MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012857	AGCGA	2	10	1524	1533	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012857	GAATT	2	10	10107	10116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012857	GGCGT	2	10	27799	27808	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012857	CCCCA	2	10	37156	37165	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_012857	CGACA	2	10	37183	37192	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012857	GCGGA	2	10	41931	41940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012857	CACGC	2	10	43975	43984	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_012857	TGCCC	2	10	46902	46911	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012857	TTTTG	2	10	47534	47543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012857	GGATA	3	15	54444	54458	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012857	TGCGC	2	10	59350	59359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012857	CATCA	2	10	59502	59511	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012857	AACCG	2	10	59604	59613	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012857	CCATT	2	10	61393	61402	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012857	CACCT	2	10	67739	67748	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_012857	TGCCG	2	10	75051	75060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012857	GCCAC	2	10	77496	77505	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_012857	GCCCA	2	10	77780	77789	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012857	CAATA	2	10	78729	78738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012857	CATCG	2	10	78981	78990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012857	CTGAT	2	10	99721	99730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012857	CTGCA	2	10	99764	99773	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012857	ACAGC	2	10	104548	104557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012857	CGGCA	2	10	123713	123722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012857	GCGCC	2	10	138804	138813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_012857	GCCAT	2	10	175268	175277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012857	CCGGG	2	10	182640	182649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_012857	AAACC	2	10	182716	182725	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012857	ACCGC	2	10	182748	182757	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_012857	GTCGG	2	10	188116	188125	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012857	GCGCG	2	10	188597	188606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012857	GGGAG	2	10	202344	202353	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012857	CCGCA	2	10	234607	234616	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_012857	GCGCC	2	10	259263	259272	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_012857	ATTCT	2	10	275970	275979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012857	CGATG	2	10	279930	279939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012857	ACGCA	2	10	281929	281938	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012857	GTTCT	2	10	299717	299726	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012857	CCCTC	2	10	300407	300416	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
40	NC_012857	ACCCG	2	10	315505	315514	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_012857	TGCAA	2	10	330932	330941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012857	ACGCC	2	10	331191	331200	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_012857	GGCGC	2	10	331414	331423	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012857	CGCGC	2	10	340568	340577	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_012857	CTAGC	2	10	357262	357271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012857	CAGAT	2	10	359948	359957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012857	CCTAG	2	10	361241	361250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012857	CGGTT	2	10	407026	407035	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012857	GACAG	2	10	412336	412345	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012857	ACGGG	2	10	413667	413676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012857	TGCCC	2	10	440700	440709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_012857	AGCGA	2	10	440765	440774	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012857	CTTTT	2	10	446041	446050	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012857	GGTGG	2	10	448057	448066	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012857	TCGGT	2	10	449569	449578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012857	AGGCA	2	10	464344	464353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012857	CTTTT	2	10	470539	470548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012857	CAACG	2	10	506203	506212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_012857	GATTC	2	10	513254	513263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012857	AACTA	2	10	521739	521748	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012857	GCCCC	2	10	530325	530334	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
62	NC_012857	GGCTG	2	10	550150	550159	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012857	TGCAA	2	10	551433	551442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012857	TCGCT	2	10	555480	555489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012857	GTGGG	2	10	556809	556818	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012857	GCCGC	2	10	557898	557907	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_012857	GCGCA	3	15	560675	560689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_012857	GCGCA	2	10	566456	566465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_012857	GGGAA	2	10	569193	569202	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012857	GCCAG	2	10	571663	571672	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012857	GCCCA	2	10	571681	571690	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_012857	GGTGA	2	10	572259	572268	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012857	CGGCA	2	10	573510	573519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012857	GTGTT	2	10	576592	576601	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012857	GCGTT	2	10	576602	576611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012857	GCTTG	2	10	576643	576652	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012857	CATCA	2	10	583870	583879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012857	AAGCA	2	10	586141	586150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012857	GCAAA	2	10	609436	609445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012857	GCCGC	2	10	614734	614743	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_012857	CATGC	2	10	615500	615509	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012857	TCGCT	2	10	631273	631282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012857	AGCGA	2	10	631531	631540	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012857	ACGAT	2	10	643091	643100	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012857	CAACC	2	10	643121	643130	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_012857	AAAAC	2	10	648171	648180	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012857	GCGAA	2	10	663866	663875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012857	TGTGA	2	10	667143	667152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012857	CGGTT	2	10	671536	671545	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012857	CGGCG	2	10	712411	712420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_012857	CCGTC	2	10	714284	714293	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_012857	TCGCT	2	10	722314	722323	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_012857	CCGGC	2	10	740745	740754	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_012857	TTTCC	2	10	753855	753864	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_012857	CGTCG	2	10	754277	754286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012857	ATCCG	2	10	754504	754513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_012857	TGGCG	2	10	802357	802366	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012857	GGCGG	2	10	813126	813135	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012857	CAAGC	2	10	824061	824070	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012857	GTTTG	2	10	826705	826714	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012857	CCGTT	2	10	831549	831558	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_012857	CAGGC	2	10	841539	841548	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_012857	GGCGG	2	10	853969	853978	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012857	GCTTC	2	10	865178	865187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_012857	CCTGC	2	10	872556	872565	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012857	GCCGC	2	10	873075	873084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_012857	CTTCC	2	10	873448	873457	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_012857	GTGCG	2	10	873551	873560	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012857	AGCGA	2	10	879462	879471	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012857	TCGCT	2	10	920520	920529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012857	CCCGA	2	10	944700	944709	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_012857	GTTGG	2	10	957495	957504	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012857	GAATT	2	10	969008	969017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012857	ATGGG	2	10	969080	969089	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012857	TTCTT	2	10	969192	969201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012857	GCGCG	2	10	988314	988323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_012857	CCGGC	2	10	997491	997500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_012857	GTAAA	2	10	1003776	1003785	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012857	GGCGG	2	10	1021064	1021073	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012857	GTTGG	2	10	1033925	1033934	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012857	GCGCA	2	10	1036159	1036168	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012857	GCAAT	2	10	1036304	1036313	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012857	ACCGA	2	10	1036490	1036499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012857	ATGGG	2	10	1037137	1037146	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012857	CAGGG	2	10	1042864	1042873	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012857	ACGCA	2	10	1044329	1044338	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_012857	CATCA	2	10	1047373	1047382	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012857	GCAGG	2	10	1053694	1053703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012857	ATCTG	2	10	1061322	1061331	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012857	TCCAT	2	10	1061381	1061390	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012857	GAAGC	2	10	1064279	1064288	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012857	CGCGC	2	10	1112497	1112506	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_012857	TAACA	2	10	1112683	1112692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012857	TTCGA	2	10	1117787	1117796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012857	GCCGC	2	10	1119039	1119048	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_012857	CGGGT	2	10	1119102	1119111	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012857	GAGCT	2	10	1128305	1128314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012857	CAGCG	2	10	1152639	1152648	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_012857	CTCGA	2	10	1156926	1156935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_012857	GCAGC	2	10	1166180	1166189	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_012857	TGCAA	2	10	1182100	1182109	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012857	ATCCG	2	10	1209952	1209961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012857	TCTGT	2	10	1240291	1240300	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012857	ACCCC	2	10	1252072	1252081	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_012857	CCACG	2	10	1252659	1252668	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_012857	GGTGT	2	10	1256790	1256799	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012857	GACAA	2	10	1256809	1256818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012857	CAAAA	2	10	1263710	1263719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012857	ATGCG	2	10	1269248	1269257	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012857	GCGAC	2	10	1271576	1271585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012857	CGGGT	2	10	1273639	1273648	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012857	TGCCG	2	10	1274047	1274056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_012857	GATGA	2	10	1280732	1280741	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012857	CTCCC	2	10	1282731	1282740	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
155	NC_012857	CACGA	2	10	1284198	1284207	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_012857	ACAGC	2	10	1286044	1286053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_012857	AACAA	2	10	1287590	1287599	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_012857	CCGCC	2	10	1293335	1293344	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
159	NC_012857	CGCTT	2	10	1304900	1304909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_012857	CGCAC	2	10	1306779	1306788	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.