MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014824	TATT	2	8	20067	20074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014824	TTAT	2	8	31173	31180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014824	AAAT	2	8	31356	31363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014824	AGGA	2	8	33866	33873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014824	TACA	2	8	36978	36985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014824	TTTA	2	8	38040	38047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014824	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014824	ATTT	2	8	45522	45529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014824	GTTT	2	8	55882	55889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014824	TATT	2	8	63808	63815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014824	TGAT	2	8	64582	64589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014824	AATA	2	8	64791	64798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014824	TATT	2	8	65386	65393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014824	GAAA	2	8	68996	69003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014824	TCGA	2	8	69055	69062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014824	ATAA	2	8	76319	76326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014824	ACAA	2	8	76536	76543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014824	ATTT	2	8	76778	76785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014824	ATTT	2	8	82698	82705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014824	CTCC	2	8	84175	84182	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014824	ACAA	2	8	84328	84335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014824	ATAC	2	8	84579	84586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014824	ATAC	2	8	84851	84858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014824	GATA	2	8	85443	85450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014824	GCTT	2	8	85806	85813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014824	AAAG	2	8	86605	86612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014824	TTAT	2	8	86796	86803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014824	AGAT	2	8	86831	86838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014824	TAGA	2	8	86917	86924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014824	AGTT	2	8	87443	87450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014824	ATGT	2	8	87971	87978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014824	GTAA	2	8	87985	87992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014824	CGTG	2	8	90695	90702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014824	GAAT	2	8	91009	91016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014824	CCAA	2	8	92813	92820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014824	AAAG	2	8	99680	99687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014824	TGTA	2	8	101371	101378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014824	TTCA	2	8	101669	101676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014824	CAGG	2	8	102064	102071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014824	TCCT	2	8	102597	102604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014824	CACC	2	8	102686	102693	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_014824	GGCT	2	8	103004	103011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014824	AAAG	2	8	103118	103125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014824	AAGA	2	8	103260	103267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014824	CAGA	2	8	103612	103619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014824	TCAT	2	8	105595	105602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014824	GTAT	2	8	105734	105741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014824	GCCT	2	8	107487	107494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014824	TTTA	2	8	109833	109840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014824	AGAC	2	8	110100	110107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014824	GCTT	2	8	110340	110347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014824	GGAA	2	8	111864	111871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014824	CAAA	2	8	113146	113153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014824	CTTC	2	8	113256	113263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014824	CTGC	2	8	113402	113409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014824	CTTA	2	8	113692	113699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014824	TCCT	2	8	114223	114230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014824	TTTG	2	8	114687	114694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014824	ATTT	2	8	114713	114720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014824	TGAT	2	8	115071	115078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014824	TAAA	2	8	115655	115662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014824	TGAT	2	8	115691	115698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014824	AAAT	2	8	115763	115770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014824	AATG	2	8	115771	115778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014824	CGGG	2	8	116000	116007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014824	ACCT	2	8	119699	119706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014824	AACG	2	8	120560	120567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014824	ATCG	2	8	122380	122387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014824	GCCA	2	8	125830	125837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014824	CCTC	2	8	125949	125956	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014824	TATT	2	8	126528	126535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014824	AAGA	2	8	126726	126733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014824	ACAA	2	8	126966	126973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014824	TATT	2	8	128339	128346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014824	ATTA	2	8	128497	128504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014824	ACTC	2	8	128762	128769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014824	CAAT	2	8	128991	128998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014824	GTCA	2	8	131969	131976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014824	GACT	2	8	132136	132143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014824	ATCA	2	8	136526	136533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014824	CTTT	2	8	136646	136653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014824	TCAT	2	8	136828	136835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014824	ATTA	2	8	147996	148003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014824	ATCC	2	8	148725	148732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014824	ATTT	2	8	149166	149173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014824	ATAC	2	8	149424	149431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014824	CTGA	2	8	151517	151524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014824	CAGG	2	8	151659	151666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014824	CTTT	2	8	151989	151996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014824	AATT	2	8	152915	152922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014824	CAGC	2	8	153247	153254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014824	ACTT	2	8	153412	153419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014824	TTAC	2	8	159628	159635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014824	CTTT	2	8	160524	160531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014824	AATG	2	8	160640	160647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014824	CACG	2	8	168025	168032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014824	GATG	2	8	169314	169321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014824	AGGT	2	8	169387	169394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014824	AGGC	2	8	169607	169614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014824	ATCA	2	8	170040	170047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014824	TGAT	2	8	170070	170077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014824	ATTC	2	8	170702	170709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014824	AATA	2	8	170899	170906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014824	AATG	2	8	171056	171063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014824	TATG	2	8	171242	171249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014824	CAGG	2	8	173484	173491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014824	TGGT	2	8	173635	173642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014824	TCCT	2	8	173815	173822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014824	CTAC	2	8	174065	174072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014824	ATAA	2	8	175007	175014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014824	AATC	2	8	175148	175155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014824	TTTA	2	8	175282	175289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014824	ATCA	2	8	178807	178814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014824	AAGA	2	8	179085	179092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014824	TTGG	2	8	185450	185457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014824	GAAA	2	8	185752	185759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014824	AAGC	2	8	189449	189456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014824	AAGA	2	8	190475	190482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014824	ATAA	2	8	192283	192290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014824	AAAG	2	8	193031	193038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014824	AGTA	2	8	195544	195551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014824	TATG	2	8	195674	195681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014824	GCCT	2	8	200048	200055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014824	AGAA	2	8	201191	201198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014824	GCAG	2	8	201382	201389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014824	AATG	2	8	201880	201887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014824	ATCA	2	8	202049	202056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014824	GTAT	2	8	202582	202589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014824	GCCT	2	8	204333	204340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014824	TCAT	2	8	206307	206314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014824	ATTT	2	8	214651	214658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014824	ATTT	2	8	215022	215029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014824	ATTT	2	8	217364	217371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014824	TGAT	2	8	219784	219791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014824	GTAA	2	8	221388	221395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014824	TTTC	2	8	221554	221561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014824	TTTC	2	8	221577	221584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014824	GTTC	2	8	222459	222466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014824	AGTG	2	8	226730	226737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014824	TTGA	2	8	228212	228219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014824	ACAA	2	8	229414	229421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014824	ATAA	2	8	229455	229462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014824	ATTT	2	8	232338	232345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014824	TAAA	2	8	238046	238053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014824	TAAA	2	8	238331	238338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014824	AAAT	2	8	241441	241448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014824	GTTA	2	8	242093	242100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014824	TTTG	2	8	243210	243217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014824	GCTT	2	8	243304	243311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014824	GTTA	2	8	243447	243454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014824	TTTG	2	8	243644	243651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014824	TTTG	2	8	243996	244003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.