MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 5275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013222	TCAG	2	8	2952872	2952879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_013222	G	6	6	2953945	2953950	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_013222	GTTT	2	8	2954160	2954167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013222	TCA	2	6	2954181	2954186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013222	TTG	2	6	2954201	2954206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013222	ATT	2	6	2954210	2954215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013222	TCA	2	6	2954245	2954250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_013222	CAC	2	6	2956227	2956232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_013222	C	6	6	2956235	2956240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4510	NC_013222	GCGG	2	8	2956283	2956290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_013222	CTGC	2	8	2956298	2956305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_013222	AGGA	2	8	2957984	2957991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013222	G	7	7	2958952	2958958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013222	ATT	2	6	2959349	2959354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013222	TTGA	2	8	2959370	2959377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013222	A	6	6	2959393	2959398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013222	A	7	7	2959405	2959411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013222	AT	3	6	2959932	2959937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013222	ATA	2	6	2959963	2959968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013222	TA	4	8	2959979	2959986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013222	AAC	2	6	2959998	2960003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_013222	TCA	2	6	2961000	2961005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_013222	CAT	2	6	2961013	2961018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_013222	TCGG	2	8	2963205	2963212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_013222	CAA	2	6	2963262	2963267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_013222	AACC	2	8	2963292	2963299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_013222	CTG	2	6	2963364	2963369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_013222	TCA	2	6	2964061	2964066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_013222	CTG	2	6	2964084	2964089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_013222	T	6	6	2964114	2964119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013222	TAC	2	6	2964129	2964134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013222	A	7	7	2966345	2966351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013222	TTA	2	6	2966371	2966376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013222	A	6	6	2966401	2966406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013222	T	7	7	2966420	2966426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013222	CAG	2	6	2966840	2966845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_013222	CAG	2	6	2966913	2966918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013222	TGCAA	2	10	2967944	2967953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4539	NC_013222	TCGCT	2	10	2968033	2968042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4540	NC_013222	GCC	2	6	2968073	2968078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_013222	GCC	2	6	2968086	2968091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_013222	AATT	3	12	2974337	2974348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013222	GTT	2	6	2979485	2979490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013222	ATT	2	6	2979939	2979944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013222	CGG	2	6	2979999	2980004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_013222	TCC	2	6	2980013	2980018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_013222	GGGGC	2	10	2982660	2982669	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4548	NC_013222	ATT	2	6	2983649	2983654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013222	G	6	6	2983696	2983701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013222	GTA	2	6	2983724	2983729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013222	G	7	7	2986476	2986482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013222	CCT	2	6	2989085	2989090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_013222	TCA	2	6	2991439	2991444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013222	GCC	2	6	2991504	2991509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_013222	GCCA	2	8	2992502	2992509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_013222	ATC	2	6	2992519	2992524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_013222	GTTT	2	8	2995884	2995891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013222	TGTT	2	8	2995900	2995907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013222	CAA	2	6	2998925	2998930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_013222	AGG	2	6	2998978	2998983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013222	ACTCC	2	10	2998987	2998996	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4562	NC_013222	ATTC	2	8	2999007	2999014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_013222	AGT	2	6	2999097	2999102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_013222	GAAA	2	8	2999169	2999176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013222	TAAA	2	8	2999180	2999187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_013222	TGA	2	6	2999192	2999197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013222	T	7	7	2999254	2999260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013222	ATAG	2	8	3000751	3000758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013222	A	7	7	3000763	3000769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013222	AGGC	2	8	3000833	3000840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4571	NC_013222	C	6	6	3003126	3003131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4572	NC_013222	TAA	2	6	3003180	3003185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013222	T	7	7	3003213	3003219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013222	GAAT	2	8	3008005	3008012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_013222	GTA	2	6	3008119	3008124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013222	T	7	7	3008179	3008185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013222	GCGG	2	8	3008199	3008206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_013222	C	6	6	3009430	3009435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4579	NC_013222	T	6	6	3009447	3009452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013222	GAT	2	6	3009462	3009467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013222	AAAAAC	2	12	3009470	3009481	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4582	NC_013222	AAC	2	6	3009570	3009575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013222	CAAC	2	8	3011683	3011690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_013222	GGCC	2	8	3015508	3015515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_013222	CAAAC	2	10	3015575	3015584	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4586	NC_013222	TTCGG	2	10	3017036	3017045	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4587	NC_013222	A	8	8	3017098	3017105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013222	CCGG	2	8	3017110	3017117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_013222	TCA	2	6	3020792	3020797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_013222	GGCG	2	8	3020812	3020819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_013222	GGCA	2	8	3022663	3022670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_013222	CATTT	2	10	3022681	3022690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4593	NC_013222	TGG	2	6	3023862	3023867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013222	GA	3	6	3023897	3023902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_013222	ACC	2	6	3024001	3024006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_013222	TCT	2	6	3025686	3025691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_013222	TGAA	2	8	3025715	3025722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013222	TTCGT	2	10	3025751	3025760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4599	NC_013222	ATC	2	6	3025782	3025787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013222	TCA	2	6	3025870	3025875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_013222	GAG	2	6	3025878	3025883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013222	TCTT	2	8	3026886	3026893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_013222	ATG	2	6	3027027	3027032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013222	ACA	2	6	3027134	3027139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013222	CGG	2	6	3028082	3028087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013222	CGA	2	6	3032929	3032934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013222	CCAA	2	8	3037261	3037268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_013222	TAA	2	6	3039548	3039553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013222	CAA	2	6	3039597	3039602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013222	CG	3	6	3039617	3039622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_013222	ATTTT	2	10	3041908	3041917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013222	CGG	2	6	3042441	3042446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013222	GCT	2	6	3042480	3042485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_013222	GTT	2	6	3044854	3044859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013222	ATT	2	6	3045011	3045016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013222	AC	3	6	3046732	3046737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_013222	ATT	2	6	3046796	3046801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013222	C	9	9	3048708	3048716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4619	NC_013222	A	8	8	3048717	3048724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013222	GCG	2	6	3052439	3052444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_013222	GCG	2	6	3052534	3052539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_013222	ACG	2	6	3052601	3052606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_013222	CAG	2	6	3052739	3052744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013222	CAGG	2	8	3052768	3052775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_013222	AGGC	2	8	3052781	3052788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_013222	TAT	2	6	3056337	3056342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013222	GAA	2	6	3059925	3059930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013222	TCC	2	6	3059961	3059966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_013222	CAG	2	6	3059982	3059987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013222	TCCA	2	8	3060155	3060162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_013222	GAG	2	6	3060218	3060223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_013222	GGT	2	6	3060227	3060232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013222	TTC	2	6	3060253	3060258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_013222	CGC	2	6	3060313	3060318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4635	NC_013222	AAGC	2	8	3060416	3060423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4636	NC_013222	CGAA	2	8	3060520	3060527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4637	NC_013222	TTGA	2	8	3061230	3061237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_013222	GTTTT	2	10	3061291	3061300	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4640	NC_013222	TATC	2	8	3061372	3061379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4684	NC_013222	CGCT	2	8	3090493	3090500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4750	NC_013222	CAAT	2	8	3124434	3124441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4751	NC_013222	GTA	2	6	3124451	3124456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4753	NC_013222	AGTTT	2	10	3125805	3125814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4757	NC_013222	ATC	2	6	3127036	3127041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_013222	T	6	6	3127056	3127061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_013222	AAT	2	6	3127070	3127075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4761	NC_013222	TAT	2	6	3127213	3127218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4762	NC_013222	ATCG	2	8	3128140	3128147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4763	NC_013222	AAC	2	6	3128188	3128193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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