT	2	6	2634588	2634593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6393	NC_015061	CTT	2	6	2634619	2634624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6394	NC_015061	ATTT	2	8	2634667	2634674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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