MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013501	CGT	2	6	296871	296876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013501	GGCT	2	8	296909	296916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_013501	A	7	7	296954	296960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013501	T	6	6	296987	296992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013501	CGG	2	6	297007	297012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013501	AGG	2	6	297020	297025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013501	TGC	2	6	299845	299850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013501	CAA	2	6	307586	307591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013501	ATAC	2	8	309684	309691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_013501	GCC	2	6	309703	309708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_013501	T	6	6	309723	309728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013501	GTG	2	6	309859	309864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013501	TCT	2	6	312908	312913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013501	GAA	2	6	314770	314775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013501	CAG	2	6	315292	315297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_013501	TGT	2	6	315319	315324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013501	GTG	2	6	317576	317581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013501	ACG	2	6	317600	317605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013501	ATT	2	6	317608	317613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013501	TGG	2	6	318643	318648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013501	ATCC	2	8	319448	319455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_013501	TAA	2	6	319460	319465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013501	ATT	2	6	319536	319541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013501	GA	3	6	319625	319630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013501	AAC	2	6	319850	319855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013501	GGA	2	6	320191	320196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013501	CAC	2	6	320198	320203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_013501	GCG	2	6	323876	323881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013501	GTT	2	6	327147	327152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013501	ACC	2	6	328886	328891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013501	TCG	2	6	328925	328930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013501	TTTTG	2	10	328940	328949	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013501	AAC	2	6	332838	332843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_013501	A	6	6	332874	332879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013501	GCT	2	6	332906	332911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013501	GAG	2	6	332923	332928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013501	AGCGAA	2	12	333938	333949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_013501	CAG	2	6	333995	334000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013501	A	7	7	334125	334131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013501	GCAG	2	8	334140	334147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_013501	AGG	2	6	334152	334157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013501	A	6	6	334467	334472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013501	GGC	2	6	334483	334488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013501	TTG	2	6	334515	334520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013501	A	6	6	334533	334538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013501	TTTA	2	8	335461	335468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013501	AGG	2	6	335481	335486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013501	GAAA	2	8	335957	335964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013501	GGCGA	2	10	335968	335977	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
550	NC_013501	TCC	2	6	335980	335985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013501	TATT	2	8	336235	336242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013501	GC	3	6	336303	336308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013501	CAAC	2	8	337845	337852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013501	ACCA	2	8	337880	337887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013501	GT	3	6	338204	338209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013501	GGTG	2	8	341959	341966	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013501	CCG	2	6	341994	341999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_013501	TCCC	2	8	342030	342037	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
559	NC_013501	TGTT	2	8	342088	342095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013501	CGGG	2	8	342109	342116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
561	NC_013501	CGCTT	2	10	342117	342126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_013501	GCC	3	9	342152	342160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_013501	CG	3	6	347154	347159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_013501	A	6	6	349551	349556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013501	ACGG	2	8	350969	350976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_013501	GTG	2	6	351032	351037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013501	TTC	2	6	351084	351089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013501	AGGG	2	8	351101	351108	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013501	TGC	2	6	351248	351253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013501	ACC	2	6	351291	351296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_013501	GGGTT	2	10	353024	353033	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013501	AGT	2	6	353798	353803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013501	CGA	2	6	353805	353810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013501	CGG	2	6	353820	353825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013501	GA	3	6	353831	353836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013501	TG	3	6	353874	353879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013501	CGG	2	6	353926	353931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013501	CAC	2	6	353932	353937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_013501	A	8	8	357544	357551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013501	CCG	2	6	357566	357571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_013501	CTT	2	6	357590	357595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013501	GGACT	2	10	357615	357624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
583	NC_013501	CAG	2	6	357798	357803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013501	CGGA	2	8	357860	357867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
585	NC_013501	GC	3	6	357872	357877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_013501	GTC	2	6	358771	358776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013501	TCAG	2	8	358785	358792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_013501	GC	3	6	361210	361215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_013501	CGGGG	2	10	361216	361225	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
590	NC_013501	TGT	2	6	362663	362668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013501	A	6	6	362738	362743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013501	CCCG	2	8	362746	362753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
593	NC_013501	CGGG	2	8	362759	362766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
594	NC_013501	T	6	6	362769	362774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013501	TCG	2	6	365930	365935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013501	CATAA	2	10	366053	366062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_013501	CA	3	6	367506	367511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_013501	CCT	2	6	368171	368176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_013501	CCGG	2	8	368244	368251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_013501	CTG	2	6	368738	368743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013501	GAA	2	6	368815	368820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013501	CGC	2	6	368824	368829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_013501	CTG	2	6	368830	368835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013501	GCG	2	6	368855	368860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013501	A	6	6	370617	370622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013501	AGC	2	6	370656	370661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013501	GGCC	2	8	371740	371747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_013501	GGC	2	6	371756	371761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013501	GGC	2	6	371804	371809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013501	CG	3	6	371826	371831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_013501	TTC	2	6	371839	371844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013501	GAC	2	6	373766	373771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013501	GGAT	2	8	373772	373779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013501	GTT	2	6	374573	374578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013501	GAA	2	6	374601	374606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013501	ACG	2	6	374620	374625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013501	CTT	3	9	376063	376071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013501	A	6	6	378015	378020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013501	CTG	2	6	378065	378070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013501	TAA	2	6	378079	378084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013501	CGG	2	6	378131	378136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013501	CCG	2	6	378196	378201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013501	GCC	2	6	381558	381563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_013501	CTA	2	6	381995	382000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013501	GAA	2	6	382052	382057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013501	GCGG	2	8	383650	383657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
627	NC_013501	GCA	2	6	383662	383667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013501	GCA	2	6	383719	383724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013501	TCG	2	6	383739	383744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013501	GCA	2	6	383746	383751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013501	AGC	2	6	383754	383759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013501	CGC	2	6	383770	383775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_013501	GC	4	8	383774	383781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_013501	GTA	3	9	383857	383865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013501	ACG	2	6	383872	383877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013501	GGC	2	6	386394	386399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013501	GGTG	2	8	386401	386408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013501	GGCGG	2	10	386410	386419	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
639	NC_013501	CGG	2	6	386444	386449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013501	TGGCA	2	10	386556	386565	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
641	NC_013501	TTAA	2	8	387466	387473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_013501	GGC	2	6	388218	388223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_013501	GCC	2	6	391142	391147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_013501	GGC	2	6	391159	391164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_013501	GCT	2	6	391195	391200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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658	NC_013501	CGG	2	6	408697	408702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_013501	GCG	2	6	411325	411330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_013501	GCG	2	6	414854	414859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_013501	ACA	2	6	420427	420432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_013501	CGG	2	6	420582	420587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_013501	GCC	2	6	465102	465107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
765	NC_013501	CAGA	2	8	465122	465129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
766	NC_013501	CTT	2	6	465133	465138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_013501	GGC	2	6	465193	465198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_013501	CAG	2	6	465222	465227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_013501	TCC	2	6	467892	467897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
770	NC_013501	GTT	2	6	467939	467944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
771	NC_013501	CGG	2	6	467955	467960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_013501	GATCTT	2	12	467996	468007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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774	NC_013501	GATC	2	8	468088	468095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
775	NC_013501	AGG	2	6	468141	468146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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