MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013222	AACGCC	2	12	21714	21725	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013222	TTTACA	2	12	68355	68366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013222	TTCTTT	2	12	93706	93717	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013222	AGCCAG	2	12	144881	144892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013222	GGCCGG	2	12	147824	147835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013222	CTCAGT	2	12	306083	306094	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013222	TCTTAA	2	12	310002	310013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013222	AAACAA	2	12	332757	332768	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013222	CATACT	2	12	333168	333179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013222	CGAAAA	2	12	366674	366685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013222	ATGACA	2	12	368773	368784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013222	AGAAAG	2	12	370824	370835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013222	GTTGCT	2	12	392225	392236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013222	TGCACT	2	12	441955	441966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013222	CAATAC	2	12	463456	463467	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013222	AAAATA	2	12	546095	546106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013222	GCGGTT	2	12	550119	550130	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013222	CCCGGG	2	12	658492	658503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013222	AAAATA	2	12	661417	661428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013222	CCGGCG	2	12	787674	787685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013222	AATTAA	2	12	859175	859186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013222	CAAATT	2	12	870085	870096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013222	TAACCA	2	12	886450	886461	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013222	TTCCGG	2	12	889506	889517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013222	TTTAAG	2	12	922263	922274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013222	TTTAAA	2	12	932486	932497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013222	GGTTGC	2	12	942077	942088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013222	CTGGCC	2	12	959851	959862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013222	CGAATT	2	12	1044478	1044489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013222	TCTTTT	2	12	1051464	1051475	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013222	ATGCTG	2	12	1174626	1174637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013222	CCCGGC	2	12	1246880	1246891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013222	CGGAGC	2	12	1339080	1339091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013222	CGTTGA	2	12	1339201	1339212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013222	TTTTTA	2	12	1372033	1372044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013222	GGCGCC	2	12	1401555	1401566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013222	GGCTGT	2	12	1426072	1426083	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013222	GCTGTG	2	12	1426088	1426099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013222	TTTGGA	2	12	1437907	1437918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013222	GCCGGG	2	12	1451030	1451041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013222	CCCGGC	2	12	1579479	1579490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013222	TATTTT	2	12	1588723	1588734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013222	ATCCGG	2	12	1602221	1602232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013222	TCTTTA	2	12	1616620	1616631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013222	CGGCTC	2	12	1626471	1626482	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013222	GGCTCC	2	12	1626484	1626495	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013222	GGAAAA	2	12	1631300	1631311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013222	AACTGA	2	12	1676972	1676983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013222	CGTGGC	2	12	1692762	1692773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013222	AAGATA	2	12	1738990	1739001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013222	TTTTGC	2	12	1786326	1786337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013222	ATTTTT	2	12	1788018	1788029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013222	TCGCTG	2	12	1908182	1908193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013222	GCCTCC	2	12	1918592	1918603	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013222	TCGCAG	2	12	1935582	1935593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013222	TTAAAA	2	12	1986992	1987003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013222	CGGCTC	2	12	2030982	2030993	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013222	AAAAAT	2	12	2143740	2143751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013222	TTCGAA	2	12	2162072	2162083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013222	CCCGGA	2	12	2353753	2353764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013222	TGCGGG	2	12	2399662	2399673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013222	CGATTT	2	12	2420204	2420215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013222	TTGGTT	2	12	2444285	2444296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013222	TATTTT	2	12	2471497	2471508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013222	TTAATA	2	12	2574021	2574032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013222	AATGAA	2	12	2605683	2605694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013222	CGTCCC	2	12	2614597	2614608	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013222	GTAAAA	2	12	2762096	2762107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013222	TCAACG	2	12	2805707	2805718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013222	GCTCCG	2	12	2805828	2805839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013222	GGCATA	2	12	2875116	2875127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013222	TAAAAA	2	12	2886323	2886334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013222	AAAAAC	2	12	3009470	3009481	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013222	AAACCG	2	12	3064965	3064976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013222	CGCGCT	2	12	3123479	3123490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013222	AATTGG	2	12	3135928	3135939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013222	ACCTAA	2	12	3280849	3280860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013222	GCAGAA	2	12	3336226	3336237	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013222	GCTACA	2	12	3362178	3362189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013222	ATAAAG	2	12	3363882	3363893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013222	GCACCT	2	12	3364021	3364032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013222	TGAAAA	2	12	3376373	3376384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013222	TATAGA	2	12	3461034	3461045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013222	TAAAAA	2	12	3519542	3519553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.