MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013715	CAC	2	6	2236428	2236433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_013715	TACG	2	8	2236434	2236441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_013715	CCTA	2	8	2237123	2237130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_013715	GT	3	6	2239181	2239186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_013715	TTC	2	6	2239199	2239204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_013715	A	7	7	2239242	2239248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013715	TC	3	6	2239392	2239397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_013715	GGC	2	6	2239447	2239452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013715	GCA	2	6	2239480	2239485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_013715	CA	3	6	2239532	2239537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_013715	AAC	2	6	2239550	2239555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_013715	TGGCT	2	10	2239594	2239603	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7013	NC_013715	CA	3	6	2239661	2239666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_013715	AC	3	6	2239667	2239672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_013715	CAT	2	6	2239688	2239693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013715	ATC	2	6	2239841	2239846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013715	CGG	2	6	2239847	2239852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_013715	CCA	2	6	2239909	2239914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_013715	ACG	2	6	2239944	2239949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_013715	CAA	2	6	2239960	2239965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_013715	CGG	2	6	2239991	2239996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_013715	GCT	2	6	2240071	2240076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_013715	CCT	2	6	2240087	2240092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_013715	TGG	2	6	2240150	2240155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_013715	TCC	2	6	2240416	2240421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_013715	ACG	2	6	2240422	2240427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_013715	TTC	2	6	2240574	2240579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_013715	CTCCC	2	10	2240647	2240656	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7029	NC_013715	AAG	2	6	2240706	2240711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_013715	GGT	2	6	2240727	2240732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013715	CAC	2	6	2240784	2240789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7032	NC_013715	CAT	2	6	2240866	2240871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_013715	ATG	2	6	2240916	2240921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_013715	CA	3	6	2240939	2240944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_013715	TCGC	2	8	2240969	2240976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_013715	ACT	2	6	2240978	2240983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_013715	C	6	6	2241046	2241051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7038	NC_013715	TAA	2	6	2241217	2241222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_013715	AC	3	6	2241226	2241231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_013715	CAA	2	6	2241258	2241263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_013715	AGA	2	6	2241302	2241307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_013715	TA	3	6	2241321	2241326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013715	ACA	2	6	2241335	2241340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_013715	CACAA	2	10	2241344	2241353	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7045	NC_013715	CAA	3	9	2241351	2241359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_013715	CAAA	2	8	2241362	2241369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_013715	CAT	2	6	2241378	2241383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_013715	CAAA	2	8	2241396	2241403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_013715	AAC	2	6	2241406	2241411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_013715	AC	4	8	2241410	2241417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_013715	CAA	2	6	2241434	2241439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_013715	ACC	2	6	2241484	2241489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_013715	AGG	2	6	2241538	2241543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_013715	CTCC	2	8	2241617	2241624	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7055	NC_013715	GT	3	6	2241679	2241684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_013715	ATG	2	6	2241874	2241879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013715	TCC	2	6	2241900	2241905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7058	NC_013715	CCA	2	6	2241936	2241941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_013715	CACGA	2	10	2242001	2242010	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7060	NC_013715	GAC	2	6	2242014	2242019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_013715	CAC	2	6	2242027	2242032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_013715	TTC	2	6	2242101	2242106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_013715	CCG	2	6	2242134	2242139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_013715	TCC	2	6	2242366	2242371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_013715	CAG	2	6	2242478	2242483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_013715	AAT	2	6	2242517	2242522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_013715	GCT	2	6	2242557	2242562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013715	TC	3	6	2242604	2242609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_013715	TTC	2	6	2242610	2242615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013715	CTG	2	6	2242705	2242710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_013715	CGT	2	6	2242778	2242783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013715	CAA	2	6	2242808	2242813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_013715	CCA	2	6	2242858	2242863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_013715	AGGT	2	8	2242931	2242938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_013715	CGC	2	6	2243019	2243024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_013715	A	6	6	2243062	2243067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_013715	CA	3	6	2243104	2243109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_013715	TGA	2	6	2243150	2243155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_013715	AATA	2	8	2243168	2243175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_013715	AGTTTC	2	12	2243185	2243196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7081	NC_013715	AC	3	6	2243250	2243255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_013715	AGG	2	6	2243285	2243290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_013715	TCAT	2	8	2243307	2243314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7084	NC_013715	TCAA	2	8	2243349	2243356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7085	NC_013715	TG	3	6	2243371	2243376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_013715	CAC	2	6	2243404	2243409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_013715	TTTC	2	8	2243414	2243421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_013715	CTC	2	6	2243427	2243432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_013715	TCT	2	6	2243460	2243465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_013715	GAA	2	6	2243531	2243536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_013715	TTC	2	6	2243538	2243543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_013715	T	6	6	2243545	2243550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_013715	CCT	2	6	2243551	2243556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_013715	CGC	2	6	2243557	2243562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7095	NC_013715	A	6	6	2243704	2243709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013715	A	6	6	2243715	2243720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_013715	A	6	6	2243726	2243731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_013715	AGA	2	6	2243744	2243749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_013715	CCCCT	2	10	2243885	2243894	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7100	NC_013715	AGA	3	9	2243912	2243920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_013715	AGTT	2	8	2243957	2243964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_013715	ACG	2	6	2245360	2245365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_013715	TCA	2	6	2247798	2247803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_013715	CA	5	10	2247802	2247811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_013715	TA	3	6	2247879	2247884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_013715	TCTT	2	8	2247946	2247953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7107	NC_013715	GCA	2	6	2247966	2247971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_013715	AAG	2	6	2248008	2248013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_013715	CTT	2	6	2248042	2248047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_013715	AC	4	8	2248076	2248083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_013715	GGA	2	6	2248140	2248145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_013715	TAA	2	6	2248233	2248238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013715	GCC	2	6	2248239	2248244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_013715	CAG	2	6	2248256	2248261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_013715	GC	3	6	2248345	2248350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_013715	GCC	2	6	2248376	2248381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_013715	AGA	2	6	2248401	2248406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_013715	CAG	2	6	2248454	2248459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_013715	ACACC	2	10	2248477	2248486	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7120	NC_013715	AGA	2	6	2248508	2248513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_013715	ACC	2	6	2248590	2248595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_013715	GTG	2	6	2249490	2249495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_013715	CGG	2	6	2249517	2249522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_013715	GGAT	2	8	2249532	2249539	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_013715	CCT	2	6	2250211	2250216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_013715	GAAA	2	8	2250289	2250296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_013715	ACCGC	2	10	2250745	2250754	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7128	NC_013715	ATGCG	2	10	2250767	2250776	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7129	NC_013715	ACC	2	6	2252244	2252249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_013715	CCCAC	2	10	2252256	2252265	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7131	NC_013715	CCA	2	6	2252278	2252283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7132	NC_013715	AC	3	6	2252311	2252316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7133	NC_013715	AAG	2	6	2252881	2252886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_013715	CCG	2	6	2252894	2252899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7135	NC_013715	GA	3	6	2252906	2252911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7136	NC_013715	AGC	2	6	2254582	2254587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7138	NC_013715	GGCA	2	8	2254744	2254751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7142	NC_013715	T	6	6	2259076	2259081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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