MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	AACAA	2	10	1797	1806	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014825	ACAAA	2	10	21722	21731	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014825	TATTG	2	10	23938	23947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014825	TCATA	2	10	24326	24335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014825	TATAT	2	10	24344	24353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014825	TAATT	2	10	32830	32839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014825	TATAT	2	10	42565	42574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014825	TATAT	2	10	53483	53492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014825	CCATA	2	10	53837	53846	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014825	AATAG	2	10	54194	54203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014825	GAACT	2	10	54320	54329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014825	ACAGG	2	10	54582	54591	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014825	CTGCC	2	10	57843	57852	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014825	TCCGC	2	10	58676	58685	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014825	TATGA	2	10	62380	62389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014825	TATCA	2	10	65291	65300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014825	ACCTA	2	10	69053	69062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014825	TTATT	2	10	84955	84964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014825	TAAAC	2	10	85513	85522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014825	AAAAG	2	10	92694	92703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014825	CTTTT	2	10	92720	92729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014825	TATAA	2	10	94657	94666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014825	CTATC	2	10	99044	99053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014825	TCTTT	2	10	101067	101076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014825	TAAGA	2	10	101084	101093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014825	AAGCA	2	10	101112	101121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014825	TGTTT	2	10	105537	105546	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014825	CGATC	2	10	115670	115679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014825	TCAGA	2	10	119742	119751	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014825	TTCGG	2	10	120174	120183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014825	TATAT	2	10	140606	140615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014825	AAACA	2	10	158981	158990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014825	TATAA	2	10	160203	160212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014825	AAGGA	2	10	160236	160245	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014825	TTGTT	2	10	160851	160860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014825	TTTTC	2	10	164644	164653	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014825	GCAAA	2	10	164898	164907	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014825	CAAGG	2	10	170389	170398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014825	ATGAA	2	10	177543	177552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014825	ATATA	2	10	177744	177753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014825	ACCGC	2	10	197746	197755	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014825	TCTAT	2	10	253917	253926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014825	AAACA	2	10	255246	255255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014825	TCTAT	2	10	263556	263565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014825	ATTAA	2	10	270752	270761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014825	ACAGC	2	10	270805	270814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014825	GCAGG	2	10	280346	280355	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014825	TACAG	2	10	301489	301498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014825	TCATA	2	10	303495	303504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014825	CAAAA	2	10	305259	305268	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014825	AACGT	2	10	305424	305433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014825	ACGGA	2	10	306632	306641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014825	TTATA	2	10	313276	313285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014825	GGTAT	2	10	326600	326609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014825	TAAAA	2	10	341636	341645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014825	TTATA	2	10	342378	342387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014825	CAGCA	2	10	344391	344400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014825	ATATT	2	10	344444	344453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014825	TATAA	2	10	345053	345062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014825	ACTAT	2	10	347369	347378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014825	CTTAA	2	10	348502	348511	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.