MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014643	CA	3	6	1228526	1228531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_014643	GT	3	6	1230010	1230015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014643	TAT	2	6	1230473	1230478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014643	GAA	2	6	1230493	1230498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014643	CTT	2	6	1230549	1230554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014643	TG	3	6	1230580	1230585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014643	ATA	2	6	1231824	1231829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014643	CCGT	2	8	1231835	1231842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_014643	AC	3	6	1231866	1231871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_014643	ATGTC	2	10	1231933	1231942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3511	NC_014643	CGC	2	6	1232572	1232577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_014643	TGAG	2	8	1234013	1234020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014643	TAT	2	6	1234026	1234031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014643	GGC	2	6	1234149	1234154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014643	TGACA	2	10	1234608	1234617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_014643	CG	3	6	1234628	1234633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_014643	AACC	2	8	1234678	1234685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_014643	GAAA	2	8	1234692	1234699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014643	ATG	2	6	1235604	1235609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014643	ATG	2	6	1235641	1235646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014643	CGG	2	6	1235668	1235673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014643	CCG	2	6	1235676	1235681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_014643	AGA	2	6	1235682	1235687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014643	TAC	2	6	1237471	1237476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_014643	TA	3	6	1237487	1237492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014643	CAG	2	6	1237511	1237516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_014643	CTG	2	6	1237612	1237617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014643	ATG	2	6	1239827	1239832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014643	TGC	2	6	1239851	1239856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_014643	CGT	2	6	1239859	1239864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014643	TC	3	6	1239874	1239879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_014643	ACC	2	6	1240079	1240084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_014643	CTCA	2	8	1241413	1241420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_014643	TGA	2	6	1241513	1241518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014643	TGC	2	6	1241554	1241559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_014643	TATC	2	8	1241686	1241693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_014643	CT	3	6	1241724	1241729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_014643	CAC	2	6	1241741	1241746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_014643	CTCA	2	8	1241815	1241822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_014643	TC	3	6	1241865	1241870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_014643	TTC	2	6	1243076	1243081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014643	GCT	2	6	1243106	1243111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_014643	ACAT	2	8	1243139	1243146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_014643	TTC	2	6	1244628	1244633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_014643	GAA	2	6	1244647	1244652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014643	AC	3	6	1244671	1244676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_014643	GT	3	6	1246801	1246806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014643	GAG	2	6	1246828	1246833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014643	AG	3	6	1246832	1246837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014643	AAC	2	6	1246893	1246898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014643	TGC	2	6	1247776	1247781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014643	TC	3	6	1247799	1247804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_014643	ATA	2	6	1247944	1247949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014643	ACCA	2	8	1247954	1247961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_014643	GGC	2	6	1248025	1248030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3557	NC_014643	AAG	2	6	1248130	1248135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014643	CAC	2	6	1248138	1248143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_014643	AGG	2	6	1248149	1248154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014643	GC	3	6	1248157	1248162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_014643	TCC	2	6	1249650	1249655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_014643	AT	3	6	1249659	1249664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014643	CCG	2	6	1249701	1249706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_014643	TCC	2	6	1250200	1250205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_014643	CCCAG	2	10	1250914	1250923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3566	NC_014643	TGA	2	6	1250963	1250968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014643	AGCC	2	8	1251549	1251556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_014643	GAA	2	6	1251659	1251664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_014643	CCG	2	6	1251784	1251789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_014643	GC	4	8	1253348	1253355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_014643	ATT	2	6	1253420	1253425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014643	G	6	6	1253583	1253588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014643	GC	3	6	1255093	1255098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_014643	CCG	2	6	1255101	1255106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_014643	TAC	2	6	1255158	1255163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_014643	ATG	2	6	1255214	1255219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_014643	GAT	2	6	1255323	1255328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_014643	GC	3	6	1255355	1255360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_014643	ATTC	2	8	1255729	1255736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_014643	TAA	2	6	1255812	1255817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014643	CGG	2	6	1255984	1255989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3587	NC_014643	ATG	2	6	1256811	1256816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014643	GAA	2	6	1258416	1258421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014643	CCG	2	6	1258425	1258430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014643	CGG	2	6	1258453	1258458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_014643	GCG	2	6	1258540	1258545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_014643	GAA	2	6	1258695	1258700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014643	ACG	2	6	1258749	1258754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_014643	CGC	2	6	1258810	1258815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_014643	CGG	2	6	1258823	1258828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_014643	GAA	2	6	1258890	1258895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014643	CAA	2	6	1258919	1258924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014643	GC	3	6	1258947	1258952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_014643	CGG	2	6	1258963	1258968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014643	GAA	2	6	1259020	1259025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014643	TCA	2	6	1259028	1259033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_014643	T	6	6	1259180	1259185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014643	TCAA	2	8	1259683	1259690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_014643	TTC	2	6	1259734	1259739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_014643	TTCT	2	8	1260033	1260040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_014643	T	6	6	1260082	1260087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014643	ACA	2	6	1260090	1260095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014643	A	6	6	1260152	1260157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014643	ACC	2	6	1260249	1260254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_014643	T	6	6	1263174	1263179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_014643	AG	3	6	1263899	1263904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014643	TTG	2	6	1263911	1263916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014643	TTAC	2	8	1264019	1264026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_014643	TGA	2	6	1264037	1264042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014643	A	6	6	1264046	1264051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014643	CAG	2	6	1264081	1264086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_014643	T	6	6	1265888	1265893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014643	GAT	2	6	1265922	1265927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014643	T	6	6	1265940	1265945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014643	CTT	2	6	1266630	1266635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_014643	GTCC	2	8	1266681	1266688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_014643	CAC	2	6	1266743	1266748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_014643	AAC	2	6	1266756	1266761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014643	GGT	2	6	1266793	1266798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014643	AAAT	2	8	1266832	1266839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014643	CTC	2	6	1266867	1266872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_014643	TCG	2	6	1267316	1267321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014643	CAA	2	6	1267518	1267523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_014643	GTT	2	6	1267548	1267553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_014643	ACC	2	6	1267636	1267641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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