MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014834	GCTG	2	8	524210	524217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_014834	G	6	6	524237	524242	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014834	TC	3	6	525896	525901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_014834	AG	3	6	525903	525908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014834	AG	3	6	525911	525916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014834	TA	3	6	525957	525962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014834	TCG	2	6	528613	528618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_014834	CAT	2	6	528690	528695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_014834	GTCC	2	8	528745	528752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_014834	GCA	2	6	529911	529916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014834	GGTT	2	8	532458	532465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014834	GGTGC	2	10	532513	532522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_014834	TCG	2	6	532539	532544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_014834	CTC	2	6	532550	532555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_014834	CGA	2	6	533785	533790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014834	TGC	2	6	533794	533799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_014834	TGC	2	6	534231	534236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_014834	AAC	2	6	534291	534296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014834	GGA	2	6	534315	534320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014834	TGCGGA	2	12	537766	537777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1521	NC_014834	CCAG	2	8	537794	537801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_014834	CCA	2	6	537816	537821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_014834	CCA	3	9	537900	537908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_014834	CAT	2	6	537913	537918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014834	CAC	2	6	537919	537924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_014834	ATC	3	9	537929	537937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_014834	TCA	3	9	537954	537962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_014834	TCA	2	6	537966	537971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014834	GCA	2	6	538004	538009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014834	CGG	3	9	538017	538025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014834	CAT	2	6	546274	546279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_014834	GAT	2	6	546307	546312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014834	GCG	2	6	546417	546422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014834	GCT	2	6	546463	546468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_014834	ATC	2	6	549291	549296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014834	TCG	2	6	550164	550169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_014834	CCG	2	6	550210	550215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_014834	CAA	2	6	552155	552160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_014834	GGC	2	6	552687	552692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_014834	CGC	2	6	555925	555930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_014834	CTA	2	6	555986	555991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_014834	CG	3	6	556011	556016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_014834	GCT	2	6	556028	556033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_014834	CG	3	6	556074	556079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_014834	CGC	2	6	557321	557326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_014834	CAT	2	6	562667	562672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_014834	CTGCC	2	10	562690	562699	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1548	NC_014834	TCGA	2	8	562704	562711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_014834	CGG	2	6	562750	562755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_014834	GTC	2	6	562800	562805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014834	GCGAA	2	10	562825	562834	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_014834	TG	3	6	562921	562926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014834	GCCT	2	8	566565	566572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_014834	CTC	2	6	566580	566585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_014834	GC	3	6	566586	566591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_014834	TCC	2	6	567609	567614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_014834	GTG	2	6	567647	567652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014834	CGC	2	6	567707	567712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_014834	GCGCG	2	10	567750	567759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_014834	CGG	2	6	567786	567791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_014834	CAG	2	6	567818	567823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014834	GCC	2	6	567843	567848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_014834	TCG	2	6	567850	567855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_014834	TGATCC	2	12	568583	568594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014834	TCT	2	6	569692	569697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014834	CCT	2	6	569711	569716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_014834	AGCGC	2	10	569737	569746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_014834	TAC	2	6	572878	572883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014834	CGC	2	6	572890	572895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_014834	C	6	6	572941	572946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_014834	CGC	2	6	572959	572964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_014834	CGA	2	6	573146	573151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_014834	AT	3	6	574196	574201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014834	TGA	2	6	574227	574232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1576	NC_014834	GCG	2	6	576127	576132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014834	CGG	2	6	576146	576151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_014834	CGC	2	6	576165	576170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_014834	ATG	2	6	576198	576203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014834	GTC	2	6	576427	576432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_014834	GC	3	6	577885	577890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_014834	TCTT	2	8	577891	577898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_014834	GCGCAG	2	12	577928	577939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_014834	CAG	2	6	577973	577978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_014834	GCA	2	6	578010	578015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_014834	TGC	2	6	578017	578022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_014834	GC	3	6	578021	578026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_014834	TGT	2	6	580971	580976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014834	CG	3	6	581066	581071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_014834	GCT	2	6	581104	581109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_014834	CG	3	6	581121	581126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_014834	CCCGA	2	10	581134	581143	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1595	NC_014834	GGC	2	6	581150	581155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1598	NC_014834	GTCC	2	8	582277	582284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_014834	CG	3	6	585074	585079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_014834	CGGC	2	8	585129	585136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_014834	CAA	2	6	585182	585187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_014834	TCA	2	6	586469	586474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014834	CGC	2	6	586491	586496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_014834	GCG	2	6	586500	586505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_014834	CG	3	6	586553	586558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_014834	TCC	2	6	589313	589318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_014834	GATAA	2	10	589806	589815	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014834	GCTT	2	8	589816	589823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_014834	ATT	2	6	589824	589829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014834	GCC	2	6	589889	589894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_014834	GACC	2	8	589905	589912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_014834	CGT	2	6	589913	589918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_014834	GGCC	2	8	589944	589951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_014834	CTC	2	6	589964	589969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_014834	GAG	2	6	590502	590507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014834	GC	3	6	590512	590517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_014834	CCGC	2	8	590574	590581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1619	NC_014834	GTC	2	6	590613	590618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_014834	GAC	2	6	592950	592955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_014834	GTGGC	2	10	593013	593022	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_014834	CGG	2	6	593023	593028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_014834	CGTT	2	8	593051	593058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_014834	GCG	2	6	593085	593090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014834	GCA	2	6	593125	593130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_014834	GCA	3	9	593137	593145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_014834	GCG	2	6	593151	593156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_014834	GACGC	2	10	593162	593171	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_014834	CTG	2	6	593392	593397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_014834	CCG	2	6	595080	595085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_014834	GCC	2	6	595530	595535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_014834	TCA	2	6	596502	596507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_014834	GCC	2	6	596545	596550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1771	NC_014834	AGG	2	6	654977	654982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1899	NC_014834	GC	3	6	701067	701072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1900	NC_014834	CGT	2	6	701175	701180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1902	NC_014834	TG	3	6	701198	701203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_014834	GCG	2	6	701211	701216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1904	NC_014834	CGA	2	6	701217	701222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_014834	GCTC	2	8	701228	701235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1932	NC_014834	CGG	2	6	712115	712120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1933	NC_014834	GTCG	2	8	712122	712129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1934	NC_014834	CGG	2	6	712179	712184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1936	NC_014834	GCG	2	6	712273	712278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_014834	CGA	2	6	712545	712550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_014834	GCG	2	6	712568	712573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_014834	GCC	2	6	712680	712685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1945	NC_014834	CCG	2	6	712701	712706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1955	NC_014834	TCGCG	2	10	713125	713134	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1957	NC_014834	CCG	2	6	713355	713360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2000	NC_014834	CCGG	2	8	726283	726290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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