MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014664	T	6	6	416954	416959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014664	CG	3	6	416990	416995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_014664	GCG	2	6	417004	417009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014664	GTT	2	6	417038	417043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014664	GGC	2	6	419225	419230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014664	GTC	2	6	419237	419242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014664	GGGGT	2	10	419268	419277	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014664	CGC	2	6	419280	419285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_014664	CCT	2	6	419348	419353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014664	GCG	2	6	419375	419380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_014664	GCC	2	6	419771	419776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_014664	T	7	7	419809	419815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014664	CCG	2	6	419868	419873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_014664	CCAT	2	8	419887	419894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_014664	CTT	2	6	419998	420003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014664	CGGT	2	8	420028	420035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_014664	GCC	2	6	421680	421685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014664	GGC	2	6	421808	421813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014664	ACA	2	6	421854	421859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014664	GAC	2	6	421919	421924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014664	ATGG	2	8	422952	422959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014664	CGT	2	6	423026	423031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014664	GCG	2	6	423092	423097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014664	CTT	2	6	423143	423148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014664	GGC	2	6	424485	424490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014664	CGG	2	6	425402	425407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014664	CG	3	6	427066	427071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_014664	ATC	2	6	427100	427105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_014664	GCG	2	6	427161	427166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014664	TC	3	6	427531	427536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_014664	CATA	2	8	427567	427574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_014664	CG	3	6	427599	427604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_014664	GC	3	6	427622	427627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_014664	GAC	2	6	427677	427682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014664	CGC	2	6	427686	427691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_014664	GTC	2	6	427739	427744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014664	GCC	2	6	427758	427763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_014664	GC	4	8	427771	427778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014664	CGG	2	6	427808	427813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014664	GA	3	6	427827	427832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014664	TTC	2	6	429033	429038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014664	CCG	2	6	429057	429062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_014664	TC	3	6	429892	429897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_014664	GC	3	6	429909	429914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_014664	GGA	2	6	429915	429920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014664	TTG	2	6	429923	429928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014664	GC	3	6	429959	429964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_014664	GC	3	6	430012	430017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_014664	TC	4	8	431978	431985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_014664	AG	3	6	432000	432005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014664	GCC	2	6	434776	434781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_014664	CG	3	6	437193	437198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_014664	ACG	2	6	437207	437212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014664	ACGCA	2	10	438347	438356	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_014664	TGC	2	6	438451	438456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014664	GACG	2	8	438459	438466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_014664	CGG	2	6	439440	439445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014664	GTT	2	6	439450	439455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014664	CGT	2	6	439508	439513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014664	CGT	2	6	442463	442468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014664	CG	3	6	442517	442522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_014664	GGCGAG	2	12	442545	442556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1063	NC_014664	CG	3	6	442643	442648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014664	CGGCG	2	10	442690	442699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_014664	GC	3	6	442747	442752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_014664	GTC	2	6	442758	442763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014664	GTGG	2	8	442802	442809	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014664	AAC	2	6	442824	442829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014664	CTTG	2	8	442853	442860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_014664	AAG	2	6	442890	442895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014664	ATT	2	6	442908	442913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014664	GCAT	2	8	442992	442999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_014664	GAGAG	2	10	443009	443018	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014664	CGA	2	6	443122	443127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014664	TTC	2	6	443162	443167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014664	CCCGT	2	10	443947	443956	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1077	NC_014664	ATA	2	6	444579	444584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014664	C	6	6	444609	444614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1079	NC_014664	TCG	2	6	444624	444629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_014664	ACG	2	6	444636	444641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014664	GC	3	6	446793	446798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_014664	TGCAA	2	10	446856	446865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_014664	GTCGG	2	10	446905	446914	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_014664	AGG	2	6	449504	449509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014664	AT	3	6	449551	449556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014664	TGC	2	6	449568	449573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014664	ACT	2	6	449614	449619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_014664	GCC	2	6	449639	449644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_014664	CCA	2	6	449660	449665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_014664	T	6	6	451733	451738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014664	GCG	2	6	451769	451774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_014664	AT	3	6	451836	451841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014664	GTGAA	2	10	451843	451852	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014664	GAC	2	6	452195	452200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014664	AGC	2	6	452250	452255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014664	CAT	2	6	452340	452345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014664	TTGAA	2	10	452354	452363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014664	CAA	2	6	452437	452442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014664	TCAAT	2	10	452466	452475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_014664	TAG	2	6	452497	452502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014664	TGG	2	6	453012	453017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014664	TTTC	2	8	453044	453051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_014664	CCG	2	6	453105	453110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_014664	ACAG	2	8	453205	453212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_014664	GGA	2	6	453247	453252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014664	CTC	2	6	458455	458460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_014664	ATT	2	6	458485	458490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014664	GCT	2	6	458493	458498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014664	CAG	2	6	458517	458522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014664	AGC	2	6	458524	458529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014664	AGT	2	6	458547	458552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014664	TGA	2	6	458676	458681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014664	GCG	2	6	460273	460278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014664	GGAA	2	8	460287	460294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014664	GCG	2	6	460304	460309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_014664	GGC	2	6	461180	461185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014664	TCT	2	6	461226	461231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014664	TCA	2	6	461278	461283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_014664	AGC	2	6	461341	461346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014664	GCT	2	6	461407	461412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014664	GTC	2	6	461480	461485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014664	A	6	6	461522	461527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014664	GAT	2	6	461538	461543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014664	GGC	2	6	461569	461574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014664	GC	3	6	461580	461585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014664	TTG	2	6	461675	461680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014664	GCC	2	6	461709	461714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_014664	TCT	2	6	461773	461778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_014664	TGA	2	6	461812	461817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014664	CGGT	2	8	461873	461880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_014664	AGT	2	6	461898	461903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014664	G	6	6	463450	463455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014664	ATC	2	6	463489	463494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_014664	AGC	2	6	463512	463517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014664	GGC	2	6	463522	463527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_014664	GCCC	2	8	463558	463565	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1137	NC_014664	GTT	2	6	463574	463579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_014664	GC	4	8	465756	465763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1148	NC_014664	TGA	2	6	466124	466129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_014664	TCG	2	6	466130	466135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_014664	TGC	2	6	466682	466687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_014664	ATCG	2	8	470080	470087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1171	NC_014664	CAT	2	6	472229	472234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1177	NC_014664	CGC	2	6	473269	473274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1181	NC_014664	GA	3	6	478593	478598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1183	NC_014664	TTC	2	6	479852	479857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_014664	GGAAC	2	10	508506	508515	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1261	NC_014664	CGAA	2	8	508758	508765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_014664	CGA	2	6	508820	508825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_014664	CG	4	8	508887	508894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_014664	ACA	2	6	508908	508913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_014664	GC	3	6	509219	509224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_014664	GT	3	6	509330	509335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_014664	ACT	2	6	509451	509456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_014664	CGC	2	6	509543	509548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1272	NC_014664	CCCG	2	8	509570	509577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1273	NC_014664	CCG	2	6	509612	509617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1395	NC_014664	GA	4	8	550322	550329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1396	NC_014664	A	7	7	550487	550493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1397	NC_014664	CGCTG	2	10	550905	550914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1398	NC_014664	TCTT	2	8	550984	550991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1399	NC_014664	TGGCG	2	10	550995	551004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1400	NC_014664	TAAT	2	8	553825	553832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_014664	CCTC	2	8	553848	553855	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1402	NC_014664	TCA	2	6	553961	553966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_014664	A	6	6	553968	553973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_014664	CTCG	2	8	554010	554017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_014664	GC	3	6	554033	554038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1407	NC_014664	GTG	2	6	554176	554181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_014664	GCG	2	6	567111	567116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_014664	CGG	2	6	567137	567142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_014664	TA	4	8	588364	588371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_014664	CG	3	6	588389	588394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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