MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014664	TCC	3	9	1961537	1961545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_014664	TTCGGC	2	12	1961717	1961728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_014664	CGG	2	6	1961734	1961739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_014664	GGC	2	6	1961749	1961754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014664	CTTTT	2	10	1961760	1961769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6006	NC_014664	CGG	2	6	1961775	1961780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014664	CGCC	2	8	1961805	1961812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6008	NC_014664	TTGCCC	2	12	1961813	1961824	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_014664	GGC	2	6	1961876	1961881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014664	CCA	2	6	1961883	1961888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_014664	CAA	2	6	1961922	1961927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014664	GGC	2	6	1961931	1961936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014664	CGC	2	6	1961988	1961993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_014664	CTT	2	6	1961994	1961999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014664	GCG	2	6	1962000	1962005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014664	GCC	2	6	1962073	1962078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_014664	CAT	2	6	1962120	1962125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_014664	ATA	2	6	1962157	1962162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014664	TGC	2	6	1962245	1962250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_014664	GC	3	6	1962311	1962316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_014664	GTC	2	6	1962334	1962339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_014664	AGC	2	6	1962382	1962387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014664	GCT	3	9	1962468	1962476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014664	GCG	2	6	1962487	1962492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014664	CTT	2	6	1962640	1962645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014664	GTC	2	6	1962676	1962681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014664	CGGC	2	8	1962767	1962774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_014664	TGA	2	6	1962805	1962810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_014664	GCC	2	6	1962880	1962885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_014664	C	6	6	1963297	1963302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6031	NC_014664	TTG	2	6	1963330	1963335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014664	TTC	2	6	1963983	1963988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014664	TGAA	2	8	1964023	1964030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_014664	AAGTCT	2	12	1964032	1964043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6035	NC_014664	TCG	2	6	1964484	1964489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_014664	GAC	2	6	1964551	1964556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014664	T	6	6	1964562	1964567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014664	CTT	2	6	1964615	1964620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014664	GC	3	6	1964696	1964701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_014664	GATG	2	8	1965253	1965260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014664	CG	4	8	1965298	1965305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014664	AGGG	2	8	1965419	1965426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014664	CG	3	6	1965742	1965747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014664	CAATT	2	10	1967391	1967400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6045	NC_014664	ACG	2	6	1967468	1967473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014664	TAG	2	6	1967535	1967540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014664	AGA	2	6	1967549	1967554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014664	CGGCG	2	10	1967823	1967832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6049	NC_014664	CCG	2	6	1967863	1967868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_014664	CGAAAA	2	12	1967979	1967990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6051	NC_014664	ATA	2	6	1968928	1968933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014664	AAAT	2	8	1968935	1968942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_014664	CAC	2	6	1968960	1968965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_014664	AT	3	6	1973794	1973799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014664	GAT	2	6	1973803	1973808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014664	TAA	2	6	1973812	1973817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_014664	GT	3	6	1973908	1973913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014664	TGA	2	6	1973960	1973965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014664	CG	3	6	1977300	1977305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_014664	AGC	2	6	1977860	1977865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014664	CAT	2	6	1987306	1987311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014664	CCGA	2	8	1987372	1987379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_014664	GTC	2	6	1987393	1987398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014664	ATG	2	6	1987444	1987449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014664	GGC	2	6	1987450	1987455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_014664	GCA	2	6	1987493	1987498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014664	GAG	2	6	1987509	1987514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014664	CAT	2	6	1987631	1987636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014664	GTGCA	2	10	1987639	1987648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6070	NC_014664	TCC	2	6	1987694	1987699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_014664	GAT	2	6	1987700	1987705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_014664	CGC	2	6	1987801	1987806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_014664	GC	3	6	1987811	1987816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6074	NC_014664	GCC	2	6	1987847	1987852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_014664	CGA	2	6	1987861	1987866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_014664	AACA	2	8	1989309	1989316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_014664	CCCA	2	8	1989368	1989375	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6078	NC_014664	CGGCC	2	10	1989387	1989396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6079	NC_014664	GAC	2	6	1989416	1989421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_014664	GCT	2	6	1989431	1989436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014664	T	8	8	1989436	1989443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014664	CCG	2	6	1989589	1989594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_014664	GT	3	6	1989620	1989625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014664	AAGCG	2	10	1989656	1989665	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_014664	GCT	2	6	1989669	1989674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_014664	TAA	2	6	1989691	1989696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014664	ATT	2	6	1989818	1989823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014664	GGC	2	6	1990690	1990695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_014664	GCC	2	6	1990773	1990778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_014664	GGGA	2	8	1990827	1990834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014664	GTC	2	6	1990840	1990845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_014664	ACA	2	6	1990846	1990851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014664	GCT	2	6	1990893	1990898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_014664	CAG	2	6	1990906	1990911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014664	CGC	2	6	1992861	1992866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_014664	CGG	2	6	1992879	1992884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014664	GCA	2	6	1994130	1994135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014664	TGA	2	6	1994178	1994183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_014664	TGA	2	6	1994276	1994281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014664	AAC	2	6	1994352	1994357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_014664	TTCCC	2	10	1994396	1994405	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6102	NC_014664	CGG	2	6	1994453	1994458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_014664	AGG	2	6	1994478	1994483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_014664	CGA	2	6	1994489	1994494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_014664	TC	3	6	1994510	1994515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_014664	AGC	2	6	1994553	1994558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_014664	TAC	2	6	1995030	1995035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014664	TGC	2	6	1995104	1995109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014664	ATC	2	6	1995204	1995209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_014664	TCT	2	6	1995221	1995226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_014664	TGC	2	6	1996076	1996081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014664	GCA	2	6	1996127	1996132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_014664	GCC	2	6	1996184	1996189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_014664	ACG	2	6	1996190	1996195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_014664	CCG	2	6	1996307	1996312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_014664	AGC	2	6	1996335	1996340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_014664	TCC	2	6	1997877	1997882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_014664	AG	3	6	1997896	1997901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014664	AT	3	6	1997966	1997971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_014664	GGA	2	6	1998046	1998051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014664	GAA	2	6	1998066	1998071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_014664	GCG	2	6	1998081	1998086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014664	GTT	2	6	1998126	1998131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_014664	CGC	2	6	1998224	1998229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_014664	TC	3	6	2000649	2000654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_014664	TCT	2	6	2000668	2000673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_014664	CG	4	8	2003057	2003064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_014664	CGC	2	6	2003067	2003072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_014664	CGG	2	6	2003077	2003082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_014664	CCCG	2	8	2003107	2003114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6131	NC_014664	TCG	2	6	2003127	2003132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6260	NC_014664	GGC	2	6	2042123	2042128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_014664	CG	4	8	2042137	2042144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_014664	GC	3	6	2042223	2042228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6263	NC_014664	CAT	2	6	2042261	2042266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6265	NC_014664	TCG	2	6	2042366	2042371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6267	NC_014664	CTTC	2	8	2042420	2042427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6268	NC_014664	GAAG	2	8	2042441	2042448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_014664	GGT	2	6	2042565	2042570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6331	NC_014664	CGG	2	6	2049279	2049284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6372	NC_014664	GCC	2	6	2063904	2063909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6381	NC_014664	CCG	2	6	2067137	2067142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6382	NC_014664	GCAA	2	8	2067266	2067273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6383	NC_014664	GAT	2	6	2069442	2069447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6385	NC_014664	CG	3	6	2069460	2069465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6386	NC_014664	CTA	2	6	2069546	2069551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6387	NC_014664	CCGCG	2	10	2069702	2069711	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6389	NC_014664	CTG	2	6	2077232	2077237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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