MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014834	AAC	2	6	369442	369447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014834	GAG	2	6	369522	369527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014834	GC	3	6	369528	369533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_014834	CTC	2	6	369570	369575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_014834	TCA	2	6	369633	369638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014834	GTC	2	6	369690	369695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014834	TCA	2	6	369753	369758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014834	AGGACG	2	12	370777	370788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1009	NC_014834	TCAA	2	8	370813	370820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_014834	AGA	2	6	375124	375129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014834	CGGC	2	8	375130	375137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_014834	CG	4	8	375213	375220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014834	GC	3	6	375223	375228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014834	CGG	2	6	375277	375282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014834	CGC	2	6	375300	375305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_014834	C	6	6	376995	377000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1017	NC_014834	AAG	2	6	377026	377031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014834	CCCG	2	8	377081	377088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1019	NC_014834	CGT	2	6	377097	377102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014834	CAT	2	6	378415	378420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014834	GGC	2	6	378421	378426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014834	CTG	2	6	378471	378476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014834	CG	3	6	378491	378496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_014834	GC	3	6	378507	378512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_014834	GCG	2	6	378524	378529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014834	GAC	2	6	378538	378543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014834	CGG	2	6	380591	380596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014834	CCA	2	6	385940	385945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_014834	GGC	2	6	385984	385989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014834	CGC	2	6	386795	386800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_014834	TCGA	2	8	386809	386816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_014834	CTG	2	6	386854	386859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014834	CGGC	2	8	386931	386938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_014834	CGC	2	6	386939	386944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_014834	GGT	2	6	387047	387052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014834	GCC	2	6	387113	387118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_014834	GCCAAC	2	12	387232	387243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_014834	GTC	2	6	387268	387273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014834	GAT	2	6	387295	387300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014834	CGC	2	6	387306	387311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_014834	TTC	2	6	387447	387452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014834	ACC	2	6	387460	387465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_014834	CGGC	2	8	387476	387483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_014834	ATC	2	6	387489	387494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014834	AC	3	6	387501	387506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_014834	CGGC	2	8	387545	387552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_014834	CGC	2	6	387587	387592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014834	GCA	2	6	387649	387654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014834	CGC	2	6	387688	387693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_014834	ATG	2	6	387702	387707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014834	CCA	2	6	387781	387786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_014834	CGC	2	6	387969	387974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_014834	CG	3	6	388031	388036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014834	TGG	2	6	388048	388053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014834	CTG	2	6	388071	388076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014834	GCC	3	9	388080	388088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_014834	AAG	2	6	388098	388103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014834	AAAAC	2	10	388175	388184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_014834	CCG	2	6	388186	388191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_014834	GCG	2	6	388294	388299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014834	CGC	2	6	388310	388315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_014834	TGT	2	6	389774	389779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014834	CCGA	2	8	390170	390177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014834	CG	3	6	390453	390458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_014834	TCGCG	2	10	390464	390473	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_014834	CCG	2	6	390864	390869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_014834	TGCTC	2	10	390876	390885	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_014834	GCA	2	6	390906	390911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014834	GC	4	8	390912	390919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_014834	GGA	2	6	390944	390949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014834	GCCGC	2	10	390953	390962	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1072	NC_014834	GTT	2	6	391920	391925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014834	CGCGG	2	10	393195	393204	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_014834	CGC	2	6	393219	393224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014834	CCG	2	6	393227	393232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_014834	GCGA	2	8	393288	393295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_014834	GTGCT	2	10	393299	393308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_014834	AAC	2	6	393538	393543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014834	GGCT	2	8	393545	393552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_014834	CGG	2	6	393575	393580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014834	CG	5	10	393587	393596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_014834	GCG	2	6	393602	393607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014834	GCT	2	6	395247	395252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014834	CGGCGC	2	12	395351	395362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_014834	CGG	2	6	395368	395373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014834	GTCG	2	8	395398	395405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_014834	A	6	6	395445	395450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014834	GC	3	6	395529	395534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_014834	TAC	2	6	395660	395665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014834	GTC	2	6	395704	395709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014834	CTGG	2	8	395784	395791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_014834	AGCC	2	8	395849	395856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_014834	CGC	2	6	398493	398498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_014834	GT	3	6	398551	398556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014834	GCCA	2	8	401585	401592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_014834	GGC	2	6	401594	401599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014834	GTT	3	9	402515	402523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014834	GTT	2	6	402608	402613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014834	CGT	2	6	402614	402619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014834	GTT	2	6	403757	403762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014834	TCGG	2	8	404384	404391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_014834	CGG	2	6	404476	404481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014834	CG	3	6	404532	404537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_014834	CGG	2	6	404552	404557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014834	TCG	2	6	407202	407207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_014834	AGC	2	6	407268	407273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014834	GCC	2	6	407287	407292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_014834	GCCTCG	2	12	407344	407355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_014834	CTC	2	6	407367	407372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_014834	CT	3	6	407392	407397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_014834	CGC	2	6	409159	409164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_014834	GT	3	6	409166	409171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014834	GGC	2	6	410317	410322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014834	GCC	2	6	410387	410392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_014834	CG	3	6	411325	411330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_014834	TCG	2	6	411432	411437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014834	CGG	2	6	411452	411457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014834	GC	3	6	411504	411509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_014834	CCG	2	6	411537	411542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_014834	CGA	3	9	411557	411565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014834	GCC	2	6	411627	411632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_014834	CCGA	2	8	411634	411641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_014834	CGG	2	6	411653	411658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014834	CCG	2	6	411693	411698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_014834	TCA	2	6	411710	411715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_014834	CG	3	6	411787	411792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_014834	CGTTAA	2	12	411993	412004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1128	NC_014834	GTT	2	6	412015	412020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014834	GCC	2	6	412045	412050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_014834	GAA	2	6	412058	412063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014834	CGA	2	6	412914	412919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014834	TCG	2	6	412995	413000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014834	CGGG	2	8	413016	413023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_014834	CGT	2	6	413037	413042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014834	GCG	2	6	413080	413085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_014834	GGCC	2	8	413088	413095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1268	NC_014834	ATG	2	6	451495	451500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_014834	GCG	2	6	451510	451515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_014834	CGCGA	2	10	499544	499553	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1408	NC_014834	GCG	2	6	499559	499564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_014834	CAA	2	6	499652	499657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_014834	GC	5	10	499691	499700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_014834	GCC	2	6	499728	499733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_014834	CGT	2	6	499800	499805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_014834	T	6	6	499814	499819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_014834	AAG	2	6	499838	499843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_014834	GGATC	2	10	502062	502071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1416	NC_014834	CGAC	2	8	502991	502998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_014834	GAG	2	6	504485	504490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_014834	CAT	2	6	504525	504530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_014834	CG	3	6	504545	504550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1420	NC_014834	CG	3	6	504555	504560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1421	NC_014834	CTC	2	6	504561	504566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1423	NC_014834	TCGC	2	8	505171	505178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_014834	CG	3	6	506736	506741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1425	NC_014834	CGG	2	6	506748	506753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_014834	CCG	2	6	506761	506766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1427	NC_014834	CGC	2	6	507953	507958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1428	NC_014834	GCC	2	6	507966	507971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1429	NC_014834	TGC	2	6	507983	507988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_014834	GTC	2	6	508009	508014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_014834	GGT	2	6	508561	508566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_014834	CGA	2	6	509835	509840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_014834	CGG	2	6	509851	509856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_014834	TCGC	2	8	509866	509873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_014834	GCA	2	6	509892	509897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_014834	GCC	2	6	509934	509939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1438	NC_014834	GCC	2	6	509957	509962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_014834	GC	3	6	509989	509994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1440	NC_014834	TCG	2	6	510003	510008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_014834	GCC	2	6	510011	510016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_014834	CAA	2	6	510043	510048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_014834	GGCC	2	8	510114	510121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_014834	CCGA	2	8	510150	510157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1445	NC_014834	CTC	2	6	513468	513473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1446	NC_014834	CGT	2	6	513488	513493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_014834	C	6	6	513505	513510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1449	NC_014834	GTC	2	6	513827	513832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1450	NC_014834	CCTTT	2	10	514016	514025	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1451	NC_014834	GCC	2	6	514120	514125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1452	NC_014834	GCGCC	2	10	514163	514172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1453	NC_014834	CGG	2	6	514833	514838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_014834	CGG	2	6	514841	514846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_014834	GCT	2	6	516620	516625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1469	NC_014834	GCG	2	6	519296	519301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1481	NC_014834	ATC	2	6	521991	521996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1483	NC_014834	CTG	2	6	522014	522019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_014834	CGG	3	9	522646	522654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1488	NC_014834	CGGAGC	2	12	522668	522679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1490	NC_014834	G	6	6	522727	522732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_014834	CG	3	6	523911	523916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1492	NC_014834	GCG	2	6	523920	523925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1493	NC_014834	GA	3	6	523951	523956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1494	NC_014834	CCG	2	6	523960	523965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1499	NC_014834	TTC	2	6	524157	524162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_014834	GAT	2	6	524188	524193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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