MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014643	TC	3	6	372735	372740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_014643	ATT	2	6	372750	372755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014643	CA	3	6	372842	372847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_014643	CT	3	6	372848	372853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_014643	ACG	2	6	373048	373053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014643	CAGA	2	8	374176	374183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_014643	CGG	2	6	375532	375537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014643	AGT	2	6	375562	375567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014643	CAG	2	6	376274	376279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014643	CACCC	2	10	376357	376366	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1011	NC_014643	A	6	6	376414	376419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014643	GAA	2	6	376513	376518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014643	TGT	2	6	376536	376541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014643	ATAG	2	8	376560	376567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014643	CT	3	6	376593	376598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_014643	GCT	2	6	376628	376633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014643	CA	3	6	376673	376678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_014643	AGG	2	6	376729	376734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014643	CGGCG	2	10	377444	377453	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_014643	CTTTT	2	10	377459	377468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_014643	AAG	2	6	377556	377561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014643	TTCT	2	8	378762	378769	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_014643	GCG	2	6	378789	378794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014643	TAC	2	6	381230	381235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014643	CAT	2	6	381305	381310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014643	TA	3	6	391087	391092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014643	TA	3	6	391103	391108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014643	T	6	6	391160	391165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014643	CAT	2	6	391173	391178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014643	GTC	2	6	391849	391854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014643	CG	3	6	391855	391860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_014643	TTG	2	6	392634	392639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014643	TTA	2	6	392668	392673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014643	CAA	2	6	392749	392754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014643	TTA	2	6	392773	392778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014643	ATG	2	6	392791	392796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014643	ATC	2	6	392814	392819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014643	ATCGT	2	10	392857	392866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_014643	TTG	2	6	392926	392931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014643	GGAAA	2	10	392940	392949	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014643	TGG	2	6	393642	393647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014643	GAAA	2	8	393723	393730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014643	AAT	2	6	394756	394761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014643	TAGG	2	8	394895	394902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014643	TG	3	6	394920	394925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014643	CTT	2	6	396478	396483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014643	CAA	2	6	396550	396555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_014643	CTG	2	6	396588	396593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014643	AT	3	6	398127	398132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014643	TCC	2	6	398165	398170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_014643	TCA	2	6	399938	399943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014643	GGC	2	6	401781	401786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014643	A	6	6	401861	401866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014643	TCT	2	6	401977	401982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014643	AC	3	6	402024	402029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_014643	AG	3	6	402032	402037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014643	GTGCT	2	10	403102	403111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_014643	TAC	2	6	403184	403189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014643	CTC	2	6	403275	403280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_014643	ATG	2	6	404633	404638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014643	TC	3	6	404668	404673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_014643	T	6	6	404685	404690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014643	AGA	2	6	404720	404725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014643	CGC	2	6	404751	404756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014643	ATG	2	6	404802	404807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014643	GT	3	6	404818	404823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014643	GCC	2	6	404825	404830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_014643	ATT	2	6	404833	404838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014643	GCA	2	6	406683	406688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014643	CGA	2	6	407084	407089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_014643	CAT	2	6	407154	407159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_014643	AT	3	6	407212	407217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014643	AT	3	6	407226	407231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014643	CGC	2	6	408243	408248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014643	GC	3	6	409601	409606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_014643	CGG	2	6	411679	411684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014643	CGC	2	6	411716	411721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_014643	AG	3	6	411732	411737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014643	GGGC	2	8	411763	411770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_014643	GC	3	6	411773	411778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_014643	TCC	2	6	411795	411800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_014643	CAG	2	6	411845	411850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014643	ACA	2	6	411853	411858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014643	GCCT	2	8	411862	411869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_014643	ACC	2	6	412166	412171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_014643	GC	3	6	414437	414442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_014643	GGCG	2	8	414453	414460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_014643	ACA	2	6	414467	414472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014643	GGC	2	6	414607	414612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014643	GC	3	6	414757	414762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_014643	CGC	2	6	414777	414782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_014643	TAC	2	6	414846	414851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014643	GC	3	6	414853	414858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014643	GC	3	6	414871	414876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_014643	TGT	2	6	416669	416674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014643	CA	3	6	416695	416700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_014643	AT	3	6	416748	416753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014643	TAC	2	6	416757	416762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014643	TAT	2	6	416774	416779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014643	T	6	6	416805	416810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014643	AT	3	6	416827	416832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014643	CTACC	2	10	416849	416858	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1103	NC_014643	CGGG	2	8	418073	418080	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_014643	ATG	2	6	418101	418106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014643	TCAC	2	8	418520	418527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_014643	CTAG	2	8	418742	418749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_014643	ACT	2	6	418777	418782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_014643	AAC	2	6	419266	419271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014643	CGT	2	6	419350	419355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014643	CTG	2	6	419888	419893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014643	GGCGG	2	10	419920	419929	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_014643	CCGCC	2	10	419946	419955	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1113	NC_014643	TAT	2	6	421033	421038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014643	TTA	2	6	421100	421105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014643	GTAATT	2	12	421116	421127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014643	GAA	2	6	421814	421819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014643	TCG	2	6	421823	421828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014643	GCA	2	6	423410	423415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_014643	ATA	2	6	425620	425625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014643	ACA	2	6	425728	425733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014643	TTC	2	6	425746	425751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014643	ACG	2	6	425778	425783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014643	CGG	2	6	427182	427187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014643	CCG	2	6	427225	427230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_014643	AC	3	6	427266	427271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014643	GT	3	6	427278	427283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014643	T	6	6	427321	427326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014643	GTT	2	6	427379	427384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014643	CAG	2	6	428914	428919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_014643	TCA	2	6	428973	428978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014643	TAT	2	6	429000	429005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014643	AGAGT	2	10	429082	429091	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014643	CATCT	2	10	429105	429114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_014643	GGA	2	6	429130	429135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014643	T	6	6	430321	430326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014643	CCTG	2	8	430384	430391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_014643	CGA	2	6	432196	432201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1166	NC_014643	CAG	2	6	446410	446415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_014643	ATA	2	6	481884	481889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_014643	CACT	2	8	482131	482138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1264	NC_014643	GGGCT	2	10	483438	483447	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1265	NC_014643	GGGCT	2	10	483471	483480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1266	NC_014643	GGGCT	2	10	483504	483513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1267	NC_014643	AT	3	6	483775	483780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_014643	CGG	2	6	483896	483901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1274	NC_014643	AGA	2	6	484152	484157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1400	NC_014643	TAT	2	6	529270	529275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_014643	TTC	2	6	529982	529987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_014643	CCT	2	6	531396	531401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_014643	TTTC	2	8	532931	532938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_014643	TCCCA	2	10	534891	534900	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1473	NC_014643	GAACC	2	10	552742	552751	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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