MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013715	CGA	2	6	1134429	1134434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013715	GCG	2	6	1134494	1134499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013715	GC	3	6	1134516	1134521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_013715	CT	3	6	1136023	1136028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_013715	CGG	2	6	1136046	1136051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013715	CTC	2	6	1137928	1137933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_013715	AAGT	2	8	1137955	1137962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013715	AC	4	8	1137971	1137978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_013715	ATG	2	6	1137982	1137987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013715	TGG	2	6	1140411	1140416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013715	GC	3	6	1140436	1140441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_013715	TCA	2	6	1140442	1140447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_013715	GCTC	2	8	1140451	1140458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013715	CACT	2	8	1140487	1140494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_013715	ACC	2	6	1140597	1140602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_013715	CGA	2	6	1140696	1140701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013715	CAC	2	6	1140754	1140759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013715	CCGG	2	8	1141045	1141052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_013715	CAC	2	6	1141067	1141072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013715	CCA	2	6	1141085	1141090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_013715	CA	3	6	1141108	1141113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_013715	CCA	2	6	1145428	1145433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_013715	CAT	2	6	1145458	1145463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_013715	ACGA	2	8	1145486	1145493	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_013715	GCAG	2	8	1145500	1145507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_013715	AGCTA	2	10	1145540	1145549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_013715	T	6	6	1146796	1146801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013715	AAG	2	6	1147812	1147817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013715	GTG	2	6	1147834	1147839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013715	CTT	2	6	1147851	1147856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013715	GTG	3	9	1148367	1148375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013715	GT	3	6	1149454	1149459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013715	GTGC	2	8	1149596	1149603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_013715	ACC	2	6	1149626	1149631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_013715	CAG	2	6	1149733	1149738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013715	CGG	2	6	1149739	1149744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013715	TGC	2	6	1149826	1149831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013715	ATT	2	6	1150045	1150050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013715	TTTA	2	8	1150118	1150125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013715	ATA	2	6	1150171	1150176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013715	CTGG	2	8	1150242	1150249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_013715	CTC	2	6	1150279	1150284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_013715	CG	3	6	1150325	1150330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_013715	GC	3	6	1150355	1150360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_013715	CTC	2	6	1150383	1150388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_013715	ATC	2	6	1150472	1150477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013715	CTA	2	6	1150480	1150485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013715	GGGGTT	2	12	1152210	1152221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013715	CTT	2	6	1152266	1152271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013715	AGCG	2	8	1152301	1152308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_013715	TTG	2	6	1154503	1154508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013715	CTT	2	6	1154607	1154612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013715	TGG	2	6	1154613	1154618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013715	AT	3	6	1154647	1154652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013715	GC	3	6	1155391	1155396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_013715	GT	3	6	1155429	1155434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013715	TGG	2	6	1155474	1155479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013715	CAACA	2	10	1155498	1155507	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3559	NC_013715	TTC	2	6	1155526	1155531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013715	CCA	2	6	1155756	1155761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_013715	ACC	2	6	1155770	1155775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_013715	CGA	2	6	1155830	1155835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013715	AAT	2	6	1155856	1155861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013715	CAG	2	6	1155958	1155963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013715	GCC	2	6	1156140	1156145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_013715	CTG	2	6	1156157	1156162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_013715	AAAG	2	8	1156193	1156200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_013715	CAA	2	6	1156211	1156216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_013715	GCG	2	6	1156220	1156225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013715	AGA	2	6	1156238	1156243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013715	TCG	2	6	1157054	1157059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013715	GT	3	6	1157066	1157071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013715	CCG	2	6	1157111	1157116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_013715	GAA	2	6	1157117	1157122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013715	CAG	2	6	1157142	1157147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013715	CAC	2	6	1157159	1157164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_013715	TTTGC	2	10	1157205	1157214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3578	NC_013715	CCA	2	6	1157239	1157244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_013715	CTT	2	6	1157317	1157322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013715	TAG	2	6	1157323	1157328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013715	CGG	2	6	1157353	1157358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_013715	AG	4	8	1157375	1157382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013715	CA	3	6	1157385	1157390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_013715	GTGG	2	8	1158621	1158628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_013715	TTC	2	6	1159466	1159471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013715	GC	3	6	1159560	1159565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_013715	GCGG	2	8	1159641	1159648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_013715	GGTC	2	8	1160674	1160681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_013715	ATT	2	6	1160988	1160993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_013715	CTA	2	6	1160994	1160999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_013715	CGG	2	6	1161034	1161039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013715	CAAGC	2	10	1161154	1161163	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3593	NC_013715	AGC	2	6	1161189	1161194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013715	GC	3	6	1161193	1161198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_013715	AGA	2	6	1161218	1161223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013715	CCG	2	6	1161243	1161248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_013715	CTC	2	6	1161264	1161269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013715	GCG	2	6	1161288	1161293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013715	TTC	2	6	1161296	1161301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013715	CTT	2	6	1161344	1161349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_013715	GA	3	6	1161363	1161368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013715	GTG	2	6	1162379	1162384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013715	GT	3	6	1162419	1162424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013715	TAT	2	6	1162487	1162492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013715	T	6	6	1162529	1162534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013715	AAT	2	6	1162591	1162596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013715	TA	3	6	1164327	1164332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013715	CACC	2	8	1164393	1164400	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3609	NC_013715	TTC	2	6	1165693	1165698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013715	GAG	2	6	1165740	1165745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_013715	ACT	2	6	1165755	1165760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013715	T	6	6	1165770	1165775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013715	GAA	2	6	1165803	1165808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013715	G	6	6	1165830	1165835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013715	CA	3	6	1166011	1166016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_013715	GGTT	3	12	1166022	1166033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013715	TCT	2	6	1166051	1166056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013715	GA	3	6	1168891	1168896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013715	GGT	2	6	1168942	1168947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013715	GCG	2	6	1168977	1168982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013715	GA	3	6	1169152	1169157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013715	CGCT	2	8	1169172	1169179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_013715	GGC	2	6	1170487	1170492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_013715	CCA	2	6	1170496	1170501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_013715	GCC	2	6	1170515	1170520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_013715	TC	3	6	1171871	1171876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_013715	AG	3	6	1171883	1171888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013715	CCG	2	6	1171900	1171905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_013715	GCG	2	6	1171913	1171918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_013715	CGAA	2	8	1171993	1172000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3631	NC_013715	ATTT	2	8	1172036	1172043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_013715	CTT	2	6	1172402	1172407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3768	NC_013715	TCA	2	6	1201505	1201510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3769	NC_013715	ATGAC	2	10	1201534	1201543	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3770	NC_013715	CAG	2	6	1201610	1201615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3894	NC_013715	GCA	3	9	1239805	1239813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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