MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013715	GAA	2	6	534255	534260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013715	AGA	2	6	534329	534334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013715	AGA	2	6	534359	534364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013715	GCC	2	6	534366	534371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_013715	GCC	2	6	534375	534380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_013715	GCA	2	6	534399	534404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013715	GAA	2	6	534411	534416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013715	ACCCTG	2	12	534422	534433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013715	CCA	2	6	534462	534467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_013715	CTC	2	6	534565	534570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_013715	ACCC	2	8	534610	534617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1512	NC_013715	CTA	2	6	534646	534651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013715	CAC	2	6	534657	534662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_013715	CA	3	6	534690	534695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_013715	GTTT	2	8	535729	535736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013715	GAA	2	6	535737	535742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013715	GAA	2	6	535755	535760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013715	GGT	2	6	537807	537812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013715	ACC	2	6	537832	537837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_013715	GAT	2	6	537870	537875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013715	CAA	2	6	537877	537882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013715	CAC	2	6	537995	538000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_013715	CGA	2	6	538471	538476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013715	ACACC	2	10	538496	538505	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1525	NC_013715	CGC	2	6	540154	540159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_013715	TC	3	6	540194	540199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_013715	AAGG	2	8	540222	540229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013715	GAT	2	6	540284	540289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013715	CATA	2	8	540329	540336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_013715	GA	3	6	540342	540347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013715	TGA	2	6	541980	541985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013715	AAT	2	6	542016	542021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013715	GAA	2	6	542137	542142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013715	TGA	2	6	542167	542172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013715	AATC	2	8	542173	542180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_013715	AGA	2	6	542189	542194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013715	GAA	2	6	542211	542216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013715	CTC	2	6	543140	543145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_013715	CT	3	6	544436	544441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_013715	CG	3	6	546481	546486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_013715	CGC	3	9	547927	547935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_013715	ACG	2	6	547941	547946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013715	ATT	2	6	549162	549167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013715	G	8	8	549277	549284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013715	GGT	2	6	550528	550533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013715	TCT	2	6	550600	550605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_013715	GCC	2	6	550713	550718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_013715	GAG	2	6	552246	552251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013715	GC	3	6	552377	552382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_013715	GGA	2	6	552424	552429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013715	GAT	2	6	556260	556265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013715	CGC	2	6	556267	556272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_013715	ACGC	2	8	557593	557600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_013715	GCC	2	6	559380	559385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_013715	CTT	2	6	559417	559422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013715	ATGC	2	8	559475	559482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_013715	AGG	2	6	559521	559526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013715	TCC	2	6	559580	559585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_013715	GCC	2	6	559708	559713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_013715	CTT	2	6	559745	559750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013715	T	7	7	559785	559791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013715	A	6	6	559800	559805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013715	TATT	2	8	559811	559818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013715	TAAA	2	8	559832	559839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013715	AAAT	2	8	559850	559857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013715	A	6	6	559863	559868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013715	GGT	2	6	559899	559904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013715	CGAAT	2	10	559913	559922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_013715	CCCAA	2	10	559943	559952	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1570	NC_013715	A	6	6	559963	559968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013715	CAG	2	6	559979	559984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013715	CAT	2	6	560023	560028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013715	ACGT	2	8	560160	560167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_013715	GCA	2	6	560195	560200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013715	CAA	2	6	560205	560210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013715	CTG	2	6	560241	560246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013715	AGA	2	6	560257	560262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013715	TGC	2	6	560288	560293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_013715	GAG	2	6	560349	560354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013715	AAGA	2	8	560355	560362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013715	TGC	2	6	560369	560374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013715	GAA	2	6	560408	560413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013715	ACA	2	6	560414	560419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_013715	ATG	2	6	560429	560434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013715	AT	3	6	560479	560484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013715	A	6	6	560520	560525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013715	ATG	2	6	560543	560548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013715	A	6	6	560582	560587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013715	TCAACC	2	12	560591	560602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_013715	AGGGT	2	10	560612	560621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013715	CAG	2	6	560650	560655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_013715	AAG	2	6	561683	561688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013715	ACA	2	6	561689	561694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013715	AGG	2	6	561708	561713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013715	G	6	6	561716	561721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013715	CCT	2	6	561734	561739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_013715	TTC	2	6	565543	565548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_013715	TG	3	6	565572	565577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013715	GGC	2	6	565591	565596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013715	GAA	2	6	566519	566524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013715	GGT	2	6	566547	566552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013715	GCA	2	6	566638	566643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013715	TG	3	6	566714	566719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013715	ATT	2	6	566737	566742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013715	CGG	2	6	568613	568618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013715	GCC	2	6	568636	568641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_013715	CACC	2	8	568689	568696	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1608	NC_013715	GA	3	6	568703	568708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013715	TA	3	6	568757	568762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013715	TCAC	2	8	569639	569646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_013715	TCC	2	6	569647	569652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_013715	CCGA	2	8	569658	569665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_013715	GC	3	6	570198	570203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_013715	CCCGC	2	10	570211	570220	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1615	NC_013715	GAA	2	6	570260	570265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013715	CCA	2	6	570266	570271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013715	CCG	2	6	574315	574320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_013715	GCG	3	9	574326	574334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013715	CTG	2	6	574358	574363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013715	GAC	2	6	574372	574377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013715	GGT	2	6	574384	574389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013715	GAA	2	6	574426	574431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013715	AAG	2	6	574472	574477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013715	GGA	2	6	574507	574512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013715	CAG	2	6	574538	574543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013715	TCC	2	6	574546	574551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_013715	CTT	2	6	574596	574601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013715	GGGGC	2	10	574611	574620	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_013715	GCCCC	2	10	574631	574640	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1630	NC_013715	TCT	2	6	574943	574948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013715	GT	3	6	575000	575005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013715	AGG	2	6	575052	575057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013715	GGA	2	6	575796	575801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013715	GTG	2	6	575838	575843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_013715	CTG	2	6	575912	575917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1909	NC_013715	GGC	2	6	671436	671441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_013715	CG	3	6	671455	671460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1911	NC_013715	AGC	2	6	671492	671497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1912	NC_013715	GCT	2	6	671522	671527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1914	NC_013715	TGA	2	6	671589	671594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1925	NC_013715	CTGAA	2	10	672390	672399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1932	NC_013715	TG	3	6	673533	673538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1939	NC_013715	CG	3	6	673787	673792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1942	NC_013715	CGCT	2	8	677994	678001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1948	NC_013715	CGC	2	6	683231	683236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1949	NC_013715	GTTTT	2	10	683352	683361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_013715	G	6	6	683438	683443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1958	NC_013715	GGC	2	6	683777	683782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_013715	AC	3	6	683784	683789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1961	NC_013715	GTG	2	6	683894	683899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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