MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013501	CCG	2	6	600207	600212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013501	CCT	2	6	600233	600238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013501	AAGGC	2	10	600292	600301	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_013501	GAAGT	2	10	600342	600351	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013501	CAG	2	6	600361	600366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013501	A	6	6	605587	605592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013501	GTT	2	6	606783	606788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013501	AAC	2	6	606884	606889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013501	GC	3	6	606962	606967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_013501	GTC	2	6	606985	606990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013501	GCC	2	6	607001	607006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_013501	CCA	2	6	607025	607030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_013501	CGC	2	6	607065	607070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_013501	TGGAC	2	10	607076	607085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_013501	GAG	2	6	607099	607104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013501	GTG	3	9	607123	607131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013501	GGAA	2	8	607140	607147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013501	CG	3	6	607208	607213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_013501	GGGC	2	8	607270	607277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_013501	GCC	2	6	607288	607293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_013501	ATCGT	2	10	607307	607316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_013501	CCG	2	6	607324	607329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_013501	GAC	2	6	607417	607422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013501	CCT	2	6	607938	607943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_013501	GCA	2	6	607955	607960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013501	A	6	6	607994	607999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013501	GCG	2	6	611915	611920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013501	CCGG	2	8	611976	611983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_013501	AGCCGC	2	12	613115	613126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_013501	ATCC	2	8	613143	613150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_013501	CA	3	6	617224	617229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_013501	CAT	2	6	617239	617244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013501	TGT	2	6	621510	621515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013501	CGCTC	2	10	621528	621537	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_013501	TC	3	6	621553	621558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_013501	CGGG	2	8	621593	621600	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_013501	CCG	2	6	622650	622655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_013501	CCG	2	6	623047	623052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_013501	GT	3	6	623122	623127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013501	CT	3	6	623191	623196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_013501	GTC	2	6	623828	623833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_013501	G	6	6	623851	623856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013501	CCG	2	6	624209	624214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_013501	CGT	2	6	624220	624225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013501	AAC	2	6	624318	624323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013501	GCG	2	6	624331	624336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013501	TTC	2	6	624344	624349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013501	AGC	2	6	624396	624401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013501	CAGG	2	8	624406	624413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_013501	GC	3	6	624433	624438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013501	AC	3	6	624477	624482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_013501	GCG	2	6	624532	624537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_013501	CGT	2	6	624581	624586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013501	CG	3	6	625278	625283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_013501	CGG	2	6	625322	625327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013501	T	6	6	625339	625344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013501	GAA	2	6	625345	625350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013501	GAAA	2	8	627646	627653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013501	GCG	2	6	627657	627662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013501	CGG	2	6	628910	628915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013501	TGG	2	6	629090	629095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013501	GTTGT	2	10	629096	629105	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013501	ATG	2	6	629171	629176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013501	GCC	2	6	629177	629182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_013501	G	6	6	629202	629207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013501	CTG	2	6	629294	629299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_013501	GT	3	6	629343	629348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013501	GCC	2	6	629427	629432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013501	AACCA	2	10	629483	629492	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_013501	CTC	2	6	629527	629532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_013501	TCG	2	6	629549	629554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013501	CGT	2	6	629562	629567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013501	TGG	3	9	629685	629693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013501	GGC	2	6	629695	629700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013501	AGG	2	6	629744	629749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013501	ATG	2	6	629768	629773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013501	AT	3	6	629790	629795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013501	GTA	2	6	629837	629842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013501	GCAA	2	8	629857	629864	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_013501	TGT	2	6	629868	629873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013501	CAA	2	6	629900	629905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013501	ATA	2	6	629945	629950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013501	GGT	3	9	629980	629988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013501	GGT	3	9	629992	630000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013501	GGT	3	9	630004	630012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013501	CGG	2	6	630031	630036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_013501	CGG	2	6	630042	630047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013501	GCC	2	6	630052	630057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_013501	ACG	2	6	631524	631529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013501	CGG	2	6	631538	631543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013501	GC	3	6	631564	631569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_013501	TG	3	6	631571	631576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013501	GAC	2	6	631592	631597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013501	GC	3	6	631614	631619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_013501	CGG	2	6	635038	635043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013501	CAG	2	6	635191	635196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013501	GGAG	2	8	635807	635814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013501	ACCA	2	8	636462	636469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_013501	AGG	2	6	636472	636477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013501	TGC	2	6	637629	637634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013501	GCG	2	6	637645	637650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013501	T	7	7	637685	637691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013501	GCG	2	6	637707	637712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013501	ACG	2	6	639092	639097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013501	AGC	2	6	643201	643206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_013501	CGG	2	6	643277	643282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013501	CCG	2	6	643354	643359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_013501	TTTG	2	8	643443	643450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013501	TCA	2	6	650771	650776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013501	GTT	2	6	653854	653859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013501	CG	3	6	656086	656091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_013501	AAAG	2	8	657138	657145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013501	GAGC	2	8	657219	657226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_013501	GGC	2	6	657243	657248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013501	ATG	2	6	662640	662645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013501	GC	3	6	662691	662696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_013501	GAA	2	6	662725	662730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013501	TTCC	2	8	665455	665462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_013501	AGC	2	6	665465	665470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013501	ACGG	2	8	665476	665483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_013501	CGT	2	6	668967	668972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013501	GGT	2	6	670979	670984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013501	ACC	2	6	671058	671063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013501	TA	3	6	671072	671077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013501	GGC	2	6	676175	676180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013501	A	6	6	676193	676198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013501	CCGGT	2	10	677349	677358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1128	NC_013501	GCCGG	2	10	677379	677388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_013501	CG	3	6	677411	677416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_013501	AGC	2	6	679326	679331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013501	AGA	2	6	680445	680450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013501	CGG	2	6	680513	680518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013501	ACC	2	6	681746	681751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_013501	CAA	2	6	681754	681759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_013501	CGTT	2	8	681770	681777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_013501	CGA	2	6	681782	681787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_013501	CGC	2	6	694041	694046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1257	NC_013501	ATCTG	2	10	749212	749221	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1265	NC_013501	CGGT	2	8	749588	749595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1443	NC_013501	CTG	2	6	905989	905994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_013501	CCGT	2	8	906585	906592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_013501	TGT	3	9	906641	906649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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