MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013501	GT	3	6	9234	9239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013501	GC	3	6	20110	20115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013501	CG	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013501	CG	3	6	23780	23785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013501	TG	3	6	23853	23858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013501	TG	3	6	32167	32172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013501	CG	3	6	46868	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013501	GC	3	6	49066	49071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013501	CA	3	6	60442	60447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013501	GC	3	6	60478	60483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013501	GC	3	6	60549	60554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013501	GC	3	6	60629	60634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013501	CA	3	6	60649	60654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013501	GC	3	6	60658	60663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013501	GC	3	6	60691	60696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013501	CG	3	6	60801	60806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013501	CG	3	6	86515	86520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013501	TC	3	6	87247	87252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013501	CG	3	6	92556	92561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013501	CG	3	6	96921	96926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013501	GC	3	6	99042	99047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013501	TC	3	6	99358	99363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013501	GT	3	6	107989	107994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013501	CG	4	8	111221	111228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013501	GT	3	6	114468	114473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013501	AT	3	6	122235	122240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013501	GC	3	6	136190	136195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013501	CA	3	6	158968	158973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013501	CG	3	6	160671	160676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013501	GC	3	6	160679	160684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013501	GT	3	6	168127	168132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013501	TG	3	6	183576	183581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013501	GC	3	6	183969	183974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013501	GT	3	6	187106	187111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013501	CT	3	6	187213	187218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013501	AC	3	6	188605	188610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013501	CT	3	6	191056	191061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013501	CG	3	6	192402	192407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013501	CG	3	6	192434	192439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013501	CG	3	6	192486	192491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013501	TC	3	6	192502	192507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013501	GC	3	6	221120	221125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013501	AG	3	6	221126	221131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013501	AC	3	6	229331	229336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013501	GA	3	6	240742	240747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013501	GA	3	6	250052	250057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013501	TC	3	6	254250	254255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013501	GA	3	6	273154	273159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013501	TG	3	6	279864	279869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013501	GC	3	6	284265	284270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013501	GA	3	6	319625	319630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013501	GC	3	6	336303	336308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013501	GT	3	6	338204	338209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013501	CG	3	6	347154	347159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013501	GA	3	6	353831	353836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013501	TG	3	6	353874	353879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013501	GC	3	6	357872	357877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013501	GC	3	6	361210	361215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013501	CA	3	6	367506	367511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013501	CG	3	6	371826	371831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013501	GC	4	8	383774	383781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013501	AG	4	8	408770	408777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013501	GC	3	6	422748	422753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013501	CG	3	6	423455	423460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013501	GC	3	6	423565	423570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013501	TG	3	6	440701	440706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013501	GC	3	6	449521	449526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013501	GA	3	6	453637	453642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013501	AC	3	6	468168	468173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013501	GT	3	6	476321	476326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013501	GC	3	6	479129	479134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013501	TG	3	6	528038	528043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013501	CG	3	6	539851	539856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013501	GT	3	6	540036	540041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013501	CT	3	6	541972	541977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013501	CG	3	6	542609	542614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013501	CG	3	6	543455	543460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013501	CG	3	6	544324	544329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013501	CG	3	6	544681	544686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013501	CG	3	6	549377	549382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013501	TA	3	6	552044	552049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013501	AT	3	6	552640	552645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013501	GA	3	6	567557	567562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013501	GT	3	6	600047	600052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013501	GC	3	6	606962	606967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013501	CG	3	6	607208	607213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013501	CA	3	6	617224	617229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013501	TC	3	6	621553	621558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013501	GT	3	6	623122	623127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013501	CT	3	6	623191	623196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013501	GC	3	6	624433	624438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013501	AC	3	6	624477	624482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013501	CG	3	6	625278	625283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013501	GT	3	6	629343	629348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013501	AT	3	6	629790	629795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013501	GC	3	6	631564	631569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013501	TG	3	6	631571	631576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013501	GC	3	6	631614	631619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013501	CG	3	6	656086	656091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013501	GC	3	6	662691	662696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013501	TA	3	6	671072	671077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013501	CG	3	6	677411	677416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013501	GC	3	6	702318	702323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013501	GC	3	6	702506	702511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013501	CG	3	6	707495	707500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013501	GC	3	6	708501	708506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013501	GC	3	6	719092	719097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013501	GT	3	6	727457	727462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013501	CG	3	6	740014	740019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013501	CA	3	6	749185	749190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013501	CA	3	6	749460	749465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013501	TC	3	6	768147	768152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013501	CG	3	6	774885	774890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013501	GA	3	6	779484	779489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013501	AC	3	6	804418	804423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013501	GC	3	6	804587	804592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013501	CG	3	6	804755	804760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013501	CG	3	6	822230	822235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013501	GA	3	6	835064	835069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013501	CT	3	6	841111	841116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013501	CG	3	6	855001	855006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013501	GC	3	6	859936	859941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013501	GC	3	6	879112	879117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013501	GC	3	6	881311	881316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013501	GC	3	6	894398	894403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013501	GT	3	6	905682	905687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013501	GC	3	6	906407	906412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013501	AG	3	6	906579	906584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013501	GC	3	6	915124	915129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013501	GC	3	6	938913	938918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013501	TA	3	6	941459	941464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013501	AG	3	6	951503	951508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013501	CG	3	6	955315	955320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013501	AT	3	6	960435	960440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013501	TG	3	6	965317	965322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013501	GC	3	6	971190	971195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013501	TC	3	6	985258	985263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013501	GC	3	6	997473	997478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013501	GC	3	6	1000094	1000099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013501	CG	3	6	1000766	1000771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013501	GC	3	6	1000883	1000888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013501	CG	3	6	1001186	1001191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013501	GC	3	6	1002664	1002669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013501	CA	3	6	1006213	1006218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013501	CT	3	6	1015926	1015931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013501	CG	3	6	1024489	1024494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013501	CG	3	6	1034627	1034632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013501	CG	3	6	1082413	1082418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013501	GT	3	6	1090940	1090945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013501	GC	3	6	1091900	1091905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013501	GC	3	6	1119005	1119010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013501	AC	3	6	1124857	1124862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013501	GC	3	6	1137048	1137053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_013501	AT	3	6	1152390	1152395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.