MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 10047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014307	ACG	2	6	298570	298575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014307	CG	4	8	298586	298593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_014307	A	7	7	299086	299092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014307	CCGC	2	8	299149	299156	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1005	NC_014307	GGGTC	2	10	299169	299178	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_014307	GAA	2	6	299193	299198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014307	AAC	2	6	299225	299230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014307	CGG	2	6	299281	299286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014307	CG	3	6	299291	299296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_014307	CCG	2	6	299371	299376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_014307	AAC	2	6	299533	299538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014307	GC	3	6	299541	299546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014307	GGC	2	6	299568	299573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014307	ATCC	2	8	299577	299584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_014307	CTA	4	12	299682	299693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014307	CAGAAA	2	12	299717	299728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1017	NC_014307	GCC	2	6	299808	299813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014307	TCTT	2	8	299894	299901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_014307	GCGG	2	8	300788	300795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_014307	GCC	2	6	300811	300816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_014307	GAC	3	9	301223	301231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014307	CAA	2	6	301253	301258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014307	TTG	2	6	301334	301339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014307	TAC	2	6	301346	301351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014307	CG	3	6	302962	302967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_014307	CG	3	6	303119	303124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_014307	CGG	2	6	303481	303486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014307	CG	3	6	303680	303685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014307	GCC	2	6	303700	303705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_014307	TGAT	2	8	303782	303789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014307	GCTT	2	8	304712	304719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_014307	GC	3	6	304732	304737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_014307	CGG	2	6	304753	304758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014307	CG	3	6	304767	304772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_014307	TGC	2	6	306223	306228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014307	TG	3	6	306229	306234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014307	CATC	2	8	306235	306242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_014307	ATGG	2	8	306362	306369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014307	CCG	2	6	306404	306409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_014307	CAAC	2	8	306429	306436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_014307	CCCG	2	8	306442	306449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1042	NC_014307	GC	3	6	307091	307096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_014307	CGG	2	6	307129	307134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014307	CAC	2	6	307194	307199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014307	C	6	6	307211	307216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1046	NC_014307	TTC	2	6	307229	307234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014307	CG	3	6	307281	307286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_014307	AGC	2	6	307313	307318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014307	TCCGC	2	10	307340	307349	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1050	NC_014307	GC	3	6	307392	307397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_014307	CGT	2	6	307401	307406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014307	GTT	2	6	307414	307419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014307	CGGCG	2	10	307422	307431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_014307	CCG	2	6	307446	307451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_014307	GGCG	2	8	307460	307467	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_014307	CGG	2	6	307513	307518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014307	CG	3	6	307563	307568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_014307	CGC	2	6	308104	308109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_014307	GC	3	6	308108	308113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_014307	TCG	2	6	308153	308158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014307	TCGT	2	8	308256	308263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_014307	CGC	2	6	308277	308282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014307	TGC	2	6	308295	308300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014307	TCC	2	6	308303	308308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014307	CGT	2	6	309119	309124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014307	GCCG	2	8	309171	309178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_014307	CGGCC	3	15	309212	309226	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1068	NC_014307	CAT	2	6	309240	309245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014307	CGG	2	6	309292	309297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014307	CGC	2	6	309308	309313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_014307	CAGGC	2	10	309340	309349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_014307	GCTG	2	8	309361	309368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_014307	GCATT	2	10	309436	309445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_014307	CAA	2	6	312487	312492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014307	TGA	2	6	312532	312537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014307	GTT	2	6	312541	312546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014307	CGA	2	6	312555	312560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_014307	TCA	2	6	312561	312566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014307	GCT	2	6	314565	314570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_014307	TCT	2	6	314616	314621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014307	A	7	7	314635	314641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014307	CGCC	2	8	314645	314652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1084	NC_014307	GGC	2	6	314653	314658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014307	CAG	2	6	314703	314708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_014307	A	6	6	315839	315844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014307	ACGCC	2	10	315885	315894	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1090	NC_014307	TCAA	2	8	315947	315954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014307	TAA	2	6	315959	315964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014307	CCT	2	6	315982	315987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_014307	TGCC	2	8	316040	316047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014307	GCC	3	9	316045	316053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_014307	CGG	2	6	316890	316895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_014307	TGCGG	2	10	316967	316976	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_014307	ATGAGA	2	12	316991	317002	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014307	GCG	2	6	317073	317078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014307	GGCG	2	8	318363	318370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_014307	CGTG	2	8	318396	318403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_014307	GGGCC	2	10	318420	318429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_014307	GGCC	2	8	318437	318444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_014307	CTC	2	6	319026	319031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_014307	TTCCTA	2	12	319032	319043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_014307	TAT	2	6	319748	319753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014307	CCGCA	2	10	320876	320885	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1108	NC_014307	GC	3	6	320891	320896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_014307	CCA	2	6	321949	321954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_014307	GGCCG	2	10	321970	321979	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_014307	TGT	2	6	323909	323914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014307	CGCC	2	8	323921	323928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1113	NC_014307	CGG	2	6	323934	323939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014307	TCG	2	6	323941	323946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_014307	AC	4	8	323994	324001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_014307	GC	3	6	324020	324025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_014307	ACG	2	6	324121	324126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014307	GCC	2	6	324132	324137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_014307	ACATC	2	10	324139	324148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1120	NC_014307	GCCG	2	8	325702	325709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_014307	CGGC	2	8	327996	328003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_014307	GC	3	6	329540	329545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_014307	GCG	3	9	330092	330100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014307	CTG	2	6	330101	330106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014307	TCCTG	2	10	330113	330122	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1126	NC_014307	CTGG	2	8	330166	330173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_014307	GTG	2	6	330191	330196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014307	TG	3	6	330195	330200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014307	TCC	2	6	330216	330221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_014307	GGC	2	6	330250	330255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014307	GCT	2	6	330305	330310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014307	TAT	2	6	330335	330340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014307	GGTCT	2	10	330362	330371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_014307	TG	3	6	334059	334064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014307	ACA	2	6	334077	334082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_014307	GCC	2	6	334096	334101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_014307	CTT	2	6	334109	334114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_014307	CGA	2	6	334355	334360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1147	NC_014307	GTG	2	6	334665	334670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_014307	CG	3	6	365699	365704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1409	NC_014307	G	7	7	402065	402071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_014307	GCCGG	2	10	402076	402085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1411	NC_014307	TGGC	2	8	402144	402151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_014307	GCA	2	6	402154	402159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_014307	GCC	2	6	402190	402195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1416	NC_014307	CGT	2	6	402255	402260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_014307	CGGGC	2	10	402327	402336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1420	NC_014307	ACTCC	2	10	404982	404991	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1421	NC_014307	CGT	2	6	405057	405062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_014307	GC	3	6	407344	407349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1432	NC_014307	GC	3	6	407972	407977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1433	NC_014307	CGG	3	9	409576	409584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_014307	GTT	2	6	419345	419350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_014307	GGT	2	6	419466	419471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_014307	CGG	2	6	419478	419483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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