MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012856	CGAAAA	2	12	42849	42860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012856	CGCCTT	2	12	48293	48304	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012856	CAGAAA	2	12	78339	78350	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012856	CAAACC	2	12	103024	103035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012856	ATTGTT	2	12	116543	116554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012856	TTTTTG	2	12	160241	160252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012856	TGAAGA	2	12	175726	175737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012856	GGCGCC	2	12	202821	202832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012856	GCACGG	2	12	210284	210295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012856	TCGACA	2	12	230173	230184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012856	CATGCA	2	12	267862	267873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012856	CAATTC	2	12	278336	278347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012856	TCTTTC	2	12	389982	389993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012856	CTGCCG	2	12	408191	408202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012856	TTTCGA	2	12	427501	427512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012856	ACGATG	2	12	439974	439985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012856	ACGCGA	2	12	485427	485438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012856	CGGCGC	2	12	518167	518178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012856	GCGGTC	2	12	542579	542590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012856	CCTCAA	2	12	548151	548162	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012856	CACGCT	2	12	556436	556447	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012856	GCGGAC	2	12	592204	592215	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012856	GCATTC	2	12	613442	613453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012856	CGTTCG	2	12	641456	641467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012856	GGCTGT	2	12	677550	677561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012856	CGGTGC	2	12	682690	682701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012856	CTCCGG	2	12	789950	789961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012856	TGGATG	2	12	835114	835125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012856	ATGGGG	2	12	862897	862908	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012856	CGTTAT	2	12	937356	937367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012856	GGCAAC	2	12	954580	954591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012856	TGTCGC	2	12	955151	955162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012856	GCGTGC	2	12	972637	972648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012856	ACGCCG	2	12	1011891	1011902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012856	TGGCGT	2	12	1018564	1018575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012856	GCTCCG	2	12	1029626	1029637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012856	GCCTCC	2	12	1053924	1053935	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012856	GGCGCA	2	12	1054500	1054511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012856	CGCCGG	2	12	1070477	1070488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012856	CGTGCC	2	12	1070730	1070741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012856	CGTTTT	2	12	1079938	1079949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012856	GCGTCG	2	12	1080974	1080985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012856	GGTGCA	2	12	1084553	1084564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012856	CGCGGC	2	12	1220909	1220920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012856	TCCCGA	2	12	1236061	1236072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012856	GATTGG	2	12	1253374	1253385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012856	CGCCAA	2	12	1365806	1365817	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012856	AGGGGC	2	12	1366762	1366773	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012856	TTCTGT	2	12	1516197	1516208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012856	ATTTTT	2	12	1571073	1571084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012856	TGCCGC	2	12	1583495	1583506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012856	CTTGGC	2	12	1600838	1600849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012856	TCCGGC	2	12	1621407	1621418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012856	CCGAAG	2	12	1668179	1668190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012856	CACTGC	2	12	1699561	1699572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012856	TTATGT	2	12	1765108	1765119	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012856	TCAAAT	2	12	1774289	1774300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012856	GGCGAA	3	18	1811558	1811575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012856	GCTTCA	2	12	1824185	1824196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012856	CGGCCC	2	12	1903907	1903918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012856	GTTGCA	2	12	1914401	1914412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012856	AGGCCG	2	12	1962802	1962813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012856	CTTGCA	4	24	1978399	1978422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012856	CTCGCA	6	36	1978423	1978458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012856	TGTGAA	2	12	2024694	2024705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012856	GCCGGA	2	12	2080650	2080661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012856	GTTCTA	2	12	2081947	2081958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012856	GCGCTC	2	12	2090016	2090027	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012856	GCGGGA	2	12	2099711	2099722	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012856	AAGAAA	2	12	2155980	2155991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012856	CTTCAC	2	12	2158872	2158883	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012856	GCGCCG	2	12	2217240	2217251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012856	CGTTCT	2	12	2222671	2222682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012856	GCCGTC	2	12	2223281	2223292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012856	GGAAGG	2	12	2334939	2334950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012856	AGTCAA	2	12	2413823	2413834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012856	GCAAGA	2	12	2442039	2442050	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012856	GGCACC	2	12	2500811	2500822	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012856	TGACGA	2	12	2506828	2506839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012856	TCCCGC	2	12	2516263	2516274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012856	GCAACA	2	12	2516645	2516656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012856	GCAAAC	3	18	2540570	2540587	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012856	CCGGCG	2	12	2567649	2567660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012856	ACTTTT	2	12	2616331	2616342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012856	GACGTT	2	12	2621860	2621871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012856	CCCTCC	2	12	2627423	2627434	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_012856	TGCCGT	2	12	2637663	2637674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012856	GCGCCG	2	12	2681761	2681772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012856	CCGCGC	2	12	2681802	2681813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012856	GACAAG	2	12	2789223	2789234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012856	GCCGGA	2	12	2829331	2829342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012856	GCGAAG	2	12	2830079	2830090	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012856	TGGCAA	2	12	2837627	2837638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012856	TAAAAA	2	12	2846800	2846811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012856	CCCGCC	2	12	2849938	2849949	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_012856	TCTCCC	2	12	2852990	2853001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_012856	CCTGGC	2	12	2921219	2921230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012856	TCGACT	2	12	2927570	2927581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012856	CGCGAT	2	12	2942182	2942193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012856	GGCGCT	2	12	2960910	2960921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012856	CGAACG	2	12	2989735	2989746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012856	CTGCGG	2	12	2999749	2999760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012856	AAAAAG	2	12	3069615	3069626	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012856	GGGTTT	2	12	3224566	3224577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012856	CCGCCT	2	12	3224670	3224681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012856	AACCAA	3	18	3225939	3225956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012856	ACTGCA	4	24	3274769	3274792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012856	TCTCTT	2	12	3284212	3284223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012856	ACGGCC	2	12	3291908	3291919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012856	CCTTCC	2	12	3317807	3317818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012856	AAAACC	2	12	3328883	3328894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012856	CCGCCT	2	12	3341016	3341027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012856	CAAAAA	2	12	3341147	3341158	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012856	CAAGTC	3	18	3353755	3353772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012856	GTTCTT	2	12	3397802	3397813	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012856	CTGCCG	2	12	3443912	3443923	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012856	TGCGCC	2	12	3503095	3503106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012856	GAGGCC	2	12	3530373	3530384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012856	GCATCG	2	12	3566481	3566492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012856	GGCAGC	2	12	3581197	3581208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.