MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	GCC	2	6	3238	3243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014035	GTT	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014035	CAT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014035	GCC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014035	GCC	2	6	7029	7034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014035	GCC	2	6	8117	8122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014035	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014035	GAG	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014035	TGC	2	6	8226	8231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014035	CCG	2	6	8269	8274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014035	CCG	2	6	10776	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014035	GAG	2	6	11674	11679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014035	CAC	2	6	11873	11878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014035	CGA	2	6	11957	11962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014035	ATG	2	6	12626	12631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014035	CTG	2	6	14788	14793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014035	CGG	2	6	17259	17264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014035	CGG	2	6	18104	18109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014035	TCA	2	6	19017	19022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014035	GCG	2	6	19051	19056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014035	TGC	2	6	19069	19074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014035	GGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014035	CCA	2	6	21635	21640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014035	CCG	2	6	21661	21666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014035	GGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014035	GAC	2	6	22821	22826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014035	CCG	2	6	26278	26283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014035	GCC	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014035	GAT	2	6	27735	27740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014035	CGC	2	6	32136	32141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014035	CGC	2	6	32219	32224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014035	GTT	2	6	32273	32278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014035	CTG	2	6	32280	32285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014035	CGG	2	6	32321	32326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014035	CGG	2	6	32342	32347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014035	GAT	2	6	32365	32370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014035	TTG	2	6	36277	36282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014035	GCG	2	6	36297	36302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014035	CCG	2	6	37234	37239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014035	TCG	2	6	37974	37979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014035	GAG	2	6	38025	38030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014035	CAG	2	6	38115	38120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014035	GCG	2	6	38239	38244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014035	ACG	2	6	38277	38282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014035	ACG	2	6	38308	38313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014035	ACA	2	6	38511	38516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014035	TGG	2	6	38535	38540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014035	TGG	2	6	38553	38558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014035	CCG	2	6	38671	38676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014035	GCA	2	6	38797	38802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014035	CGC	2	6	39866	39871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014035	GCC	2	6	39920	39925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014035	CGC	2	6	39943	39948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014035	GCC	2	6	45487	45492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014035	TCC	2	6	46569	46574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014035	CGC	2	6	46698	46703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014035	CCT	2	6	46739	46744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014035	GCC	2	6	46860	46865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014035	CGC	2	6	46875	46880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014035	CCG	2	6	46892	46897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014035	ATC	2	6	46955	46960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014035	GGA	2	6	47017	47022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014035	CCG	2	6	48078	48083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014035	TGC	2	6	50254	50259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014035	CCG	2	6	50289	50294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014035	GGC	2	6	50347	50352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014035	GGA	2	6	50417	50422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014035	GCG	2	6	50489	50494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014035	GCC	2	6	51279	51284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014035	TGA	2	6	52628	52633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014035	GCG	2	6	52654	52659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014035	CGC	2	6	52963	52968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014035	GGC	2	6	52982	52987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014035	CGC	2	6	54861	54866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014035	AGG	2	6	63929	63934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014035	TCC	2	6	64569	64574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014035	CCG	2	6	64601	64606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014035	GCA	2	6	64637	64642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014035	GCC	2	6	64651	64656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014035	ACC	2	6	64659	64664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014035	GCC	2	6	64693	64698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014035	GCG	2	6	64707	64712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014035	TCG	2	6	64730	64735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014035	GCC	2	6	72527	72532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014035	GTG	2	6	73171	73176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014035	GGC	2	6	73236	73241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014035	TCG	2	6	73366	73371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014035	ATG	2	6	73475	73480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014035	GTT	2	6	73525	73530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014035	GTG	2	6	73558	73563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014035	CAA	2	6	77213	77218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014035	GCG	2	6	77274	77279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014035	TCG	2	6	77327	77332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014035	TCA	2	6	77496	77501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014035	AAT	2	6	77598	77603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014035	GCT	2	6	77663	77668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014035	CGC	2	6	79972	79977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014035	ATC	2	6	80030	80035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014035	GTG	2	6	81603	81608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014035	TCG	2	6	81621	81626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014035	TCG	2	6	83089	83094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014035	GCC	2	6	83156	83161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014035	CGC	2	6	83243	83248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014035	ACG	2	6	83272	83277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014035	GAA	2	6	83292	83297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014035	GCA	2	6	83302	83307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014035	CCG	2	6	83385	83390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014035	CGC	2	6	83433	83438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014035	ATG	2	6	83466	83471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014035	TGC	2	6	83795	83800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014035	CGC	2	6	83826	83831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014035	AGG	2	6	83836	83841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014035	GCG	2	6	84871	84876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014035	GCC	2	6	87350	87355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014035	TTG	2	6	87375	87380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014035	GGA	2	6	87396	87401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014035	TGC	2	6	87460	87465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014035	CCG	2	6	87576	87581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014035	CGG	3	9	88315	88323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014035	GCC	2	6	88366	88371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014035	GAG	2	6	96892	96897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014035	TGG	2	6	97018	97023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014035	TGT	2	6	97163	97168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014035	AAC	2	6	97217	97222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014035	CGA	2	6	97232	97237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014035	CCA	2	6	97250	97255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014035	GCA	2	6	99469	99474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014035	CCG	2	6	99573	99578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014035	GAT	2	6	99630	99635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014035	CGG	2	6	100802	100807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014035	GCC	2	6	100820	100825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014035	GAG	2	6	100912	100917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014035	GCG	2	6	102778	102783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014035	CGG	2	6	102788	102793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014035	TGG	3	9	104667	104675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014035	GCT	2	6	104728	104733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014035	CAT	2	6	104752	104757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014035	TCT	2	6	105991	105996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014035	TCC	2	6	105998	106003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014035	CGG	2	6	106009	106014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014035	AGA	2	6	106015	106020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014035	TCC	2	6	112023	112028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014035	GCG	2	6	115235	115240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014035	TCA	2	6	115384	115389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014035	GCA	2	6	115456	115461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014035	GCG	2	6	116159	116164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014035	GGC	2	6	116172	116177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014035	GAT	2	6	116186	116191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014035	GCG	3	9	116202	116210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014035	GCC	2	6	116219	116224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_014035	CGG	2	6	117525	117530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014035	GCC	2	6	119034	119039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014035	TCG	2	6	119052	119057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014035	AGA	2	6	119140	119145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014035	GCA	2	6	120597	120602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014035	GAC	2	6	120644	120649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014035	TGC	2	6	120655	120660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014035	GAC	2	6	120671	120676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014035	ATG	2	6	120784	120789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014035	AGG	2	6	120800	120805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014035	GTT	2	6	121700	121705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014035	CGG	2	6	121763	121768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_014035	TCG	2	6	121789	121794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_014035	CCA	2	6	122219	122224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_014035	TCT	2	6	122276	122281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_014035	GGC	2	6	122389	122394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_014035	GCC	2	6	122412	122417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_014035	TGC	2	6	122566	122571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_014035	ACC	2	6	123804	123809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
171	NC_014035	ACG	2	6	123829	123834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014035	CGC	2	6	125122	125127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_014035	CGG	2	6	125133	125138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_014035	CAG	2	6	129006	129011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014035	GGC	2	6	130041	130046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_014035	CCG	4	12	130051	130062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_014035	CAG	2	6	130126	130131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014035	GCG	2	6	130175	130180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_014035	GCG	2	6	130252	130257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014035	GGA	2	6	131405	131410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014035	GCG	2	6	131422	131427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.