MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 1525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	AACA	2	8	919	926	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014664	CGAT	2	8	8707	8714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014664	GGCA	2	8	8804	8811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014664	ATTG	2	8	8821	8828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014664	CCTT	2	8	12676	12683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014664	TCTT	2	8	14731	14738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014664	GTGA	2	8	16741	16748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014664	ATTT	2	8	16812	16819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014664	CGTC	2	8	26880	26887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014664	TTGC	2	8	29185	29192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014664	GCTC	2	8	29888	29895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014664	GCGA	2	8	32811	32818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014664	GCAT	2	8	39218	39225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014664	CGAA	2	8	40602	40609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014664	CTGC	2	8	51871	51878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014664	CTGA	2	8	64432	64439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014664	GGCA	2	8	65974	65981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014664	AGGC	2	8	66013	66020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014664	GGAG	2	8	70454	70461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014664	AAAC	2	8	74198	74205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014664	CCGT	2	8	74400	74407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014664	CCCG	2	8	74439	74446	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_014664	TTCA	2	8	79084	79091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014664	CCGC	2	8	89818	89825	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014664	TTTC	2	8	89930	89937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014664	AAGG	2	8	89974	89981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014664	GGGC	2	8	91233	91240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014664	CACG	2	8	93793	93800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014664	GTCA	2	8	96693	96700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014664	CGGG	2	8	97680	97687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014664	TCCC	2	8	98742	98749	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014664	AGCG	2	8	107705	107712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014664	CGGG	2	8	110632	110639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014664	GCGG	2	8	110785	110792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014664	CGGG	2	8	116693	116700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014664	GCGA	2	8	120356	120363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014664	ACTC	2	8	123193	123200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014664	CCCG	2	8	123260	123267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_014664	GGAG	2	8	129513	129520	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014664	TCGC	2	8	129835	129842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014664	AGCG	2	8	130130	130137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014664	AAGC	2	8	143298	143305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014664	CGGG	2	8	145403	145410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014664	CAAA	2	8	150651	150658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014664	CCGA	2	8	156043	156050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014664	TTTA	2	8	156926	156933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014664	AGGA	2	8	158303	158310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014664	TTCA	2	8	158951	158958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014664	GCTT	2	8	159183	159190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014664	TCGA	2	8	164545	164552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014664	CGGT	2	8	166667	166674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014664	GGCT	2	8	176425	176432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014664	ACTC	2	8	179770	179777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014664	CGGG	2	8	179964	179971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014664	CCGC	2	8	181791	181798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014664	GGAC	2	8	181873	181880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014664	TGAT	2	8	182315	182322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014664	CCCG	2	8	182359	182366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_014664	CCTT	2	8	183042	183049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014664	CGTC	2	8	191038	191045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014664	TCCC	2	8	191093	191100	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014664	TCCG	2	8	193154	193161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014664	ATAA	3	12	193248	193259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014664	CGAG	2	8	195768	195775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014664	GCGA	2	8	195781	195788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014664	CCGC	2	8	199659	199666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_014664	CCGC	2	8	216451	216458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_014664	CGTG	2	8	220134	220141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014664	GACG	2	8	220887	220894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014664	GGCG	2	8	222126	222133	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014664	TAAA	2	8	227303	227310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014664	GGTT	2	8	234540	234547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014664	CGGC	2	8	234591	234598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014664	CCGA	2	8	244026	244033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014664	CAAA	2	8	245376	245383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014664	CCGC	2	8	268263	268270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_014664	CCCG	2	8	272608	272615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_014664	ATCA	2	8	280244	280251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014664	GGTT	2	8	280303	280310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014664	CCGC	2	8	282336	282343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_014664	CTCC	2	8	282627	282634	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_014664	GTAC	2	8	285689	285696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014664	AACA	2	8	299809	299816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014664	TGGG	2	8	303208	303215	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014664	CGTC	2	8	315453	315460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014664	CGCA	2	8	321330	321337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014664	TCCC	2	8	324141	324148	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_014664	CGGC	2	8	325187	325194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014664	CGGC	2	8	328021	328028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014664	TGGC	2	8	342223	342230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014664	AGCA	2	8	346169	346176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014664	GCGA	2	8	347659	347666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014664	GATC	2	8	356704	356711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014664	GCAT	2	8	356877	356884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014664	CGCA	2	8	356905	356912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014664	AACC	2	8	358434	358441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014664	TCGC	2	8	363028	363035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014664	CCTT	2	8	363407	363414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014664	CGCC	2	8	363852	363859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_014664	GCCG	2	8	365976	365983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014664	TGAG	2	8	365988	365995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014664	TAAT	2	8	375103	375110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014664	CTCA	2	8	375313	375320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014664	ATAG	2	8	376936	376943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014664	TGGT	2	8	377200	377207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014664	AGGC	2	8	378910	378917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014664	CCGA	2	8	379225	379232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014664	GGAT	2	8	379610	379617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014664	CTGG	2	8	379638	379645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014664	CGCA	2	8	381785	381792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014664	TCCC	2	8	383732	383739	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_014664	CTTC	2	8	383741	383748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014664	TGCA	2	8	385616	385623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014664	TGAT	2	8	389460	389467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014664	ACCG	2	8	391145	391152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014664	TCGC	2	8	391230	391237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014664	AGGT	2	8	392227	392234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014664	AAAT	2	8	398283	398290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014664	CAAC	2	8	401141	401148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014664	GATG	2	8	404769	404776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014664	GTGC	2	8	407782	407789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014664	CAGC	2	8	407939	407946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014664	TTTC	2	8	408549	408556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014664	CATG	2	8	409820	409827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014664	CCTC	2	8	415338	415345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_014664	CCAT	2	8	419887	419894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014664	CGGT	2	8	420028	420035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014664	ATGG	2	8	422952	422959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014664	CATA	2	8	427567	427574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014664	GACG	2	8	438459	438466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014664	GTGG	2	8	442802	442809	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014664	CTTG	2	8	442853	442860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014664	GCAT	2	8	442992	442999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014664	TTTC	2	8	453044	453051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014664	ACAG	2	8	453205	453212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014664	GGAA	2	8	460287	460294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014664	CGGT	2	8	461873	461880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014664	GCCC	2	8	463558	463565	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014664	GCTG	2	8	465799	465806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014664	TCGA	2	8	466182	466189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014664	TGGC	2	8	466195	466202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014664	CCAG	2	8	469965	469972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014664	GCTC	2	8	470025	470032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014664	ATCG	2	8	470080	470087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014664	GAGC	2	8	472131	472138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014664	CCAG	2	8	480968	480975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014664	CTTC	2	8	482286	482293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014664	GCCG	2	8	484042	484049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014664	CAGC	2	8	499725	499732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014664	TCGC	2	8	499765	499772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014664	CTGG	2	8	500009	500016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_014664	GCTT	2	8	704726	704733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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443	NC_014664	AGCG	2	8	1338337	1338344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
444	NC_014664	ATTG	2	8	1340731	1340738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014664	GGCA	2	8	1340739	1340746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
446	NC_014664	ATAA	2	8	1343592	1343599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_014664	GCCG	2	8	1344154	1344161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_014664	GATT	2	8	1344304	1344311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014664	CTCG	2	8	1352734	1352741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_014664	GGAG	2	8	1355716	1355723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014664	CGAC	2	8	1356388	1356395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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457	NC_014664	CCTT	2	8	1373255	1373262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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460	NC_014664	GATC	2	8	1376955	1376962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
461	NC_014664	ATCC	2	8	1377332	1377339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
462	NC_014664	ATCC	2	8	1383196	1383203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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466	NC_014664	TCGC	2	8	1389514	1389521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_014664	GCCG	2	8	1390903	1390910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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470	NC_014664	CCCG	2	8	1391672	1391679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
471	NC_014664	CCGA	2	8	1391749	1391756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
472	NC_014664	GCTC	2	8	1392112	1392119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_014664	GCAG	2	8	1393392	1393399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
474	NC_014664	CCGG	2	8	1398714	1398721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
475	NC_014664	GCAG	2	8	1398839	1398846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_014664	ATCC	2	8	1398861	1398868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_014664	CGTC	2	8	1400773	1400780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_014664	ACCG	2	8	1406456	1406463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
481	NC_014664	CGCC	2	8	1406771	1406778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
482	NC_014664	GCCC	2	8	1410075	1410082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_014664	GACG	2	8	1419838	1419845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_014664	GCCG	2	8	1419914	1419921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
485	NC_014664	GCAA	2	8	1420349	1420356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014664	TTGC	2	8	1420597	1420604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_014664	CGGC	2	8	1420648	1420655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_014664	AGGG	2	8	1420697	1420704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
489	NC_014664	TGAT	2	8	1424745	1424752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_014664	GTGC	2	8	1424855	1424862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_014664	GTTG	2	8	1431713	1431720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014664	GGTA	2	8	1431743	1431750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014664	CAAA	2	8	1431769	1431776	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_014664	TTCC	2	8	1433163	1433170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_014664	GCCC	2	8	1438297	1438304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_014664	TCCC	2	8	1439059	1439066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_014664	TGTT	2	8	1439180	1439187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014664	GCAA	2	8	1447228	1447235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014664	CGAC	2	8	1447353	1447360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_014664	CCAG	2	8	1451210	1451217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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