MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_013501	CG	4	8	1559749	1559756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_013501	GAC	2	6	1559780	1559785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_013501	GCA	2	6	1559795	1559800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_013501	CAT	2	6	1559814	1559819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_013501	CGG	2	6	1559847	1559852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_013501	GGCGC	2	10	1559900	1559909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_013501	CGC	2	6	1560009	1560014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_013501	GC	3	6	1560019	1560024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_013501	GGC	2	6	1560049	1560054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_013501	AGG	2	6	1560165	1560170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_013501	TCG	2	6	1560184	1560189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_013501	GCATT	2	10	1560279	1560288	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_013501	GCTG	2	8	1560291	1560298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_013501	C	6	6	1560432	1560437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2516	NC_013501	GGCG	2	8	1560454	1560461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_013501	ATA	2	6	1560511	1560516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_013501	CCAT	2	8	1560544	1560551	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_013501	TG	3	6	1561445	1561450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2523	NC_013501	GCTG	2	8	1572704	1572711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_013501	GCC	2	6	1572731	1572736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2542	NC_013501	ATC	2	6	1586520	1586525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2549	NC_013501	GTTG	2	8	1593135	1593142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2555	NC_013501	GCCG	2	8	1598347	1598354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2561	NC_013501	TGGT	2	8	1599380	1599387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_013501	TTAA	2	8	1624702	1624709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_013501	CG	3	6	1624781	1624786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2610	NC_013501	GCC	2	6	1625067	1625072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_013501	AGC	2	6	1625097	1625102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2613	NC_013501	GA	3	6	1627484	1627489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_013501	GATT	2	8	1628300	1628307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_013501	GC	3	6	1628342	1628347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_013501	AAT	2	6	1628449	1628454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2619	NC_013501	TTGAT	2	10	1630731	1630740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2629	NC_013501	A	6	6	1635385	1635390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_013501	T	6	6	1635394	1635399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_013501	CAGA	2	8	1635437	1635444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_013501	GGCGG	2	10	1636736	1636745	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2633	NC_013501	GCC	2	6	1636755	1636760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_013501	TCCG	2	8	1637234	1637241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2635	NC_013501	GGC	2	6	1637242	1637247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_013501	ATC	2	6	1637255	1637260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2638	NC_013501	AGCGA	2	10	1637305	1637314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2639	NC_013501	GAAGC	2	10	1637393	1637402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2640	NC_013501	GGGT	2	8	1637434	1637441	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_013501	GTTT	2	8	1638991	1638998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_013501	TG	3	6	1639814	1639819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_013501	CGA	2	6	1639833	1639838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2645	NC_013501	ATG	2	6	1640015	1640020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2650	NC_013501	TCT	2	6	1642329	1642334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2754	NC_013501	A	7	7	1701591	1701597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2757	NC_013501	ACGCC	2	10	1706269	1706278	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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