MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014643	CA	3	6	1046992	1046997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_014643	ACA	2	6	1047014	1047019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_014643	GTA	2	6	1047022	1047027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014643	A	6	6	1047046	1047051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014643	CAT	2	6	1047103	1047108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014643	GCG	2	6	1047115	1047120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_014643	AGG	2	6	1047181	1047186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014643	CAT	2	6	1049090	1049095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_014643	GGT	2	6	1049253	1049258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014643	GTT	2	6	1049309	1049314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014643	TCA	2	6	1049394	1049399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014643	G	7	7	1049589	1049595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014643	TGT	2	6	1051214	1051219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014643	CG	3	6	1051267	1051272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_014643	CTTT	2	8	1051996	1052003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_014643	GAAG	2	8	1052050	1052057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014643	A	6	6	1052082	1052087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014643	AGA	2	6	1052150	1052155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014643	GCC	2	6	1052294	1052299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_014643	GCC	2	6	1052352	1052357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_014643	GCC	2	6	1052386	1052391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_014643	GGC	2	6	1052408	1052413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014643	ACG	2	6	1052422	1052427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_014643	TCC	2	6	1060046	1060051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_014643	ACG	2	6	1060053	1060058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014643	GTGTG	2	10	1060059	1060068	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014643	ACG	2	6	1060076	1060081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_014643	ATT	2	6	1060136	1060141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014643	GAG	2	6	1063315	1063320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014643	CA	4	8	1065391	1065398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_014643	TA	3	6	1069997	1070002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014643	GTT	2	6	1074599	1074604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014643	GGC	2	6	1074686	1074691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014643	CGT	2	6	1074742	1074747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014643	GTG	2	6	1074804	1074809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014643	GTA	3	9	1074878	1074886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014643	A	6	6	1074922	1074927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014643	TA	3	6	1074969	1074974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014643	GCG	2	6	1075070	1075075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_014643	AGA	2	6	1075096	1075101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014643	AGGA	2	8	1075110	1075117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014643	AT	3	6	1075127	1075132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014643	ATT	2	6	1075146	1075151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014643	CTTAT	2	10	1075152	1075161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3045	NC_014643	ACC	2	6	1075190	1075195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_014643	AC	3	6	1075213	1075218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_014643	TA	3	6	1075232	1075237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014643	AAC	2	6	1075264	1075269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_014643	CAC	2	6	1081803	1081808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_014643	TTA	2	6	1081901	1081906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014643	TCC	2	6	1081954	1081959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_014643	AGC	2	6	1081960	1081965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014643	GGC	2	6	1081978	1081983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014643	GCG	2	6	1082247	1082252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_014643	TTGC	2	8	1082306	1082313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_014643	TGG	2	6	1082317	1082322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014643	CCA	2	6	1082375	1082380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_014643	GCT	2	6	1082401	1082406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014643	TGT	2	6	1082410	1082415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014643	CTG	2	6	1082431	1082436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014643	TTG	2	6	1082479	1082484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014643	TGC	2	6	1082528	1082533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_014643	CGG	2	6	1082556	1082561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_014643	TGG	2	6	1082624	1082629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014643	TGA	2	6	1082644	1082649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014643	AGTG	2	8	1082789	1082796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014643	AGAAA	2	10	1082808	1082817	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014643	GT	3	6	1082927	1082932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014643	GTT	2	6	1082942	1082947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014643	TTA	2	6	1083344	1083349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_014643	AT	3	6	1083379	1083384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014643	TTA	2	6	1083397	1083402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014643	ATT	2	6	1083533	1083538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014643	TAA	2	6	1083542	1083547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014643	TA	4	8	1083550	1083557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014643	ATT	2	6	1083562	1083567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014643	AT	3	6	1083572	1083577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014643	AT	3	6	1083579	1083584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014643	TA	3	6	1083588	1083593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014643	TAT	2	6	1083601	1083606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014643	CTT	2	6	1083748	1083753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014643	CAA	2	6	1083769	1083774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014643	AT	4	8	1084280	1084287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014643	TGA	2	6	1084326	1084331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014643	ATG	2	6	1084402	1084407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_014643	TACAC	2	10	1084469	1084478	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3088	NC_014643	TG	3	6	1084874	1084879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014643	AGA	2	6	1084896	1084901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_014643	TGAA	2	8	1084943	1084950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014643	CTTT	2	8	1085751	1085758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_014643	AAACG	2	10	1085770	1085779	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3093	NC_014643	CGAA	2	8	1086372	1086379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_014643	CAA	2	6	1086389	1086394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_014643	AGG	2	6	1086407	1086412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014643	CAC	2	6	1086413	1086418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_014643	ACCT	2	8	1086420	1086427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_014643	CGC	2	6	1086945	1086950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_014643	AAC	2	6	1087306	1087311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_014643	CAAT	2	8	1087313	1087320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_014643	AGG	2	6	1087323	1087328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014643	CAC	2	6	1087329	1087334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_014643	ACCT	2	8	1087336	1087343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_014643	TTCC	2	8	1087773	1087780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_014643	TCA	2	6	1088353	1088358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_014643	TG	3	6	1088380	1088385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014643	TA	3	6	1088402	1088407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014643	GGC	2	6	1088441	1088446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014643	ATG	2	6	1088478	1088483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014643	ACC	2	6	1088493	1088498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_014643	AAC	2	6	1088870	1088875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_014643	AC	3	6	1088973	1088978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_014643	TTC	2	6	1089048	1089053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014643	AG	4	8	1095688	1095695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014643	GT	3	6	1095701	1095706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014643	AT	3	6	1095739	1095744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014643	AGA	2	6	1095765	1095770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_014643	GCA	3	9	1095933	1095941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_014643	GTG	2	6	1095953	1095958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014643	TGG	2	6	1095972	1095977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014643	TTC	2	6	1096009	1096014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_014643	TGAG	2	8	1096058	1096065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014643	TAT	2	6	1096791	1096796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014643	TGA	2	6	1096844	1096849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014643	AAGTAT	2	12	1096860	1096871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014643	TC	3	6	1096916	1096921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_014643	GGGT	2	8	1096947	1096954	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014643	ATCA	2	8	1097005	1097012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_014643	AGGT	2	8	1097168	1097175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014643	CCT	2	6	1097183	1097188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_014643	GTT	2	6	1097200	1097205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014643	TTCG	2	8	1097216	1097223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3247	NC_014643	TAGC	2	8	1134013	1134020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_014643	ATT	2	6	1134076	1134081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_014643	AGA	2	6	1134099	1134104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_014643	CCG	2	6	1134116	1134121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_014643	AGGTT	2	10	1134141	1134150	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3260	NC_014643	GTG	2	6	1134460	1134465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_014643	TTG	2	6	1134470	1134475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_014643	CTT	2	6	1134657	1134662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_014643	TCTA	2	8	1134750	1134757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3265	NC_014643	GTTT	2	8	1134772	1134779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3269	NC_014643	TTA	2	6	1134942	1134947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3290	NC_014643	TG	3	6	1137300	1137305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3389	NC_014643	GC	3	6	1187638	1187643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3391	NC_014643	AC	4	8	1190132	1190139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3392	NC_014643	AGG	2	6	1190143	1190148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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