MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014834	GCG	2	6	213444	213449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014834	GCA	2	6	213459	213464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014834	GGC	2	6	213485	213490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014834	TGTT	2	8	213505	213512	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014834	CGG	2	6	213534	213539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014834	CG	3	6	213601	213606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_014834	CGGC	2	8	213613	213620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_014834	GCCGTT	2	12	213621	213632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014834	GGA	2	6	213635	213640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014834	CCCG	2	8	214394	214401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
511	NC_014834	AGC	2	6	214436	214441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014834	GGT	2	6	214451	214456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014834	TTC	2	6	214558	214563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014834	CA	3	6	214833	214838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_014834	CAACA	2	10	217624	217633	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
516	NC_014834	CGC	2	6	217652	217657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_014834	CCCGCG	2	12	217666	217677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_014834	CCA	2	6	217729	217734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_014834	GAA	2	6	217746	217751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014834	TG	3	6	220041	220046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014834	CTGC	2	8	220144	220151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_014834	GAA	2	6	220159	220164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014834	GGC	2	6	220170	220175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014834	CGA	2	6	220256	220261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014834	GCC	2	6	220265	220270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_014834	CTG	2	6	220291	220296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014834	CTC	2	6	220332	220337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014834	CTG	2	6	220355	220360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014834	GCC	3	9	220361	220369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_014834	AAAAC	2	10	220456	220465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_014834	CCG	2	6	220467	220472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_014834	GCC	2	6	220550	220555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_014834	GCAG	2	8	221511	221518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_014834	CAGC	2	8	221533	221540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_014834	GCA	2	6	221589	221594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_014834	CGC	3	9	221611	221619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_014834	CGT	2	6	221650	221655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014834	GC	3	6	221684	221689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_014834	CCG	2	6	221700	221705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_014834	CGG	2	6	221741	221746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014834	TCG	2	6	222654	222659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014834	GTGGA	2	10	222726	222735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014834	CGC	2	6	223143	223148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_014834	CAAA	2	8	223166	223173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_014834	CCG	2	6	223178	223183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_014834	CGG	2	6	223188	223193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014834	TCG	2	6	223197	223202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014834	GC	3	6	223216	223221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_014834	GCGG	2	8	224163	224170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
550	NC_014834	CGT	2	6	224290	224295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014834	CGC	2	6	224301	224306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_014834	AAC	2	6	224307	224312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014834	CGC	2	6	224342	224347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_014834	TTG	2	6	225757	225762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014834	CG	3	6	225825	225830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_014834	GCG	3	9	225897	225905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014834	GGTT	2	8	228071	228078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014834	GAT	2	6	228102	228107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014834	TTG	2	6	228122	228127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014834	GGA	2	6	228210	228215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014834	GA	3	6	228233	228238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014834	GGC	2	6	229153	229158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014834	A	6	6	230229	230234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014834	CG	3	6	230319	230324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_014834	GGC	2	6	230350	230355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014834	CGG	2	6	230438	230443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014834	ACTC	2	8	230518	230525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_014834	CCG	3	9	230535	230543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_014834	CGG	2	6	230567	230572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014834	CCCCG	2	10	230607	230616	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
571	NC_014834	ATCG	2	8	230637	230644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_014834	GTG	2	6	230732	230737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014834	ATG	2	6	230825	230830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014834	CGG	2	6	230856	230861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014834	CCA	2	6	230887	230892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014834	GATG	2	8	231424	231431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014834	GAA	2	6	231568	231573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014834	GGAC	2	8	231581	231588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_014834	CCG	2	6	231852	231857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_014834	TTA	2	6	231878	231883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014834	TTC	2	6	231965	231970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_014834	ACT	2	6	231980	231985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014834	GAA	2	6	232012	232017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014834	CGG	2	6	232042	232047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014834	CTT	2	6	232069	232074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014834	GATC	2	8	232080	232087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_014834	AAG	2	6	232109	232114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014834	CGT	2	6	232135	232140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014834	TGC	2	6	232164	232169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_014834	CG	3	6	232262	232267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_014834	CAA	2	6	232268	232273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014834	CCTC	2	8	232279	232286	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
593	NC_014834	GTC	2	6	232303	232308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_014834	GGTC	2	8	232309	232316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_014834	ACA	2	6	232442	232447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_014834	CCA	2	6	235058	235063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014834	CAC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_014834	GC	3	6	235140	235145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_014834	TGAACC	2	12	235167	235178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_014834	GCC	2	6	235216	235221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_014834	GC	3	6	236474	236479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_014834	CCG	2	6	236495	236500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_014834	TCA	2	6	236547	236552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014834	TGC	2	6	236556	236561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014834	CCT	2	6	237501	237506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_014834	TTCGC	2	10	237525	237534	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
607	NC_014834	GAG	2	6	237541	237546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014834	TTGCGC	2	12	238600	238611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014834	GATC	2	8	238613	238620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_014834	AGCGG	2	10	238623	238632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
611	NC_014834	CCCT	2	8	238862	238869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
612	NC_014834	GCT	2	6	238876	238881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014834	GCG	2	6	238882	238887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_014834	CGT	2	6	238927	238932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_014834	TCGG	2	8	238958	238965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_014834	CT	3	6	238972	238977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_014834	CCGG	2	8	238995	239002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_014834	AGCA	2	8	239018	239025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_014834	GAG	2	6	239026	239031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014834	CAA	2	6	239887	239892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014834	CGT	2	6	240766	240771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014834	GAG	2	6	240775	240780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014834	CGA	2	6	240822	240827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014834	GC	3	6	240855	240860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_014834	TTG	2	6	240886	240891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014834	ACG	2	6	240909	240914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014834	GCT	2	6	240978	240983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014834	GCGCA	2	10	242358	242367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
629	NC_014834	TCG	2	6	242375	242380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014834	GTG	2	6	242388	242393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014834	CGAC	2	8	242401	242408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_014834	GCG	3	9	242429	242437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014834	CGCCA	2	10	242469	242478	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
634	NC_014834	CCCGC	2	10	242489	242498	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
635	NC_014834	CTC	2	6	242508	242513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_014834	GC	3	6	242530	242535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_014834	CG	3	6	243496	243501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_014834	CG	3	6	243510	243515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_014834	GGC	2	6	243562	243567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014834	GGC	2	6	245900	245905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014834	CGT	2	6	245965	245970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014834	CG	3	6	245975	245980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_014834	TGC	2	6	246002	246007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_014834	CGG	2	6	246036	246041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_014834	CGT	2	6	246096	246101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_014834	TCG	2	6	246115	246120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_014834	CTCTT	2	10	248883	248892	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
648	NC_014834	GATCGC	2	12	248914	248925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_014834	CGG	2	6	249801	249806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_014834	GCC	2	6	249877	249882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_014834	CAT	2	6	249897	249902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_014834	CCG	2	6	250694	250699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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656	NC_014834	GGC	3	9	251037	251045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_014834	TC	3	6	252237	252242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
660	NC_014834	TC	3	6	252286	252291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
661	NC_014834	GC	3	6	252330	252335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
662	NC_014834	GAC	2	6	252344	252349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_014834	GCA	2	6	253242	253247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_014834	GCCG	2	8	253257	253264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
666	NC_014834	GCCG	2	8	253273	253280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
667	NC_014834	GCC	2	6	253287	253292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_014834	CT	3	6	253315	253320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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670	NC_014834	GCA	2	6	256323	256328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_014834	TCC	2	6	256339	256344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_014834	GCG	2	6	256395	256400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_014834	GCAG	2	8	256413	256420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
674	NC_014834	AGGC	2	8	256443	256450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
675	NC_014834	T	6	6	256475	256480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_014834	GCC	2	6	258786	258791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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682	NC_014834	GC	4	8	260632	260639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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688	NC_014834	GTA	2	6	261978	261983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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692	NC_014834	GCC	2	6	267389	267394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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694	NC_014834	GCG	2	6	267463	267468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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714	NC_014834	CGC	2	6	274103	274108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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716	NC_014834	CCG	2	6	274119	274124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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721	NC_014834	AGA	2	6	279722	279727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
722	NC_014834	GAA	2	6	279754	279759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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724	NC_014834	CGAT	2	8	279767	279774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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732	NC_014834	TCG	2	6	282026	282031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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743	NC_014834	CG	3	6	286332	286337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
744	NC_014834	GTC	2	6	287229	287234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_014834	CCA	2	6	288234	288239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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757	NC_014834	GTG	2	6	288502	288507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_014834	GA	3	6	289985	289990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
763	NC_014834	GAA	2	6	290028	290033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_014834	GGACA	2	10	290042	290051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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769	NC_014834	TC	3	6	291546	291551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
770	NC_014834	TCG	2	6	291567	291572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_014834	CGA	2	6	293085	293090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_014834	GCG	2	6	293109	293114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_014834	CG	3	6	293137	293142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
774	NC_014834	GCA	2	6	293155	293160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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