MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 10450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014834	GCT	2	6	35	40	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014834	CGC	2	6	113	118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014834	GCC	4	12	1584	1595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014834	CAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014834	CGG	3	9	1640	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014834	CCT	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014834	CAT	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014834	TCA	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014834	GCC	2	6	4266	4271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014834	GCC	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014834	GCG	2	6	6949	6954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014834	GTC	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014834	ATC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014834	GCG	3	9	12840	12848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014834	CGG	2	6	12868	12873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014834	AAC	2	6	13000	13005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014834	AAC	2	6	14194	14199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014834	TGA	2	6	14231	14236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014834	AAC	2	6	14247	14252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014834	TGC	2	6	14297	14302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014834	TCG	2	6	14324	14329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014834	TTC	2	6	14886	14891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014834	CAG	2	6	14996	15001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014834	CGC	2	6	15002	15007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014834	GCC	2	6	15038	15043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014834	AGC	2	6	15044	15049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014834	CTC	2	6	15108	15113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014834	AGG	2	6	15118	15123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014834	GCC	2	6	15176	15181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014834	GGC	2	6	15392	15397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014834	CTT	2	6	15399	15404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014834	CGA	2	6	15498	15503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014834	AGC	2	6	15523	15528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014834	GCG	2	6	20277	20282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014834	CGC	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014834	CGG	2	6	23758	23763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014834	GCG	2	6	23920	23925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014834	CGG	2	6	23934	23939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014834	CGG	2	6	23951	23956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014834	CGC	2	6	23959	23964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014834	CGT	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014834	CTC	2	6	24864	24869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014834	TCC	2	6	25503	25508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014834	CGC	2	6	25629	25634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014834	TCG	2	6	26460	26465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014834	CCT	2	6	26472	26477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014834	GAC	2	6	26484	26489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014834	TCC	2	6	27387	27392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014834	CTC	2	6	27393	27398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014834	CTG	2	6	27508	27513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014834	GCG	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014834	AGC	2	6	30955	30960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014834	GGC	2	6	30966	30971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014834	GGA	2	6	30973	30978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014834	TGC	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014834	GCC	2	6	31018	31023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014834	GGC	2	6	31030	31035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014834	TCT	2	6	33983	33988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014834	TCG	2	6	34178	34183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014834	TGC	2	6	35986	35991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014834	GCT	2	6	36207	36212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014834	CAG	2	6	37615	37620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014834	GAG	2	6	37621	37626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014834	CGC	2	6	37630	37635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014834	CGA	2	6	37708	37713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014834	GAA	2	6	37737	37742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014834	CGG	2	6	38022	38027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014834	TCC	2	6	38029	38034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014834	TTG	2	6	39551	39556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014834	TCG	2	6	39576	39581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014834	TCG	2	6	39586	39591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014834	CAC	2	6	39646	39651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014834	ACC	2	6	39816	39821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014834	GCC	2	6	39851	39856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014834	GTT	2	6	43755	43760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014834	ACG	2	6	43782	43787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014834	TCG	2	6	43800	43805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014834	ATC	2	6	44465	44470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014834	ATC	2	6	44481	44486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014834	GAT	2	6	46222	46227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014834	GCG	3	9	46507	46515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014834	CGA	2	6	46609	46614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014834	GGC	2	6	46672	46677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014834	GCA	2	6	46700	46705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014834	CGG	2	6	46749	46754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014834	GCT	2	6	47388	47393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014834	GAA	2	6	47498	47503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014834	CGC	2	6	47550	47555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014834	GAC	2	6	47601	47606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014834	GTT	2	6	47643	47648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014834	TGC	2	6	50362	50367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014834	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014834	GAC	2	6	50445	50450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014834	GCG	2	6	51305	51310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014834	CGC	2	6	51319	51324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014834	GCC	2	6	52622	52627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014834	GGC	2	6	52660	52665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014834	CTC	2	6	53397	53402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014834	GGC	2	6	53493	53498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014834	CGG	3	9	53502	53510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014834	AGC	2	6	53563	53568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014834	CGG	2	6	53574	53579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014834	CGA	2	6	54995	55000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014834	CGG	2	6	55002	55007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014834	TGG	2	6	55169	55174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014834	TAC	2	6	56205	56210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014834	GCC	3	9	56227	56235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014834	GCC	3	9	56241	56249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014834	CCG	2	6	58723	58728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014834	CGG	2	6	58734	58739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014834	GCC	2	6	58760	58765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014834	GCA	2	6	58896	58901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014834	CGA	2	6	59387	59392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014834	TCG	2	6	59464	59469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014834	GCG	2	6	59471	59476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014834	GTC	2	6	59480	59485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014834	CGC	2	6	59524	59529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014834	TGA	2	6	59549	59554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014834	CTC	2	6	59927	59932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014834	AAG	2	6	60504	60509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014834	GCT	2	6	63375	63380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014834	AGC	2	6	64908	64913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014834	GCG	2	6	64997	65002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014834	CGC	2	6	65011	65016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014834	GCG	2	6	65044	65049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014834	GTG	2	6	66462	66467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014834	CCG	2	6	66486	66491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014834	GCG	2	6	66552	66557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014834	CGC	2	6	66569	66574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014834	CGA	2	6	66600	66605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014834	CGC	2	6	67066	67071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014834	ACC	2	6	67147	67152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014834	CGG	2	6	69224	69229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014834	ACC	2	6	69265	69270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014834	TCG	2	6	69279	69284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014834	CGC	2	6	69293	69298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014834	CGC	2	6	70078	70083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014834	CTG	2	6	70092	70097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014834	TGC	2	6	70155	70160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_014834	GCC	2	6	173729	173734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_014834	CAT	2	6	173744	173749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_014834	GCC	2	6	179866	179871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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