MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum PSI07 megaplasmid mpPSI07

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014310	ACCGG	2	10	1382	1391	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014310	TCTGG	9	45	2158	2202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014310	CGTTG	2	10	7000	7009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014310	TCCGG	2	10	25672	25681	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014310	AGGTC	2	10	27798	27807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014310	CCGGT	2	10	28904	28913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014310	GCCGG	2	10	28972	28981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014310	GCCGG	2	10	48438	48447	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014310	GGGCC	2	10	49347	49356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014310	AACTA	2	10	50398	50407	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014310	CGGCA	2	10	76207	76216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014310	CTGCA	2	10	83705	83714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014310	TGGGT	2	10	94622	94631	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014310	GTGCC	2	10	115581	115590	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014310	GTGCG	2	10	119697	119706	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014310	GCGGG	2	10	127386	127395	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014310	GGGGC	2	10	137283	137292	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014310	ACCCG	2	10	142121	142130	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014310	CAGGC	2	10	142365	142374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014310	GGCGA	2	10	144469	144478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014310	CTGCC	2	10	151361	151370	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014310	CCGCA	2	10	167456	167465	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014310	GGGCA	2	10	170015	170024	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014310	GCGAA	2	10	170675	170684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014310	CGCTG	2	10	171429	171438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014310	GGCGC	2	10	171608	171617	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014310	TCCCG	2	10	175140	175149	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014310	ATGGA	2	10	176347	176356	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014310	CGCTG	2	10	177053	177062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014310	GGTGC	2	10	181381	181390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014310	CGTGC	2	10	191138	191147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014310	CGCGC	2	10	191148	191157	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014310	CGGGT	2	10	200775	200784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014310	CATGC	2	10	201110	201119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014310	CCTCC	2	10	208399	208408	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_014310	GGCGC	2	10	208439	208448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014310	ATGGC	2	10	215511	215520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014310	GACGC	2	10	220547	220556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014310	TCGAA	2	10	223299	223308	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014310	TCCGG	2	10	224339	224348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014310	GGCGG	2	10	257740	257749	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014310	CACGC	2	10	257939	257948	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014310	GCCGC	2	10	260503	260512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014310	TGACG	2	10	261208	261217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014310	CGGGC	2	10	274134	274143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014310	TTGGA	2	10	278770	278779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014310	TGGCA	2	10	282728	282737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014310	CATTT	2	10	302869	302878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014310	CGTCG	2	10	305973	305982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014310	CGCGG	2	10	306143	306152	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014310	GGCCG	2	10	311203	311212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014310	GATGT	2	10	313695	313704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014310	AGGCG	2	10	315653	315662	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014310	AGACA	2	10	319316	319325	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014310	GATGC	2	10	321705	321714	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014310	ATTTA	2	10	342557	342566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014310	GACGC	2	10	350283	350292	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014310	CCGTT	2	10	353337	353346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014310	GCGCT	2	10	373255	373264	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014310	ATTTC	2	10	373939	373948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014310	GCGCC	2	10	375150	375159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_014310	TTGCA	2	10	375300	375309	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014310	TCCTT	2	10	376465	376474	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014310	CTGCC	2	10	378252	378261	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014310	TACCG	2	10	391611	391620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014310	ACCCG	2	10	396105	396114	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014310	GCCCA	2	10	396307	396316	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_014310	GCCGC	2	10	396318	396327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_014310	GAGGC	2	10	400010	400019	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014310	CAACT	2	10	402745	402754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014310	TTTTG	2	10	414507	414516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014310	CTTCT	2	10	420368	420377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014310	TTGGA	2	10	420400	420409	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014310	GGAGA	2	10	424700	424709	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014310	GCGCC	2	10	425382	425391	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_014310	CGGGC	2	10	427982	427991	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014310	TCCGG	2	10	449651	449660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014310	TGAAA	2	10	461344	461353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014310	CCGGC	2	10	461366	461375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014310	GAGCG	2	10	545557	545566	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014310	ATGGC	5	25	553438	553462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014310	GTGGC	2	10	553463	553472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014310	GCCCG	2	10	557473	557482	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014310	CGCAG	2	10	564111	564120	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014310	AATCG	2	10	585736	585745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014310	GCGCG	2	10	587353	587362	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014310	GCAGG	2	10	588685	588694	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014310	GCTTT	2	10	592609	592618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014310	GAAAA	2	10	602876	602885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014310	GTTGC	2	10	605394	605403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014310	CCGAC	2	10	607190	607199	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_014310	CGGTC	2	10	607274	607283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014310	GTGAA	2	10	618697	618706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014310	CAGAT	2	10	622136	622145	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014310	TGGGC	2	10	622351	622360	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014310	CGTGC	2	10	628404	628413	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014310	CGCGC	2	10	628451	628460	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_014310	GCGCC	2	10	630565	630574	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_014310	TGGAT	2	10	633822	633831	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014310	GCCGC	2	10	641146	641155	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_014310	CCGTT	2	10	641229	641238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014310	ATGCA	2	10	669162	669171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014310	GCCGG	2	10	669219	669228	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014310	TGGCG	2	10	669824	669833	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014310	CGGCG	2	10	669858	669867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014310	GCCGC	2	10	669997	670006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014310	GCGAT	2	10	680013	680022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014310	TCCGA	2	10	681130	681139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014310	ATGAA	2	10	698607	698616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014310	GCATG	2	10	702230	702239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014310	CGGAA	2	10	705097	705106	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014310	GGGCG	2	10	717632	717641	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014310	TCCGG	2	10	717668	717677	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014310	CGAGG	2	10	720207	720216	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014310	TTGAA	2	10	728285	728294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014310	GTCGG	2	10	743076	743085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014310	TGAGT	2	10	766220	766229	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014310	CGGCG	2	10	766845	766854	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014310	GCCAT	2	10	766985	766994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014310	GTTTT	2	10	773149	773158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014310	CAGCG	2	10	776549	776558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014310	GGCTG	2	10	798500	798509	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014310	GAGCA	2	10	817733	817742	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014310	GAATC	2	10	818433	818442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014310	GGGGC	2	10	822126	822135	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014310	GGCTC	2	10	825496	825505	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014310	TGCCA	2	10	825793	825802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014310	GTGGC	2	10	828240	828249	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014310	GGCCG	2	10	849498	849507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014310	CAGGC	2	10	849629	849638	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014310	GGCGA	2	10	851732	851741	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014310	AGGCC	2	10	859712	859721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014310	GTCGA	2	10	881199	881208	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014310	TGGAT	2	10	881583	881592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014310	CAGGG	2	10	896315	896324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014310	ACGTC	2	10	902382	902391	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014310	CCACC	2	10	905001	905010	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_014310	AGGCA	2	10	920156	920165	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014310	CCGCG	2	10	920318	920327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_014310	TGGTA	2	10	927320	927329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014310	GTCCA	2	10	930315	930324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014310	CGGGG	2	10	941163	941172	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014310	GCTGG	2	10	959061	959070	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014310	CCGGG	2	10	962370	962379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014310	CGGCG	2	10	962469	962478	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014310	CGTGG	2	10	962491	962500	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014310	TTCGG	2	10	962675	962684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014310	ACCGT	2	10	974428	974437	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014310	AAGGG	2	10	984118	984127	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014310	CGGCG	2	10	999595	999604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014310	GTCGT	2	10	1004525	1004534	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_014310	CGCGT	2	10	1024887	1024896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_014310	GGGCA	2	10	1024898	1024907	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_014310	GTGGA	2	10	1046794	1046803	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014310	TGCCG	2	10	1054545	1054554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_014310	ACAGA	2	10	1067626	1067635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_014310	GCCCG	2	10	1194666	1194675	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
183	NC_014310	GTCAG	2	10	1196539	1196548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_014310	CTTTC	2	10	1201296	1201305	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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251	NC_014310	TTGAA	2	10	1647396	1647405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_014310	GGATC	2	10	1666122	1666131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_014310	TCGCG	2	10	1751762	1751771	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_014310	CGGCG	2	10	1779065	1779074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
273	NC_014310	CGGCG	2	10	1779170	1779179	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014310	GCAGC	2	10	1779213	1779222	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_014310	TGGAG	2	10	1837346	1837355	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014310	GGCCG	2	10	1841201	1841210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_014310	ATTGA	2	10	1842354	1842363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014310	GTGCC	2	10	1859004	1859013	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_014310	GCTTG	2	10	1861036	1861045	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014310	CAAGC	2	10	1862311	1862320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_014310	TGCGT	2	10	1862333	1862342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_014310	TGAAC	2	10	1864813	1864822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_014310	TGACC	2	10	1864888	1864897	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_014310	CCGAT	2	10	1865279	1865288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_014310	TCGGT	2	10	1872439	1872448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
294	NC_014310	GCATG	2	10	1876665	1876674	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_014310	GCATA	2	10	1877410	1877419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_014310	GGTCA	2	10	1879635	1879644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
297	NC_014310	CCATT	2	10	1887591	1887600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
298	NC_014310	ACACC	2	10	1894310	1894319	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
299	NC_014310	AATTT	2	10	1909707	1909716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014310	TTTCA	2	10	1919288	1919297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_014310	GCGCG	2	10	1931972	1931981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
302	NC_014310	CGCGG	2	10	1935918	1935927	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
303	NC_014310	TGGGA	2	10	1938171	1938180	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014310	CAGAT	2	10	1945281	1945290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
305	NC_014310	GAGAC	2	10	1952914	1952923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
306	NC_014310	CCTGT	2	10	1952963	1952972	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
307	NC_014310	AGATA	2	10	1953035	1953044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
308	NC_014310	ACCAT	2	10	1958217	1958226	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
309	NC_014310	CTGCA	2	10	1958270	1958279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
310	NC_014310	GAAGG	2	10	1963312	1963321	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
311	NC_014310	CGGCC	2	10	1976412	1976421	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
312	NC_014310	CCGGA	2	10	1983887	1983896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
313	NC_014310	TCGCT	2	10	1984913	1984922	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
314	NC_014310	CTGCC	2	10	2004972	2004981	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
315	NC_014310	ATGCA	2	10	2026869	2026878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
316	NC_014310	GCCGG	2	10	2045751	2045760	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
317	NC_014310	CCCGC	2	10	2057622	2057631	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
318	NC_014310	ACGGC	2	10	2068057	2068066	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
319	NC_014310	CGCAC	2	10	2069760	2069769	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
320	NC_014310	TCTGT	2	10	2071199	2071208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
321	NC_014310	CGGCG	2	10	2071500	2071509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
322	NC_014310	GACAG	2	10	2071545	2071554	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
323	NC_014310	ATGAC	2	10	2080945	2080954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.