MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014834	GC	3	6	1579328	1579333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_014834	AGC	2	6	1579339	1579344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014834	GCG	2	6	1579425	1579430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014834	TG	3	6	1580367	1580372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014834	CAACGA	2	12	1580385	1580396	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_014834	CG	3	6	1582303	1582308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_014834	CGG	2	6	1582329	1582334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_014834	GC	3	6	1582425	1582430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_014834	CG	3	6	1583988	1583993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_014834	TC	3	6	1584460	1584465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_014834	GCA	2	6	1584504	1584509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014834	CGG	2	6	1584561	1584566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_014834	GCG	2	6	1584713	1584718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_014834	GCG	2	6	1584733	1584738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014834	TCG	2	6	1585022	1585027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014834	GGT	2	6	1585054	1585059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014834	T	6	6	1585074	1585079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014834	GAT	2	6	1585092	1585097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014834	GCG	2	6	1585100	1585105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_014834	GACT	2	8	1585143	1585150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_014834	TTCG	2	8	1585159	1585166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_014834	ATT	2	6	1586155	1586160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014834	GGC	2	6	1586215	1586220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_014834	GCC	2	6	1586267	1586272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_014834	GGC	2	6	1586284	1586289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_014834	CGAG	2	8	1586777	1586784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_014834	CCG	2	6	1586785	1586790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014834	AC	3	6	1588146	1588151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_014834	GTCG	2	8	1588203	1588210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_014834	CGC	2	6	1588235	1588240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_014834	AGA	2	6	1588242	1588247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014834	CGGC	2	8	1589449	1589456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_014834	CGC	2	6	1589495	1589500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_014834	G	6	6	1589549	1589554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014834	AGT	2	6	1589556	1589561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014834	CGA	2	6	1589589	1589594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014834	CAA	2	6	1589611	1589616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_014834	GC	3	6	1589637	1589642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_014834	GAT	2	6	1589657	1589662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014834	CCG	2	6	1589683	1589688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_014834	GAG	2	6	1592682	1592687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_014834	CGA	2	6	1592693	1592698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_014834	GCTTC	2	10	1592734	1592743	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4544	NC_014834	CGG	2	6	1594388	1594393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_014834	TCA	2	6	1594433	1594438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_014834	C	6	6	1594495	1594500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4547	NC_014834	TC	3	6	1594522	1594527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_014834	TAGG	3	12	1594545	1594556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014834	CCG	2	6	1594640	1594645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_014834	AAC	2	6	1594653	1594658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_014834	GC	4	8	1594684	1594691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_014834	CGG	2	6	1594731	1594736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_014834	GCGA	2	8	1598225	1598232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_014834	TCGG	2	8	1598253	1598260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_014834	TGC	2	6	1598300	1598305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_014834	ACGA	2	8	1598321	1598328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_014834	GA	3	6	1598327	1598332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014834	ACCGGA	2	12	1598339	1598350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014834	ATCA	2	8	1600141	1600148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_014834	G	6	6	1600160	1600165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014834	CGA	2	6	1600166	1600171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_014834	TCG	2	6	1600183	1600188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_014834	GC	4	8	1600239	1600246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_014834	GCG	2	6	1600250	1600255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_014834	TCC	2	6	1606050	1606055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_014834	CGG	3	9	1606150	1606158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014834	CCG	2	6	1607026	1607031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_014834	CGA	2	6	1607080	1607085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_014834	ACG	2	6	1607093	1607098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_014834	GCC	2	6	1607573	1607578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_014834	CTT	2	6	1608877	1608882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_014834	GCG	2	6	1608965	1608970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_014834	CAC	2	6	1609030	1609035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_014834	CGGC	2	8	1609038	1609045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_014834	GGGC	2	8	1609054	1609061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4576	NC_014834	CCGG	2	8	1609094	1609101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_014834	CGC	2	6	1609130	1609135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_014834	GCG	2	6	1609153	1609158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_014834	GCC	2	6	1609159	1609164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_014834	GCCC	2	8	1609173	1609180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4581	NC_014834	TCC	2	6	1609198	1609203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_014834	CGC	2	6	1609206	1609211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_014834	GCG	2	6	1610497	1610502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_014834	CGC	2	6	1610506	1610511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_014834	GGA	2	6	1610939	1610944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_014834	GC	3	6	1610946	1610951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_014834	GAG	2	6	1611476	1611481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_014834	GCC	2	6	1612059	1612064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_014834	AGCG	2	8	1612906	1612913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_014834	TCGCT	2	10	1612966	1612975	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4591	NC_014834	T	6	6	1613102	1613107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_014834	TGC	2	6	1613128	1613133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_014834	GCTGTC	2	12	1613163	1613174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_014834	CTT	2	6	1613213	1613218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014834	GCG	2	6	1613230	1613235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_014834	GCT	2	6	1613308	1613313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_014834	CAG	2	6	1613396	1613401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_014834	GCCG	2	8	1613473	1613480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_014834	TCG	2	6	1613507	1613512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_014834	CG	3	6	1613524	1613529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_014834	TCA	2	6	1613558	1613563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014834	CCT	2	6	1613591	1613596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_014834	GC	3	6	1613661	1613666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_014834	GGC	2	6	1613670	1613675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_014834	GTC	2	6	1613701	1613706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_014834	GGC	2	6	1613707	1613712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_014834	CGC	2	6	1613718	1613723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_014834	CAA	3	9	1613749	1613757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014834	TAT	2	6	1614626	1614631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014834	CGGC	2	8	1614634	1614641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_014834	GAGCG	2	10	1614682	1614691	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4612	NC_014834	GCA	2	6	1615948	1615953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_014834	GGC	2	6	1615976	1615981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_014834	TGTT	2	8	1616058	1616065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014834	AT	3	6	1616789	1616794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014834	GAC	2	6	1616817	1616822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014834	CGC	2	6	1616825	1616830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_014834	GGA	2	6	1616841	1616846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014834	GCC	2	6	1616884	1616889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_014834	CGC	2	6	1616908	1616913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_014834	TCG	2	6	1617059	1617064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_014834	GCC	2	6	1617226	1617231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_014834	CGGC	2	8	1617236	1617243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_014834	GCC	2	6	1617651	1617656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_014834	CCGG	2	8	1617711	1617718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_014834	G	7	7	1617731	1617737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014834	TTCCTG	2	12	1617779	1617790	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_014834	CCG	2	6	1617806	1617811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_014834	CAC	2	6	1617837	1617842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_014834	GCG	2	6	1618652	1618657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_014834	GC	4	8	1618693	1618700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_014834	TCGC	2	8	1618750	1618757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_014834	ATC	2	6	1618818	1618823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_014834	CGA	2	6	1619353	1619358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_014834	GCG	2	6	1620100	1620105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_014834	GATT	2	8	1620141	1620148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_014834	GCT	2	6	1620162	1620167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4639	NC_014834	GT	3	6	1620289	1620294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_014834	CGT	2	6	1620317	1620322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4641	NC_014834	TGC	2	6	1620323	1620328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4642	NC_014834	A	6	6	1620366	1620371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4643	NC_014834	GC	3	6	1620400	1620405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4644	NC_014834	CGC	2	6	1621758	1621763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4645	NC_014834	G	9	9	1621816	1621824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4646	NC_014834	GC	3	6	1621880	1621885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4647	NC_014834	CTC	2	6	1621929	1621934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4648	NC_014834	CTT	2	6	1621956	1621961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4649	NC_014834	ACTTC	2	10	1622000	1622009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4650	NC_014834	CGC	2	6	1623409	1623414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4652	NC_014834	CAA	2	6	1623440	1623445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4653	NC_014834	AAT	2	6	1623575	1623580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4654	NC_014834	GCCG	2	8	1623593	1623600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4655	NC_014834	GT	3	6	1623610	1623615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4656	NC_014834	GCTG	2	8	1625402	1625409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4657	NC_014834	TCA	2	6	1626302	1626307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4662	NC_014834	CGCGG	2	10	1628035	1628044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4663	NC_014834	TTG	2	6	1628056	1628061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4664	NC_014834	GA	3	6	1628140	1628145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_014834	CG	3	6	1628895	1628900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4666	NC_014834	TCG	2	6	1628919	1628924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4668	NC_014834	GCG	2	6	1632221	1632226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4669	NC_014834	TCGCT	2	10	1632248	1632257	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4670	NC_014834	CTT	2	6	1632311	1632316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4674	NC_014834	GGTG	2	8	1632524	1632531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4675	NC_014834	GCGGG	2	10	1632555	1632564	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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4682	NC_014834	CTGG	2	8	1632744	1632751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4692	NC_014834	CG	3	6	1634638	1634643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4693	NC_014834	CGTT	2	8	1636429	1636436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4702	NC_014834	CAG	2	6	1641486	1641491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4730	NC_014834	CG	3	6	1653295	1653300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4731	NC_014834	CTCAA	2	10	1653308	1653317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4732	NC_014834	GCGA	2	8	1654570	1654577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4733	NC_014834	ACTGA	2	10	1654604	1654613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4746	NC_014834	CTCG	2	8	1658328	1658335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4747	NC_014834	GCC	2	6	1658368	1658373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4749	NC_014834	GAG	2	6	1658430	1658435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4750	NC_014834	GCA	2	6	1658456	1658461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4751	NC_014834	GCG	2	6	1658466	1658471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4752	NC_014834	ACG	2	6	1659747	1659752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_014834	CGG	2	6	1659863	1659868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_014834	AGTG	2	8	1659950	1659957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_014834	CCGG	2	8	1661898	1661905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4756	NC_014834	CGC	2	6	1661944	1661949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4757	NC_014834	GC	3	6	1661948	1661953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_014834	CG	3	6	1661954	1661959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4759	NC_014834	CG	4	8	1665151	1665158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4760	NC_014834	GCG	3	9	1665193	1665201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4761	NC_014834	GTC	2	6	1665205	1665210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4763	NC_014834	GC	3	6	1665274	1665279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4764	NC_014834	CG	4	8	1666624	1666631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4765	NC_014834	CGT	2	6	1667777	1667782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4766	NC_014834	CG	3	6	1667783	1667788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4767	NC_014834	AAG	2	6	1668167	1668172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4877	NC_014834	G	6	6	1713544	1713549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4878	NC_014834	CAA	2	6	1713552	1713557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4881	NC_014834	AAC	2	6	1715047	1715052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4882	NC_014834	GT	3	6	1715063	1715068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4883	NC_014834	TGACG	2	10	1715112	1715121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4893	NC_014834	CTGTC	2	10	1719006	1719015	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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