MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus equi 103S

Total Repeats: 1611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014659	CGGC	2	8	3290	3297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014659	GGAA	2	8	8206	8213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014659	ACCC	2	8	9362	9369	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_014659	GCGG	2	8	16394	16401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014659	ATGA	2	8	21444	21451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014659	TCCG	2	8	21817	21824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014659	GCTG	2	8	31592	31599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014659	GTGC	2	8	33208	33215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014659	CCCG	2	8	41646	41653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_014659	CTTG	2	8	46226	46233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014659	TCGG	2	8	46361	46368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014659	CATT	2	8	58287	58294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014659	CGCC	2	8	62720	62727	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_014659	GGGC	2	8	62798	62805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014659	AGCC	2	8	66134	66141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014659	AGTG	2	8	66385	66392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014659	CGGC	2	8	70086	70093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014659	CGGC	2	8	70123	70130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014659	GGAA	2	8	70152	70159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014659	CGTC	2	8	72447	72454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014659	CGGA	2	8	72510	72517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014659	GGCG	2	8	72763	72770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014659	CGGC	2	8	73427	73434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014659	TGAT	2	8	77923	77930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014659	TCAT	2	8	77934	77941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014659	CGAC	2	8	79312	79319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014659	GACC	2	8	99259	99266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014659	TCGA	2	8	99274	99281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014659	CGGT	2	8	107237	107244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014659	TGTT	2	8	107385	107392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014659	ACGG	2	8	109117	109124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014659	GCCC	2	8	110747	110754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014659	TCGT	2	8	110772	110779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014659	GCCG	2	8	113329	113336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014659	GACC	2	8	113338	113345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014659	GCGG	2	8	117510	117517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014659	GTGC	2	8	133296	133303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014659	GGGC	2	8	133325	133332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014659	CCGG	2	8	136687	136694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014659	GACG	2	8	136718	136725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014659	TCAA	2	8	149953	149960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014659	CGGG	2	8	153016	153023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014659	GTCG	2	8	162708	162715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014659	GTCG	2	8	162723	162730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014659	CGCC	2	8	163722	163729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014659	CCGC	2	8	168485	168492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_014659	CGGC	2	8	169515	169522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014659	GCCC	2	8	169776	169783	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_014659	GCCG	2	8	169833	169840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014659	GACC	2	8	173473	173480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014659	GTTT	2	8	174286	174293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014659	TTGG	2	8	179197	179204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014659	CGGT	2	8	179219	179226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014659	GGCC	2	8	183376	183383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014659	TCCC	2	8	183507	183514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014659	GGAA	2	8	190636	190643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014659	CGGT	2	8	191975	191982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014659	CGTG	2	8	194198	194205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014659	GCGA	2	8	199908	199915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014659	CGGC	2	8	199921	199928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014659	GAGC	2	8	200228	200235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014659	CAGG	2	8	214474	214481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014659	CGAC	2	8	215650	215657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014659	GAAG	2	8	215690	215697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014659	GGTC	2	8	234040	234047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014659	TGGG	2	8	234092	234099	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014659	GTTG	2	8	239691	239698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014659	TTCC	2	8	240857	240864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014659	GGAG	2	8	241476	241483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014659	GTGA	2	8	241754	241761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014659	GAAG	2	8	241769	241776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014659	GCGA	2	8	242142	242149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014659	CAGT	2	8	243571	243578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014659	TGGG	2	8	243861	243868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014659	GACG	2	8	244792	244799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014659	GGCG	2	8	245374	245381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014659	GTCC	2	8	258133	258140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014659	CGGA	2	8	258154	258161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014659	CTGT	2	8	263848	263855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014659	GACG	2	8	270030	270037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014659	CGGA	2	8	277480	277487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014659	CGTT	2	8	280764	280771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014659	CCGT	2	8	283971	283978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014659	AGCG	2	8	284035	284042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014659	CATG	2	8	288818	288825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014659	GCCG	2	8	288886	288893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014659	GGGC	2	8	293316	293323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014659	TCGC	3	12	293411	293422	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014659	TCGG	2	8	294243	294250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014659	GGCC	2	8	298314	298321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014659	GAAG	2	8	298480	298487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014659	GACG	2	8	298570	298577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014659	TTTG	3	12	298616	298627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014659	TCCT	2	8	309333	309340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014659	GGCG	2	8	309384	309391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014659	GACC	2	8	314460	314467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014659	AGGT	2	8	325087	325094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014659	GCTC	2	8	325577	325584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014659	AGCT	2	8	325759	325766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014659	ATCG	2	8	325832	325839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014659	CGGT	2	8	332307	332314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014659	TTGG	2	8	334673	334680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014659	CGTA	2	8	335865	335872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014659	CAAG	2	8	335982	335989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014659	CCTG	2	8	341036	341043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014659	AGGG	2	8	345500	345507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014659	ATCG	2	8	354743	354750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014659	CGGT	2	8	355269	355276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014659	CCTC	2	8	356968	356975	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_014659	GGGT	2	8	357106	357113	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014659	GTGA	2	8	358032	358039	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014659	TAAG	2	8	370061	370068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014659	GGAT	2	8	374276	374283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014659	GTCG	2	8	379436	379443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014659	CGGC	2	8	379467	379474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014659	CGGA	2	8	379476	379483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014659	CGCA	2	8	383878	383885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014659	TCTG	2	8	384224	384231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014659	GGTC	2	8	384260	384267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014659	TCGC	2	8	386120	386127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014659	CTGC	2	8	386140	386147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014659	GCCG	2	8	387688	387695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014659	CGAC	2	8	387721	387728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014659	CGAG	2	8	391164	391171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014659	GCCG	2	8	393255	393262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014659	CGCC	2	8	393881	393888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_014659	AGGA	2	8	399150	399157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014659	CCAC	2	8	402561	402568	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_014659	CCCG	2	8	402575	402582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_014659	CGGG	2	8	402588	402595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014659	CGCA	2	8	402632	402639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014659	GCGA	2	8	405234	405241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014659	TCGG	2	8	406936	406943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014659	TCGG	2	8	409743	409750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014659	AGTG	2	8	411511	411518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014659	GCAG	2	8	411569	411576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014659	ATCG	2	8	414126	414133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014659	GCAG	2	8	421695	421702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014659	CGAT	2	8	423587	423594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014659	CCGC	2	8	423637	423644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_014659	TCGA	2	8	427451	427458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014659	CACG	2	8	429609	429616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014659	AGTA	2	8	441239	441246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014659	CCTC	2	8	450830	450837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_014659	TCCT	2	8	451985	451992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014659	GGCC	2	8	452797	452804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014659	GCCG	2	8	452821	452828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014659	CCGG	2	8	455030	455037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014659	ACCG	2	8	456194	456201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014659	GGTT	2	8	458145	458152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014659	GTGG	2	8	459025	459032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_014659	CGGG	2	8	1460797	1460804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_014659	CGGG	2	8	1462937	1462944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_014659	GCCG	2	8	1481057	1481064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_014659	GGAG	2	8	1495268	1495275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_014659	TCGA	2	8	1505335	1505342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_014659	CTGG	2	8	1508598	1508605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_014659	ACCG	2	8	1534502	1534509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_014659	TCGC	2	8	1542791	1542798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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