MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013715	CAC	2	6	327907	327912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013715	GC	3	6	327949	327954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_013715	GTG	2	6	331373	331378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013715	CGT	2	6	331392	331397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013715	AAT	2	6	333053	333058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013715	TCC	3	9	333079	333087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_013715	GCC	2	6	333098	333103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_013715	TCG	2	6	333110	333115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013715	GT	3	6	333143	333148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013715	ATGT	2	8	333197	333204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013715	TG	3	6	333212	333217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013715	TG	3	6	333234	333239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013715	TCT	2	6	333290	333295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013715	A	6	6	333309	333314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013715	T	6	6	333329	333334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013715	CCT	2	6	333336	333341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_013715	TTA	2	6	333460	333465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013715	TTA	2	6	333474	333479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013715	ACC	2	6	333555	333560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013715	GTG	2	6	335087	335092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013715	TG	3	6	335091	335096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013715	AC	3	6	335180	335185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_013715	CAACA	2	10	335197	335206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_013715	AAG	2	6	335235	335240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013715	CCAG	2	8	335243	335250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_013715	AG	3	6	335259	335264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013715	CCA	2	6	335290	335295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_013715	AC	4	8	335350	335357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_013715	TCG	2	6	336771	336776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013715	ACG	2	6	336783	336788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013715	CG	3	6	336787	336792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_013715	A	7	7	336864	336870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013715	GAG	2	6	336904	336909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013715	GCTAG	2	10	344188	344197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_013715	AGC	2	6	344408	344413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013715	CGG	2	6	344419	344424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013715	GCC	2	6	344482	344487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_013715	TGA	2	6	347095	347100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013715	AGTG	2	8	347121	347128	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013715	A	6	6	347217	347222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013715	ACA	2	6	347254	347259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_013715	TTTC	2	8	347267	347274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_013715	CAC	2	6	347303	347308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_013715	GT	3	6	347327	347332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013715	AGG	2	6	347372	347377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013715	CGA	2	6	347404	347409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013715	CGC	2	6	347447	347452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_013715	CAC	2	6	347456	347461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_013715	CCA	2	6	347476	347481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_013715	ACCA	2	8	347503	347510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013715	AGG	2	6	347544	347549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013715	AGG	2	6	348802	348807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013715	TGC	2	6	348854	348859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1056	NC_013715	CGC	2	6	351267	351272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_013715	GC	3	6	353338	353343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_013715	CGGG	2	8	353356	353363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_013715	GGGGT	2	10	353376	353385	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013715	CGG	2	6	353406	353411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013715	TGCG	2	8	353448	353455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_013715	GTGC	2	8	353471	353478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_013715	CACC	2	8	356556	356563	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_013715	CCG	2	6	357260	357265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_013715	GGA	2	6	357315	357320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013715	C	9	9	358466	358474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1068	NC_013715	CCT	2	6	358506	358511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013715	TAA	2	6	358531	358536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013715	GCG	2	6	361337	361342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013715	GCC	2	6	361359	361364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013715	TGC	2	6	361429	361434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013715	GC	3	6	361449	361454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_013715	A	6	6	361462	361467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013715	GTTT	2	8	362920	362927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013715	GGT	2	6	362972	362977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_013715	GGT	2	6	364327	364332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013715	TGA	2	6	364336	364341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_013715	CCGAC	2	10	364494	364503	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1086	NC_013715	TGA	2	6	364518	364523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013715	CTC	2	6	364526	364531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1089	NC_013715	CG	3	6	364560	364565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_013715	ACC	2	6	364596	364601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_013715	CCTG	2	8	364605	364612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_013715	CATA	2	8	365735	365742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_013715	GGCA	2	8	365755	365762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_013715	CCG	2	6	365775	365780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_013715	TCA	2	6	368855	368860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013715	CTCGC	2	10	368877	368886	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1097	NC_013715	CG	3	6	368897	368902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_013715	CGC	2	6	368905	368910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013715	CAC	2	6	368928	368933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_013715	TCACC	2	10	368965	368974	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1101	NC_013715	ACACC	2	10	368980	368989	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1102	NC_013715	CGT	2	6	371859	371864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013715	CCT	2	6	371930	371935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_013715	T	7	7	371975	371981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013715	CA	3	6	372098	372103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_013715	ATA	2	6	372105	372110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013715	GGGGA	2	10	372126	372135	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013715	CTC	2	6	375038	375043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_013715	GGC	2	6	375144	375149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013715	GCG	2	6	375296	375301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013715	AAT	2	6	375312	375317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013715	GA	3	6	375323	375328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013715	GGA	2	6	375334	375339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013715	TGG	2	6	375420	375425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013715	CCA	2	6	375444	375449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_013715	ATA	2	6	375467	375472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013715	CGT	2	6	375499	375504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_013715	TCAA	2	8	375515	375522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_013715	TAT	2	6	375606	375611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013715	GGC	2	6	375632	375637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013715	TTC	2	6	375641	375646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013715	GATT	2	8	375663	375670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013715	TTC	2	6	375704	375709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_013715	AT	3	6	375781	375786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013715	AT	3	6	375817	375822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013715	CTA	2	6	375857	375862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013715	TTC	2	6	375898	375903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013715	GCA	2	6	375907	375912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013715	GCC	2	6	375947	375952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_013715	GCC	3	9	377546	377554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_013715	GAA	2	6	377566	377571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013715	CGCC	2	8	377633	377640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_013715	AC	3	6	377665	377670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_013715	CGG	2	6	377671	377676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_013715	AGGA	2	8	377711	377718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_013715	CTC	2	6	378739	378744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1488	NC_013715	TTC	2	6	533841	533846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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