MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 5275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013222	GGC	2	6	307778	307783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013222	TTGC	2	8	307849	307856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_013222	CTCG	2	8	307876	307883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_013222	A	7	7	307895	307901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013222	CGCTT	2	10	307906	307915	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_013222	A	6	6	307922	307927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013222	CTT	2	6	307936	307941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013222	T	6	6	307940	307945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013222	T	7	7	307969	307975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013222	T	8	8	308012	308019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013222	CTG	2	6	308075	308080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013222	ATG	2	6	309239	309244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013222	AT	3	6	309263	309268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013222	AAC	2	6	309360	309365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013222	GAG	2	6	309368	309373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013222	CTG	2	6	309376	309381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013222	TCT	2	6	309503	309508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013222	TAG	2	6	309555	309560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013222	ATAA	2	8	309566	309573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013222	A	6	6	309794	309799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013222	CTT	2	6	309804	309809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013222	CTA	2	6	309898	309903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013222	T	6	6	309931	309936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013222	TCA	3	9	309959	309967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013222	CGT	2	6	309996	310001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013222	TCTTAA	2	12	310002	310013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_013222	TACT	2	8	310043	310050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_013222	TACT	2	8	310061	310068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_013222	CATA	2	8	310110	310117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013222	TA	3	6	310125	310130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013222	GTTAT	2	10	310148	310157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013222	TCT	3	9	310182	310190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013222	TTGT	2	8	312054	312061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013222	CAA	2	6	312507	312512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013222	T	6	6	312527	312532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013222	TTATT	2	10	312577	312586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013222	GCT	2	6	315682	315687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013222	TTG	2	6	315696	315701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013222	TCAC	2	8	315709	315716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_013222	TA	3	6	318315	318320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013222	ATG	2	6	318336	318341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013222	TTA	2	6	318398	318403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013222	AGC	2	6	318414	318419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013222	A	6	6	318554	318559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013222	TTGTT	2	10	318593	318602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013222	TGTT	2	8	318607	318614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013222	CAA	2	6	318628	318633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013222	ATTC	2	8	318645	318652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_013222	AAGGG	2	10	318665	318674	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013222	TTCCC	2	10	318702	318711	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
551	NC_013222	AAT	2	6	318766	318771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013222	AAGGG	2	10	319429	319438	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013222	AACC	2	8	319450	319457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013222	TAC	2	6	322787	322792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013222	TAA	2	6	322836	322841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013222	TCT	2	6	322843	322848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013222	CAA	2	6	331609	331614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013222	AATA	2	8	331634	331641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013222	T	7	7	332083	332089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013222	T	7	7	332124	332130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013222	AAT	2	6	332342	332347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013222	GA	3	6	332360	332365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013222	ACC	2	6	332374	332379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_013222	CAA	2	6	332390	332395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013222	TGC	2	6	332540	332545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013222	CCT	2	6	332652	332657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_013222	ACAA	2	8	332710	332717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_013222	TCAAA	2	10	332730	332739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
569	NC_013222	AAACAA	2	12	332757	332768	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_013222	TAT	2	6	332831	332836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013222	ACC	2	6	332839	332844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_013222	TGA	2	6	332922	332927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013222	GAA	2	6	332955	332960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013222	GTA	2	6	332987	332992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013222	ATG	2	6	333017	333022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013222	AAGG	2	8	333027	333034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_013222	CATACT	2	12	333168	333179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013222	TTGAT	2	10	333193	333202	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013222	TTTA	2	8	333204	333211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013222	AATC	2	8	333320	333327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013222	GATT	2	8	333332	333339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013222	A	6	6	333958	333963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013222	A	6	6	333992	333997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013222	CAA	2	6	334009	334014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013222	ATA	2	6	336000	336005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013222	ATTA	2	8	336034	336041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013222	TTTAA	2	10	336536	336545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013222	A	7	7	337052	337058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013222	ATT	2	6	337065	337070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013222	A	6	6	337281	337286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013222	AGT	2	6	337587	337592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013222	CAT	2	6	337671	337676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013222	A	6	6	337748	337753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013222	AGG	2	6	337896	337901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013222	CATC	2	8	338000	338007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_013222	GGC	2	6	338104	338109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013222	CCA	2	6	338148	338153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_013222	CGG	2	6	338201	338206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013222	ACT	2	6	338237	338242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013222	AAC	2	6	338347	338352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013222	CGA	2	6	338442	338447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013222	TGG	2	6	338465	338470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013222	ATG	2	6	338534	338539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013222	AATT	2	8	338577	338584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013222	AAC	2	6	341072	341077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013222	ACA	2	6	341542	341547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_013222	ATT	2	6	341554	341559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013222	T	6	6	341607	341612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013222	AATGA	2	10	341613	341622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013222	TAC	2	6	341665	341670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013222	TAA	4	12	341672	341683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013222	T	6	6	347223	347228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013222	AAG	2	6	347240	347245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013222	A	8	8	351543	351550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013222	AAT	2	6	351582	351587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_013222	TGA	2	6	351633	351638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013222	ATA	2	6	351656	351661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013222	ATGT	2	8	351693	351700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013222	AATT	2	8	351710	351717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013222	T	7	7	351765	351771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013222	ACAA	2	8	351803	351810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_013222	TCC	2	6	352733	352738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_013222	CTT	2	6	352746	352751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013222	CCA	2	6	352868	352873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013222	ACA	2	6	352896	352901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013222	GAA	2	6	352910	352915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013222	GCA	2	6	352918	352923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013222	GCT	2	6	354365	354370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013222	AAC	2	6	354378	354383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013222	A	6	6	354411	354416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013222	T	6	6	354715	354720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013222	TTA	2	6	354744	354749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013222	AGGT	2	8	354766	354773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013222	GGT	2	6	354784	354789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013222	A	8	8	354806	354813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013222	GTT	2	6	354846	354851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013222	GGT	2	6	355261	355266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_013222	GTT	2	6	355423	355428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013222	TCT	3	9	355435	355443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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