MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014643	A	6	6	188857	188862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014643	ATT	2	6	188876	188881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014643	GC	3	6	190052	190057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_014643	A	6	6	190068	190073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014643	AT	3	6	190105	190110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014643	GAA	2	6	191013	191018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014643	AC	3	6	191050	191055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_014643	TCT	3	9	191806	191814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014643	TAA	2	6	191842	191847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014643	ATT	2	6	193154	193159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014643	ATTT	2	8	193167	193174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014643	ACA	2	6	193180	193185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014643	AT	3	6	193204	193209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014643	AT	3	6	193298	193303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014643	ATA	2	6	193345	193350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014643	ATC	2	6	194518	194523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014643	AAT	2	6	194526	194531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014643	T	6	6	194547	194552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014643	A	6	6	194597	194602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014643	ATT	2	6	194694	194699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014643	CTC	2	6	194780	194785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_014643	CAA	2	6	194834	194839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014643	CGC	2	6	194867	194872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_014643	GTTG	2	8	194921	194928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014643	GAG	2	6	195003	195008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014643	TGT	2	6	195013	195018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014643	TGG	2	6	195052	195057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014643	AAT	2	6	195121	195126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014643	TTA	2	6	195859	195864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014643	TAA	2	6	195868	195873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014643	AT	3	6	195922	195927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014643	TTCA	2	8	196323	196330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_014643	CT	3	6	196338	196343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_014643	GCA	2	6	196351	196356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014643	GCT	2	6	196362	196367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_014643	TCCC	2	8	196417	196424	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
537	NC_014643	ATC	2	6	196433	196438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014643	TGC	2	6	197225	197230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_014643	TCCCC	2	10	197238	197247	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
540	NC_014643	A	6	6	197263	197268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014643	GGA	2	6	197336	197341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014643	TTC	2	6	198019	198024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014643	TAT	2	6	198051	198056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014643	CT	3	6	199236	199241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_014643	TTAT	2	8	199246	199253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014643	TGG	2	6	199285	199290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014643	GCG	2	6	199348	199353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014643	CT	3	6	199585	199590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_014643	TTC	2	6	199618	199623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014643	GAA	2	6	199653	199658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014643	TGT	2	6	199677	199682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014643	TTC	2	6	199737	199742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014643	GCC	2	6	199757	199762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_014643	CACT	2	8	199777	199784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_014643	GCC	2	6	199797	199802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_014643	CG	3	6	199844	199849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_014643	CCT	2	6	199870	199875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_014643	TCA	2	6	200737	200742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014643	ATT	2	6	200744	200749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014643	CCG	2	6	200781	200786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_014643	GCA	2	6	200803	200808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014643	GCT	2	6	200883	200888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014643	TGTAC	2	10	200984	200993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
564	NC_014643	CA	3	6	201018	201023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_014643	CTT	2	6	201353	201358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014643	TG	3	6	201414	201419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014643	AGAC	2	8	201439	201446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_014643	CCT	2	6	201454	201459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_014643	ATG	2	6	202100	202105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014643	TAA	2	6	202779	202784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014643	CCT	2	6	203659	203664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014643	GGTG	2	8	203667	203674	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014643	GGT	2	6	203787	203792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014643	TTA	2	6	203794	203799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014643	AG	3	6	203819	203824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014643	GC	3	6	203851	203856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_014643	TTTC	2	8	203864	203871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_014643	TA	3	6	204765	204770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014643	CTAAA	2	10	204772	204781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_014643	TTTA	2	8	204783	204790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014643	ATT	2	6	204809	204814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014643	CGA	2	6	204917	204922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014643	C	7	7	204929	204935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
584	NC_014643	A	8	8	204941	204948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014643	CA	3	6	204971	204976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_014643	CTG	2	6	205046	205051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014643	T	6	6	205920	205925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014643	AT	3	6	205948	205953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014643	ATA	2	6	205957	205962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014643	TAT	2	6	205976	205981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014643	CTT	2	6	206008	206013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014643	AT	3	6	206047	206052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014643	TCTA	2	8	206067	206074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_014643	TAC	2	6	206131	206136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014643	GGAA	2	8	206200	206207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014643	GCT	2	6	206456	206461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014643	GC	3	6	206469	206474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_014643	TG	3	6	206502	206507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014643	T	6	6	206525	206530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014643	CCA	2	6	206564	206569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_014643	CCA	2	6	207715	207720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_014643	ATT	3	9	207725	207733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014643	CCT	2	6	207739	207744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_014643	CCA	2	6	207763	207768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_014643	TACTT	2	10	207791	207800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_014643	TTC	2	6	207801	207806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014643	A	6	6	209048	209053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014643	GAT	2	6	209068	209073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014643	GAA	2	6	209334	209339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014643	GTC	2	6	209347	209352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_014643	CTC	2	6	209367	209372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_014643	GTG	2	6	209484	209489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014643	CCA	2	6	209502	209507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_014643	GCCA	2	8	209525	209532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_014643	GCT	2	6	209563	209568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014643	CT	3	6	209888	209893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_014643	GT	3	6	209943	209948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014643	CTG	2	6	209973	209978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014643	GAA	2	6	210013	210018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014643	CTT	2	6	210869	210874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014643	GAC	2	6	211982	211987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014643	CG	3	6	212048	212053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_014643	TTCC	2	8	212088	212095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_014643	CCG	2	6	212096	212101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_014643	CGCC	2	8	212108	212115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
626	NC_014643	GGC	2	6	212204	212209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014643	A	6	6	212218	212223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014643	GCAC	2	8	212255	212262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
629	NC_014643	GCT	2	6	214014	214019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014643	CCG	2	6	214047	214052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_014643	GTC	2	6	214077	214082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014643	AGG	2	6	214098	214103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014643	TTC	2	6	215997	216002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014643	GAA	2	6	216032	216037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014643	ACT	2	6	217162	217167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_014643	GTT	2	6	217175	217180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014643	CT	3	6	219872	219877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_014643	ACA	2	6	219888	219893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014643	A	6	6	220210	220215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014643	GCG	2	6	222597	222602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_014643	CCA	2	6	224145	224150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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657	NC_014643	A	6	6	228742	228747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_014643	AC	3	6	243610	243615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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774	NC_014643	GTT	2	6	265042	265047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_014643	CAGGT	2	10	266751	266760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
777	NC_014643	CG	3	6	266774	266779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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