MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 5275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013222	TA	3	6	920883	920888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013222	TTTAAG	2	12	922263	922274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013222	TTA	2	6	922278	922283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013222	GTT	2	6	922297	922302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013222	TTA	2	6	922308	922313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013222	T	7	7	922331	922337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013222	AAT	2	6	926719	926724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013222	CG	3	6	926854	926859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013222	TAT	2	6	927444	927449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013222	T	7	7	927457	927463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013222	CGG	2	6	927676	927681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013222	A	6	6	927741	927746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013222	CGC	2	6	927862	927867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_013222	CTT	2	6	927900	927905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013222	GAGG	2	8	927908	927915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013222	AGG	2	6	927951	927956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013222	A	6	6	927984	927989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013222	T	6	6	928008	928013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013222	T	6	6	928151	928156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013222	CCG	2	6	928164	928169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_013222	TAA	2	6	930092	930097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013222	TGC	2	6	931062	931067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013222	TGT	2	6	932362	932367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013222	CAA	2	6	932480	932485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013222	TTTAAA	2	12	932486	932497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013222	TCAA	2	8	932753	932760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_013222	T	8	8	932804	932811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013222	CAG	2	6	932831	932836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013222	GCCT	2	8	936842	936849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013222	C	6	6	936861	936866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1531	NC_013222	GCCC	2	8	936896	936903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1532	NC_013222	GGTTGC	2	12	942077	942088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1533	NC_013222	AGA	2	6	942099	942104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013222	ACAA	2	8	942106	942113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_013222	A	6	6	942112	942117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013222	GTGC	2	8	942138	942145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_013222	T	6	6	942150	942155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013222	GAA	2	6	944428	944433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013222	TTA	2	6	944484	944489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013222	TTGT	2	8	953912	953919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013222	ATTT	2	8	953956	953963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013222	ACTG	2	8	953964	953971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_013222	ATG	2	6	954015	954020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013222	AGC	2	6	954048	954053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_013222	CCGGG	2	10	954977	954986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1546	NC_013222	A	6	6	959819	959824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013222	CTGGCC	2	12	959851	959862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_013222	GTA	2	6	959991	959996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013222	ATT	2	6	960040	960045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013222	ACA	2	6	963677	963682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013222	GTTA	2	8	963846	963853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013222	T	7	7	963891	963897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013222	GCC	2	6	963917	963922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_013222	ATG	2	6	964124	964129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013222	T	6	6	965799	965804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013222	CCGG	2	8	965860	965867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_013222	G	7	7	965901	965907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013222	GGCC	2	8	966531	966538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_013222	TTC	2	6	967226	967231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013222	GGCT	2	8	967821	967828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_013222	CAG	2	6	968512	968517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013222	CTC	2	6	968531	968536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_013222	CG	3	6	968567	968572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_013222	TCGG	2	8	971409	971416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_013222	TGGT	3	12	972453	972464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013222	GCA	2	6	972530	972535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013222	TTG	2	6	972572	972577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013222	GA	3	6	972587	972592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013222	TTCC	2	8	972620	972627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_013222	AAAAG	2	10	976753	976762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013222	GAA	2	6	976809	976814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013222	TTG	2	6	978601	978606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013222	GTT	2	6	979462	979467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013222	CGC	2	6	979507	979512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_013222	GTT	2	6	979521	979526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013222	AT	3	6	980792	980797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013222	CAA	2	6	980845	980850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_013222	T	6	6	982277	982282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013222	T	7	7	989836	989842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013222	C	6	6	990486	990491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1581	NC_013222	G	6	6	991182	991187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013222	AAG	3	9	991190	991198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013222	GAAG	2	8	991229	991236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013222	TGT	2	6	991867	991872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013222	ATT	2	6	992080	992085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013222	TG	3	6	992096	992101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013222	ACA	2	6	992106	992111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_013222	AT	3	6	992174	992179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013222	GGCC	2	8	996436	996443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_013222	T	6	6	996469	996474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013222	GCC	2	6	996578	996583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_013222	CGG	2	6	997888	997893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013222	TGG	2	6	997916	997921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013222	GGT	2	6	997929	997934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013222	TGGT	2	8	997978	997985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013222	GTATT	2	10	998236	998245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013222	TTG	2	6	1003069	1003074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013222	CAC	2	6	1003170	1003175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_013222	CGG	2	6	1005965	1005970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013222	T	7	7	1005982	1005988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013222	AAC	2	6	1006478	1006483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013222	AAC	2	6	1006498	1006503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013222	TAC	2	6	1008333	1008338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013222	TATTC	2	10	1008431	1008440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_013222	C	6	6	1008457	1008462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1606	NC_013222	AAC	2	6	1015564	1015569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013222	CA	3	6	1016182	1016187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_013222	CCT	2	6	1020986	1020991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_013222	CGG	2	6	1021013	1021018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013222	AAATT	2	10	1021040	1021049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013222	GGA	2	6	1021692	1021697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013222	GGC	2	6	1023580	1023585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_013222	C	7	7	1025044	1025050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1614	NC_013222	G	6	6	1026247	1026252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013222	CTG	2	6	1033151	1033156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_013222	GAA	2	6	1036131	1036136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013222	T	8	8	1036155	1036162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013222	T	7	7	1036190	1036196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013222	A	6	6	1036223	1036228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013222	ATAA	2	8	1036252	1036259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013222	T	7	7	1038131	1038137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013222	TGC	2	6	1038142	1038147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013222	ATT	2	6	1041954	1041959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013222	GAA	2	6	1041989	1041994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013222	CCG	2	6	1041996	1042001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_013222	CGAATT	2	12	1044478	1044489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1627	NC_013222	CGG	2	6	1044497	1044502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013222	AAC	2	6	1044532	1044537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_013222	GCAG	2	8	1046530	1046537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_013222	AAC	2	6	1046568	1046573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013222	TAA	2	6	1049528	1049533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013222	CTGC	2	8	1049595	1049602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_013222	T	6	6	1049633	1049638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013222	CCCG	2	8	1049648	1049655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1635	NC_013222	A	9	9	1049659	1049667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013222	GGC	2	6	1049680	1049685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_013222	AGT	2	6	1051388	1051393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1766	NC_013222	CGTTC	2	10	1135580	1135589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1767	NC_013222	GTTA	2	8	1135632	1135639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_013222	T	8	8	1135672	1135679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1770	NC_013222	AACCA	2	10	1136179	1136188	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1772	NC_013222	CA	3	6	1137134	1137139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1773	NC_013222	GGGTA	2	10	1138244	1138253	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1791	NC_013222	A	7	7	1170143	1170149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1808	NC_013222	CCGG	2	8	1178407	1178414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1816	NC_013222	A	7	7	1186970	1186976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1881	NC_013222	A	6	6	1238143	1238148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1895	NC_013222	GCCG	3	12	1251890	1251901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1897	NC_013222	TGAAA	2	10	1252271	1252280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1899	NC_013222	GCA	2	6	1256930	1256935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1901	NC_013222	AGGG	2	8	1258416	1258423	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1902	NC_013222	ATATA	2	10	1258461	1258470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1904	NC_013222	CGC	2	6	1258525	1258530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1905	NC_013222	CGGC	2	8	1258561	1258568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1906	NC_013222	A	6	6	1258582	1258587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1907	NC_013222	GTAC	2	8	1262288	1262295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1908	NC_013222	ATT	2	6	1262301	1262306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1909	NC_013222	AAT	2	6	1262325	1262330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_013222	GAA	2	6	1262376	1262381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_013222	GTTT	2	8	1262403	1262410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_013222	CTT	2	6	1263787	1263792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1914	NC_013222	A	6	6	1263827	1263832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_013222	AAC	2	6	1264497	1264502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1919	NC_013222	CAA	2	6	1270297	1270302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1922	NC_013222	AT	3	6	1271330	1271335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_013222	GGA	2	6	1271341	1271346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1925	NC_013222	CTT	2	6	1277318	1277323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1926	NC_013222	CTG	2	6	1277336	1277341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1927	NC_013222	TCC	2	6	1277376	1277381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1928	NC_013222	TTG	2	6	1277408	1277413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1929	NC_013222	T	7	7	1277530	1277536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_013222	GCT	2	6	1277544	1277549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1935	NC_013222	A	6	6	1284321	1284326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_013222	TTA	2	6	1284381	1284386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_013222	GTT	2	6	1285337	1285342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_013222	TGA	2	6	1286593	1286598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_013222	CCA	2	6	1290223	1290228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1942	NC_013222	TTG	2	6	1292250	1292255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_013222	ACC	2	6	1292292	1292297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_013222	TA	3	6	1292938	1292943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_013222	GCAG	2	8	1294161	1294168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1946	NC_013222	TTA	2	6	1294224	1294229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1948	NC_013222	GATT	2	8	1294380	1294387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1949	NC_013222	GGTT	2	8	1294399	1294406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_013222	GTTT	2	8	1294407	1294414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_013222	CTT	2	6	1294447	1294452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1952	NC_013222	AACC	2	8	1294456	1294463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1953	NC_013222	TGT	2	6	1294518	1294523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1956	NC_013222	CTTT	2	8	1296837	1296844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1957	NC_013222	GGACT	2	10	1296852	1296861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1958	NC_013222	CGA	2	6	1296890	1296895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1965	NC_013222	GCT	2	6	1299409	1299414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1970	NC_013222	TTG	2	6	1301621	1301626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1976	NC_013222	TTC	2	6	1312439	1312444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1980	NC_013222	CTT	2	6	1317163	1317168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1988	NC_013222	CGG	2	6	1317845	1317850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1990	NC_013222	CAG	2	6	1319377	1319382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1992	NC_013222	GGCAG	2	10	1321195	1321204	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1993	NC_013222	T	6	6	1321277	1321282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1994	NC_013222	ATT	2	6	1321299	1321304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_013222	TGTT	2	8	1323735	1323742	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1999	NC_013222	GT	3	6	1325147	1325152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_013222	GCA	2	6	1325244	1325249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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