MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	TCATT	2	10	12864	12873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014738	AAAAT	2	10	20404	20413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014738	TTTGT	2	10	22442	22451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014738	AATCC	2	10	35732	35741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014738	GTTTT	2	10	40175	40184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014738	ATGAA	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014738	GAAAT	2	10	46950	46959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014738	ATAAA	2	10	48410	48419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014738	GTAGG	2	10	48860	48869	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014738	ACCCT	2	10	54523	54532	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014738	AAATT	2	10	62911	62920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014738	TATCA	2	10	70607	70616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014738	TTTAG	2	10	73497	73506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014738	TCATT	2	10	89332	89341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014738	TCTCA	2	10	95346	95355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014738	TAGTT	2	10	107780	107789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014738	TAAAT	2	10	107834	107843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014738	ATTTA	2	10	119410	119419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014738	TTAAA	2	10	121087	121096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014738	TAAAA	2	10	124169	124178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014738	GTTTT	2	10	128889	128898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014738	TAGTA	2	10	163358	163367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014738	TATTT	2	10	176129	176138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014738	TAACC	2	10	179342	179351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014738	TTTAG	2	10	181405	181414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014738	TTTAA	2	10	197923	197932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014738	ATTAT	2	10	198287	198296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014738	CAATA	2	10	198366	198375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014738	ATTTA	2	10	219756	219765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014738	AATAA	2	10	221846	221855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014738	TAGGA	2	10	240472	240481	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014738	TAAAA	2	10	263917	263926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014738	AACAA	2	10	267443	267452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014738	GTTTT	2	10	281914	281923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014738	TAATT	2	10	284927	284936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014738	CACAA	2	10	292572	292581	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014738	TTAAG	2	10	298762	298771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014738	AAACA	2	10	309423	309432	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014738	ATTAG	2	10	311490	311499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	ATTAA	2	10	315266	315275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014738	TATAA	2	10	315296	315305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014738	TATAT	2	10	315350	315359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014738	AACGA	2	10	337745	337754	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014738	CCAAG	2	10	337989	337998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014738	AATAA	2	10	338267	338276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014738	ATGAT	2	10	341332	341341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014738	ATTTT	2	10	345817	345826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014738	CAATT	2	10	362350	362359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014738	CTTTA	2	10	363712	363721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014738	AGATG	2	10	371771	371780	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014738	TCTCT	2	10	391767	391776	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014738	ATTAA	2	10	392119	392128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014738	TTTTC	2	10	396643	396652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014738	AACAA	2	10	400824	400833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014738	ATTTT	2	10	416648	416657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014738	CAATT	2	10	417922	417931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014738	AGTTT	2	10	419416	419425	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014738	AAATT	2	10	429577	429586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014738	TAACA	2	10	429599	429608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014738	AAAAG	2	10	455316	455325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014738	AAAAT	2	10	464523	464532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014738	TTTAA	2	10	464678	464687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014738	ATTAT	2	10	467869	467878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014738	ATAAG	2	10	469749	469758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014738	AAAAG	2	10	481501	481510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014738	GAAAA	2	10	482526	482535	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014738	TAAAT	2	10	485224	485233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014738	AAATT	2	10	487206	487215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014738	ACTAA	2	10	487459	487468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014738	TAAAA	2	10	487742	487751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014738	TATTT	2	10	487789	487798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014738	ATTAT	2	10	488056	488065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014738	GTTTT	2	10	488508	488517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014738	GTAAA	2	10	489665	489674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014738	GTCAA	2	10	492237	492246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014738	TATTT	2	10	493409	493418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014738	TTTTA	2	10	493990	493999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014738	ACAAA	2	10	499491	499500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014738	ATTTT	2	10	514407	514416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014738	TTTTA	2	10	518519	518528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014738	TTTAG	2	10	529837	529846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014738	AATTA	2	10	567021	567030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014738	AAAAT	2	10	567064	567073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014738	AACTT	2	10	567214	567223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014738	TAAAA	2	10	577988	577997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014738	ATAGT	2	10	581083	581092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014738	TACTA	2	10	584044	584053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014738	CCTTA	2	10	589246	589255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014738	ATTGT	2	10	589295	589304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014738	TATAA	2	10	594568	594577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014738	AAAAT	2	10	594675	594684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014738	CTACG	2	10	602552	602561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014738	TTCTG	2	10	602693	602702	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014738	ATTTT	2	10	616393	616402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014738	TAAAA	2	10	621055	621064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014738	GAAAT	2	10	623811	623820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014738	TATGA	2	10	625127	625136	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014738	TTTAA	2	10	642778	642787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014738	AAATC	2	10	648131	648140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014738	AAATT	2	10	666532	666541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014738	GGTTT	2	10	669782	669791	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014738	AAAAT	2	10	675544	675553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014738	ATAAA	2	10	678386	678395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014738	ATTTT	2	10	685437	685446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014738	ATTTA	2	10	692645	692654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014738	TAAAA	2	10	698492	698501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014738	AAAGA	2	10	719826	719835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014738	TTATT	2	10	724609	724618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014738	AATTA	2	10	724630	724639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014738	TTGAA	2	10	725717	725726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014738	TAAAA	2	10	725824	725833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014738	AGTAC	2	10	738694	738703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014738	CAAAA	2	10	738891	738900	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014738	AATAA	2	10	750465	750474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	AATAA	2	10	750528	750537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	ACAAA	2	10	750571	750580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014738	AATAA	2	10	750591	750600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014738	ACAAA	2	10	750634	750643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014738	AACAA	2	10	750696	750705	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014738	AATAA	2	10	750717	750726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014738	ACAAA	2	10	750760	750769	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014738	AACAA	2	10	750822	750831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014738	AATAA	2	10	750843	750852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014738	ATTAT	2	10	764818	764827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014738	ATTTT	2	10	779319	779328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014738	AAATT	2	10	782397	782406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014738	AAAAC	2	10	787571	787580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014738	AGCGG	2	10	794627	794636	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014738	ATATT	2	10	820248	820257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014738	ACTTA	2	10	824867	824876	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014738	AAATT	2	10	829834	829843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014738	GATTT	2	10	830154	830163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014738	AATTA	2	10	830178	830187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014738	ATTTT	2	10	845985	845994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014738	TAAAT	2	10	848834	848843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014738	CGCAA	2	10	860190	860199	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014738	AATTA	2	10	860438	860447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014738	CTAAA	2	10	862909	862918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014738	TCGTT	2	10	863328	863337	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014738	AACTA	2	10	866443	866452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014738	AATTA	2	10	868847	868856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014738	TTAAA	2	10	870300	870309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014738	TTAAA	2	10	875945	875954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014738	ATTAG	2	10	877907	877916	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014738	ATAAA	2	10	887221	887230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014738	GCAAC	2	10	887489	887498	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014738	AACCA	2	10	888023	888032	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014738	CATTT	2	10	889411	889420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.