MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus equi 103S

Total Repeats: 10607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014659	GTG	2	6	4983819	4983824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_014659	AAG	2	6	4983853	4983858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_014659	CGT	2	6	4983890	4983895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_014659	GCA	2	6	4983918	4983923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_014659	CGA	2	6	4989170	4989175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_014659	GAC	2	6	4989202	4989207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014659	CG	4	8	4989216	4989223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10508	NC_014659	GGTATC	2	12	4989238	4989249	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10509	NC_014659	GCG	2	6	4989266	4989271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_014659	CAA	2	6	4992616	4992621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_014659	TGT	2	6	4992622	4992627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_014659	TCG	2	6	4993437	4993442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_014659	GTC	2	6	4994625	4994630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_014659	CGT	2	6	4994672	4994677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_014659	TCC	2	6	4994685	4994690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10516	NC_014659	CCA	2	6	4994702	4994707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_014659	G	6	6	4994737	4994742	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_014659	CG	3	6	4994788	4994793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10519	NC_014659	GC	3	6	4995217	4995222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_014659	ATC	2	6	4995325	4995330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_014659	TTAGG	2	10	4995344	4995353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_014659	CAC	2	6	4995356	4995361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10523	NC_014659	CGC	2	6	4995379	4995384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_014659	GGC	2	6	4995385	4995390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_014659	GGC	2	6	5000874	5000879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_014659	CGG	2	6	5003849	5003854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_014659	CCA	2	6	5003897	5003902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_014659	CAGGT	2	10	5007282	5007291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10529	NC_014659	GT	3	6	5007290	5007295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_014659	GCCC	2	8	5008737	5008744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10531	NC_014659	GACG	2	8	5008748	5008755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10532	NC_014659	CAT	2	6	5010359	5010364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_014659	GC	3	6	5010375	5010380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_014659	ACG	2	6	5010392	5010397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_014659	GA	3	6	5010400	5010405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_014659	CTC	2	6	5010678	5010683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10537	NC_014659	CT	3	6	5011057	5011062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_014659	GTC	2	6	5011130	5011135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_014659	CAC	2	6	5011848	5011853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_014659	CAA	2	6	5011879	5011884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_014659	AG	3	6	5011886	5011891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_014659	AG	3	6	5011935	5011940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_014659	GTCC	2	8	5014741	5014748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_014659	CAC	2	6	5014765	5014770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_014659	GTC	2	6	5014793	5014798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_014659	CCG	2	6	5014823	5014828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10547	NC_014659	CGGA	2	8	5014855	5014862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10548	NC_014659	GCC	2	6	5017408	5017413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_014659	CGC	2	6	5020993	5020998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10550	NC_014659	CCGGC	2	10	5021004	5021013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10551	NC_014659	CGAT	2	8	5021054	5021061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_014659	CGA	2	6	5024116	5024121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_014659	GTC	2	6	5024131	5024136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_014659	AGC	2	6	5024190	5024195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_014659	CGC	3	9	5024214	5024222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_014659	CCCG	2	8	5024236	5024243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10557	NC_014659	GC	3	6	5024244	5024249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10558	NC_014659	GCC	2	6	5024260	5024265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_014659	CGTCC	2	10	5024288	5024297	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10560	NC_014659	C	7	7	5024296	5024302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10561	NC_014659	CGG	2	6	5024374	5024379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_014659	GCC	2	6	5024392	5024397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10563	NC_014659	GGC	2	6	5024423	5024428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_014659	CCCG	2	8	5024430	5024437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10565	NC_014659	CGGCA	2	10	5028225	5028234	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10566	NC_014659	CCG	2	6	5028260	5028265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_014659	AGG	2	6	5028902	5028907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_014659	GGCC	2	8	5030361	5030368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10569	NC_014659	TG	3	6	5030375	5030380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_014659	GCG	2	6	5030387	5030392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_014659	TCG	2	6	5030464	5030469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_014659	GTC	2	6	5030486	5030491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_014659	GAG	2	6	5032401	5032406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_014659	AAC	2	6	5033096	5033101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_014659	TGT	2	6	5033113	5033118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_014659	TGACC	2	10	5033119	5033128	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10577	NC_014659	CGCAG	2	10	5033182	5033191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10578	NC_014659	GACA	2	8	5033192	5033199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_014659	ACCC	2	8	5034223	5034230	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10580	NC_014659	AGG	2	6	5034243	5034248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_014659	GA	3	6	5034678	5034683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_014659	CGG	2	6	5036760	5036765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_014659	CG	3	6	5036786	5036791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_014659	CAC	2	6	5036842	5036847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_014659	TGA	2	6	5039073	5039078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_014659	CAC	3	9	5039819	5039827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10587	NC_014659	ACA	2	6	5039828	5039833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_014659	CTC	2	6	5041576	5041581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10589	NC_014659	CAC	2	6	5041596	5041601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10590	NC_014659	ACG	2	6	5042284	5042289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_014659	CG	3	6	5042317	5042322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_014659	CG	5	10	5042471	5042480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10593	NC_014659	GCG	3	9	5042478	5042486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_014659	CTC	2	6	5042531	5042536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10595	NC_014659	G	6	6	5042586	5042591	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_014659	GC	3	6	5042627	5042632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_014659	ACC	2	6	5042668	5042673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_014659	GTT	2	6	5042776	5042781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_014659	CCGT	2	8	5042783	5042790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_014659	GC	3	6	5042809	5042814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_014659	CGCAC	2	10	5042850	5042859	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10602	NC_014659	CCCG	2	8	5042892	5042899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10603	NC_014659	GTGA	2	8	5042982	5042989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_014659	GCC	2	6	5042999	5043004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10605	NC_014659	TG	3	6	5043043	5043048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_014659	CAG	2	6	5043080	5043085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_014659	GGA	2	6	5043159	5043164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.