MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013501	CGGA	2	8	928435	928442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_013501	CCTT	2	8	929000	929007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_013501	TGC	2	6	929057	929062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013501	TTA	2	6	931857	931862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013501	GAA	2	6	931894	931899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013501	CCG	2	6	932765	932770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_013501	AAC	2	6	932783	932788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013501	GCT	2	6	933955	933960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_013501	TGC	2	6	935411	935416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013501	A	6	6	935493	935498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013501	AAT	2	6	938099	938104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013501	GCTT	2	8	938111	938118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_013501	G	6	6	938158	938163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013501	TGG	2	6	938832	938837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013501	T	6	6	938855	938860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013501	GC	3	6	938913	938918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_013501	ATTT	2	8	941420	941427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013501	TA	3	6	941459	941464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013501	ATG	3	9	941495	941503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013501	TGCT	2	8	941610	941617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_013501	TGAA	2	8	941667	941674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013501	CGG	2	6	941675	941680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013501	ATA	2	6	942867	942872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013501	GCT	2	6	942878	942883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013501	TAT	2	6	942891	942896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013501	GAA	2	6	945134	945139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013501	GCC	2	6	948653	948658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013501	A	6	6	948681	948686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013501	CTG	2	6	948716	948721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013501	T	6	6	951478	951483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013501	AG	3	6	951503	951508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013501	ACAG	2	8	951561	951568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_013501	AGC	2	6	951572	951577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013501	CTG	2	6	951578	951583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013501	GAA	2	6	951608	951613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013501	T	7	7	951640	951646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013501	AAG	2	6	951673	951678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013501	AACG	2	8	951712	951719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_013501	GGC	2	6	952892	952897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013501	GCC	2	6	955295	955300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_013501	CG	3	6	955315	955320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_013501	CGG	2	6	958208	958213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013501	GAC	2	6	958266	958271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_013501	AT	3	6	960435	960440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013501	GTG	2	6	960505	960510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013501	CTG	2	6	960559	960564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1549	NC_013501	AACC	2	8	964919	964926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_013501	GGC	2	6	965293	965298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013501	TG	3	6	965317	965322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013501	GAGAC	2	10	966650	966659	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1553	NC_013501	CGG	2	6	966973	966978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013501	GCCC	2	8	967004	967011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1555	NC_013501	CGA	2	6	967022	967027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1558	NC_013501	AAGCG	2	10	969381	969390	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1559	NC_013501	GCC	2	6	970793	970798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_013501	GC	3	6	971190	971195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_013501	GAAT	2	8	971207	971214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013501	TCCG	2	8	973102	973109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_013501	GCA	2	6	974382	974387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_013501	GCCCA	2	10	974879	974888	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1565	NC_013501	TGA	2	6	977302	977307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013501	GCA	2	6	977862	977867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013501	GCG	2	6	978974	978979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013501	ATGG	2	8	978989	978996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013501	CGAT	2	8	979027	979034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_013501	CAGA	2	8	979042	979049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_013501	T	7	7	980811	980817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013501	ATG	2	6	983146	983151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013501	TTTTG	2	10	983160	983169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013501	TAA	2	6	983187	983192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013501	CGCA	2	8	983224	983231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1579	NC_013501	GCCG	2	8	985232	985239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_013501	TC	3	6	985258	985263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_013501	CAAA	2	8	987607	987614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_013501	T	6	6	987641	987646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_013501	T	6	6	989247	989252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_013501	TTA	2	6	989938	989943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_013501	A	7	7	989968	989974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013501	T	6	6	989998	990003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_013501	GAA	2	6	997497	997502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013501	A	7	7	997514	997520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013501	A	6	6	998745	998750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013501	A	6	6	998787	998792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013501	TAC	2	6	999288	999293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013501	TAC	2	6	999378	999383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013501	CGCGCT	2	12	999387	999398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1602	NC_013501	GC	3	6	1000094	1000099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_013501	CGC	2	6	1000143	1000148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_013501	CGG	2	6	1000151	1000156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013501	TGG	2	6	1000163	1000168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013501	CGTC	2	8	1000271	1000278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_013501	T	6	6	1000497	1000502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_013501	CAT	2	6	1000753	1000758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013501	CG	3	6	1000766	1000771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_013501	GC	3	6	1000883	1000888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_013501	TAC	2	6	1000959	1000964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1614	NC_013501	GCG	2	6	1001001	1001006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1619	NC_013501	GCC	2	6	1001165	1001170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_013501	CG	3	6	1001186	1001191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_013501	GTT	2	6	1001193	1001198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013501	CTG	2	6	1002551	1002556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013501	TCT	2	6	1002609	1002614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013501	GC	3	6	1002664	1002669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_013501	AAC	2	6	1002687	1002692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_013501	GCA	2	6	1006171	1006176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013501	CA	3	6	1006213	1006218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_013501	GCG	3	9	1006229	1006237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_013501	CGC	2	6	1006261	1006266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_013501	CCG	2	6	1006312	1006317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_013501	CTG	2	6	1006327	1006332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_013501	TGAGC	2	10	1006380	1006389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_013501	ACA	2	6	1006397	1006402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_013501	CAG	2	6	1006429	1006434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1768	NC_013501	TCG	2	6	1091847	1091852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1881	NC_013501	GATCGA	2	12	1169089	1169100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1883	NC_013501	CTA	2	6	1169131	1169136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1885	NC_013501	GTTTC	2	10	1169235	1169244	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1886	NC_013501	GAAG	2	8	1169290	1169297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1888	NC_013501	GAATG	2	10	1169402	1169411	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1889	NC_013501	GGCG	2	8	1169434	1169441	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1893	NC_013501	CGAC	2	8	1169546	1169553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1894	NC_013501	CGC	2	6	1169556	1169561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1895	NC_013501	CG	3	6	1169591	1169596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1896	NC_013501	CGGC	2	8	1169619	1169626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1996	NC_013501	A	6	6	1216893	1216898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_013501	CTGT	2	8	1221281	1221288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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