MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015061	AGA	2	6	2249746	2249751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015061	CTGG	2	8	2249854	2249861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_015061	TTA	2	6	2249883	2249888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_015061	GC	3	6	2254248	2254253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_015061	ATG	2	6	2254267	2254272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015061	TCC	2	6	2255041	2255046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_015061	TC	3	6	2255058	2255063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015061	T	6	6	2255070	2255075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_015061	TGA	2	6	2255081	2255086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_015061	AAAC	2	8	2255117	2255124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_015061	TA	3	6	2255158	2255163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015061	ATT	2	6	2255175	2255180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015061	ATTT	2	8	2255237	2255244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_015061	TTA	2	6	2255248	2255253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_015061	AAT	2	6	2256145	2256150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_015061	TAA	2	6	2256157	2256162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015061	AAC	2	6	2256174	2256179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_015061	T	6	6	2256207	2256212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015061	ATT	2	6	2256236	2256241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015061	ACA	2	6	2257561	2257566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015061	GAG	2	6	2257573	2257578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015061	CTC	2	6	2260262	2260267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_015061	ACCCC	2	10	2260353	2260362	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5524	NC_015061	GGGA	2	8	2260380	2260387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015061	T	7	7	2260398	2260404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015061	T	6	6	2263965	2263970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015061	CAGC	2	8	2263987	2263994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_015061	TG	3	6	2264063	2264068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015061	ATT	3	9	2264124	2264132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_015061	GC	4	8	2264185	2264192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_015061	TGA	2	6	2264194	2264199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_015061	TCAG	2	8	2264223	2264230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_015061	ATT	2	6	2264357	2264362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_015061	ATG	2	6	2264422	2264427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015061	A	7	7	2264437	2264443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_015061	GTC	2	6	2264766	2264771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_015061	AT	3	6	2265267	2265272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015061	TTG	2	6	2265293	2265298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015061	TAT	2	6	2265302	2265307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015061	TGAA	2	8	2265312	2265319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_015061	AG	3	6	2265410	2265415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015061	T	6	6	2266538	2266543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015061	GT	3	6	2270568	2270573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015061	ATG	3	9	2270623	2270631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015061	TCA	2	6	2271798	2271803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015061	GTT	2	6	2271804	2271809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015061	A	8	8	2275169	2275176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015061	GC	3	6	2275177	2275182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_015061	GC	3	6	2275189	2275194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_015061	CAT	2	6	2275211	2275216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_015061	TG	3	6	2275908	2275913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_015061	T	6	6	2275929	2275934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015061	ACTT	2	8	2275960	2275967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_015061	ATC	2	6	2276012	2276017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015061	T	7	7	2276020	2276026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015061	AAC	2	6	2276028	2276033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015061	TCA	2	6	2276121	2276126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_015061	ATTCAG	2	12	2276130	2276141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5559	NC_015061	CAA	2	6	2276175	2276180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015061	A	6	6	2280084	2280089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015061	T	7	7	2280111	2280117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_015061	GTG	2	6	2281099	2281104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015061	AT	3	6	2281106	2281111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015061	AGA	2	6	2281173	2281178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015061	GCG	2	6	2281234	2281239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015061	A	7	7	2281279	2281285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015061	ATC	2	6	2281308	2281313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_015061	GAA	2	6	2281847	2281852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015061	GTGA	2	8	2281880	2281887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015061	AGG	2	6	2281917	2281922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015061	TAA	2	6	2281928	2281933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_015061	GAG	2	6	2282025	2282030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_015061	ACCCC	2	10	2282088	2282097	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5574	NC_015061	GGGA	2	8	2282115	2282122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_015061	ATT	2	6	2282210	2282215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_015061	A	7	7	2282227	2282233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_015061	ACTC	2	8	2282240	2282247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_015061	TGC	2	6	2285797	2285802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_015061	TA	3	6	2285934	2285939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015061	ATTG	2	8	2285975	2285982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015061	AGGAAG	2	12	2285992	2286003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_015061	TGGT	2	8	2290377	2290384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015061	TG	3	6	2290405	2290410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015061	T	6	6	2290443	2290448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_015061	ATC	2	6	2290464	2290469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_015061	ATG	2	6	2290516	2290521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015061	CTC	3	9	2292139	2292147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_015061	GAG	2	6	2292164	2292169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015061	T	6	6	2294708	2294713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015061	TCA	2	6	2294803	2294808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_015061	T	6	6	2294835	2294840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015061	GT	3	6	2294939	2294944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015061	ACA	3	9	2294964	2294972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_015061	AAG	2	6	2296440	2296445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_015061	TCA	2	6	2296518	2296523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015061	AGG	2	6	2297910	2297915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015061	TCC	2	6	2298195	2298200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_015061	ATCAT	2	10	2298221	2298230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5599	NC_015061	G	7	7	2298243	2298249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015061	G	7	7	2298263	2298269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015061	GAT	2	6	2299262	2299267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015061	CAG	2	6	2300272	2300277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015061	AAC	2	6	2300293	2300298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015061	ATGG	2	8	2301322	2301329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015061	GGC	2	6	2301855	2301860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_015061	TTCAAA	2	12	2301868	2301879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5607	NC_015061	CG	3	6	2301931	2301936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_015061	GC	3	6	2301964	2301969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_015061	CTG	2	6	2301993	2301998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_015061	TGA	2	6	2302002	2302007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015061	TGC	2	6	2302024	2302029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015061	TC	3	6	2302039	2302044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_015061	CT	3	6	2302107	2302112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_015061	T	6	6	2302130	2302135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015061	GC	3	6	2302272	2302277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_015061	TTC	2	6	2304414	2304419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_015061	ATA	2	6	2308744	2308749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015061	TGA	2	6	2310832	2310837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_015061	AGA	2	6	2310874	2310879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015061	CTC	2	6	2310893	2310898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_015061	TTA	2	6	2310964	2310969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015061	ACCCC	2	10	2310983	2310992	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5623	NC_015061	GGGA	2	8	2311010	2311017	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015061	CCTG	2	8	2312267	2312274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_015061	CGT	2	6	2312364	2312369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_015061	CAC	2	6	2312390	2312395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_015061	GCT	2	6	2312408	2312413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_015061	GTT	2	6	2312467	2312472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015061	GTT	2	6	2312515	2312520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_015061	TTG	2	6	2314453	2314458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_015061	T	6	6	2314482	2314487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_015061	CTG	2	6	2315811	2315816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_015061	TTC	2	6	2315830	2315835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_015061	CTC	2	6	2318740	2318745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5635	NC_015061	GAG	2	6	2318760	2318765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5637	NC_015061	AGA	2	6	2321119	2321124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5646	NC_015061	GA	3	6	2322797	2322802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5647	NC_015061	T	6	6	2323517	2323522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5648	NC_015061	ATGG	2	8	2323533	2323540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5655	NC_015061	TGT	2	6	2324098	2324103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_015061	TG	3	6	2324131	2324136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5657	NC_015061	T	6	6	2324152	2324157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5769	NC_015061	GCGG	2	8	2392358	2392365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5895	NC_015061	A	6	6	2451880	2451885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_015061	T	7	7	2451902	2451908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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