MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2129	NC_013501	CGTT	2	8	1305340	1305347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2131	NC_013501	CGG	2	6	1311339	1311344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_013501	GCC	2	6	1311368	1311373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_013501	GC	3	6	1311409	1311414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_013501	ACC	2	6	1311415	1311420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2135	NC_013501	ATCGTA	2	12	1311464	1311475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2136	NC_013501	GC	3	6	1311563	1311568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2137	NC_013501	ATC	2	6	1311671	1311676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2139	NC_013501	TTG	2	6	1313850	1313855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_013501	GAA	2	6	1313857	1313862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_013501	GC	3	6	1314943	1314948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2142	NC_013501	GCG	2	6	1314951	1314956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_013501	CATG	2	8	1324972	1324979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2147	NC_013501	TTG	2	6	1325045	1325050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2148	NC_013501	GGAGA	2	10	1325063	1325072	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_013501	TTG	2	6	1325081	1325086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_013501	TGT	2	6	1325211	1325216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_013501	CAT	2	6	1325224	1325229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_013501	TAA	2	6	1325268	1325273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_013501	T	8	8	1325298	1325305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2154	NC_013501	GAA	2	6	1325322	1325327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2155	NC_013501	GAA	2	6	1325407	1325412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2156	NC_013501	AT	3	6	1325474	1325479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2157	NC_013501	GGA	2	6	1325493	1325498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2159	NC_013501	TTG	2	6	1325552	1325557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2162	NC_013501	GAT	2	6	1325614	1325619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2163	NC_013501	T	6	6	1325637	1325642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2164	NC_013501	T	6	6	1325666	1325671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_013501	AGA	2	6	1325703	1325708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_013501	TTA	2	6	1325747	1325752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2237	NC_013501	AG	3	6	1375479	1375484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_013501	GTG	2	6	1375495	1375500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2243	NC_013501	ACCCG	2	10	1389475	1389484	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2244	NC_013501	T	7	7	1390634	1390640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_013501	GGC	2	6	1392134	1392139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_013501	ATG	2	6	1392159	1392164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2248	NC_013501	TCA	2	6	1392240	1392245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_013501	TC	3	6	1394334	1394339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2250	NC_013501	TG	3	6	1395385	1395390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_013501	GC	3	6	1396404	1396409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2252	NC_013501	GTT	2	6	1396475	1396480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_013501	TCG	2	6	1401317	1401322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_013501	CGC	2	6	1401363	1401368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2255	NC_013501	CAG	2	6	1401395	1401400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2256	NC_013501	CGG	2	6	1410826	1410831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_013501	GGC	2	6	1412030	1412035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_013501	T	6	6	1412084	1412089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_013501	GCT	2	6	1413860	1413865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_013501	ACA	2	6	1413914	1413919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_013501	CAA	2	6	1414722	1414727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_013501	TTTA	2	8	1416528	1416535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_013501	CAA	2	6	1416572	1416577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_013501	AGG	2	6	1417676	1417681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_013501	ACCG	2	8	1420248	1420255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2269	NC_013501	G	6	6	1420649	1420654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2281	NC_013501	TTG	2	6	1427118	1427123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2378	NC_013501	CGTC	2	8	1496185	1496192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2389	NC_013501	TA	3	6	1504238	1504243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2390	NC_013501	TCT	2	6	1504244	1504249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2391	NC_013501	ATGC	2	8	1504289	1504296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2392	NC_013501	A	9	9	1504325	1504333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2393	NC_013501	GCA	2	6	1504347	1504352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_013501	GCT	2	6	1505443	1505448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2395	NC_013501	T	7	7	1505519	1505525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_013501	TTAT	2	8	1505586	1505593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_013501	CTT	2	6	1505636	1505641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2398	NC_013501	CT	3	6	1505643	1505648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2399	NC_013501	T	6	6	1505664	1505669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_013501	AAT	2	6	1505671	1505676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2403	NC_013501	TTTTTG	2	12	1505760	1505771	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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