MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012854	CGGC	2	8	212541	212548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_012854	ACC	2	6	212559	212564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_012854	CGG	3	9	212601	212609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_012854	ACG	2	6	212670	212675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012854	CAG	3	9	212687	212695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012854	GAT	2	6	212752	212757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012854	TTC	2	6	212798	212803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012854	CCA	2	6	212807	212812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_012854	CACT	2	8	212824	212831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_012854	CAG	2	6	212834	212839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012854	ACA	2	6	212849	212854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012854	CTAG	2	8	212870	212877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_012854	ATC	2	6	212920	212925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_012854	T	6	6	212948	212953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012854	TCC	2	6	217890	217895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_012854	GGC	2	6	217900	217905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012854	C	6	6	217912	217917	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
518	NC_012854	TC	3	6	219076	219081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_012854	TCC	2	6	220279	220284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_012854	TCC	2	6	221075	221080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_012854	ATT	2	6	221165	221170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012854	GGC	2	6	222259	222264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012854	TCA	2	6	222270	222275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012854	TGA	2	6	222309	222314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012854	CGA	2	6	222337	222342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012854	TCG	2	6	222357	222362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_012854	ACG	2	6	222363	222368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012854	GC	3	6	222399	222404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_012854	CGG	2	6	222449	222454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_012854	TG	3	6	222456	222461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012854	TCGC	2	8	222495	222502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_012854	GAC	2	6	222518	222523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012854	CAC	2	6	222556	222561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_012854	GCT	2	6	222562	222567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012854	GATAGG	2	12	222583	222594	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012854	AT	3	6	222904	222909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012854	TCACGC	2	12	222928	222939	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
538	NC_012854	CAT	2	6	222973	222978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012854	CGC	2	6	222997	223002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_012854	GAG	2	6	223027	223032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012854	CCA	2	6	228958	228963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_012854	ATA	2	6	232623	232628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012854	ACC	2	6	232712	232717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_012854	C	7	7	232732	232738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
545	NC_012854	GGC	2	6	232770	232775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012854	CGC	2	6	232780	232785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_012854	AG	3	6	232835	232840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012854	GT	3	6	232927	232932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012854	GCGGA	2	10	232968	232977	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
550	NC_012854	GGT	2	6	233002	233007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012854	GCTT	2	8	233015	233022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_012854	CTT	2	6	233044	233049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012854	TGAT	2	8	233142	233149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012854	CAA	2	6	233194	233199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_012854	CCGACG	2	12	233205	233216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
556	NC_012854	GCG	2	6	233222	233227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012854	GGC	2	6	233244	233249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012854	CGT	2	6	233321	233326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012854	CGA	2	6	233380	233385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012854	AGA	2	6	233401	233406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012854	CGGC	2	8	234353	234360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_012854	GCG	2	6	234405	234410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_012854	GAT	2	6	234438	234443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012854	CTC	2	6	234444	234449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_012854	GAG	2	6	235768	235773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012854	TCG	2	6	237100	237105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012854	CAT	2	6	237901	237906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012854	TA	3	6	237927	237932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012854	CTC	2	6	243803	243808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_012854	TG	3	6	245211	245216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012854	T	7	7	245259	245265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012854	ACG	2	6	246326	246331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012854	GCAA	2	8	246332	246339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_012854	GCCG	2	8	246349	246356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_012854	TCG	2	6	246357	246362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012854	TGC	2	6	247438	247443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012854	GTC	2	6	247446	247451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_012854	ACC	2	6	247467	247472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_012854	GAA	2	6	247509	247514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012854	TCG	2	6	247549	247554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012854	GGA	2	6	247555	247560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012854	AGG	2	6	249912	249917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012854	GC	3	6	253968	253973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_012854	CAAT	2	8	254050	254057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_012854	TAT	2	6	267139	267144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012854	ATA	2	6	267153	267158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012854	GAG	2	6	267183	267188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012854	CG	3	6	267221	267226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_012854	TTC	2	6	267255	267260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_012854	GGC	2	6	267293	267298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012854	AGGC	2	8	267307	267314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_012854	CAT	2	6	267443	267448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012854	CCG	2	6	268254	268259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_012854	TAT	2	6	268282	268287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012854	CGG	2	6	268311	268316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_012854	CAA	2	6	268326	268331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012854	GCA	2	6	268385	268390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_012854	CTG	2	6	268399	268404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012854	TCGC	2	8	269834	269841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
600	NC_012854	A	7	7	269924	269930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012854	TGA	2	6	270010	270015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012854	CGA	2	6	270365	270370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012854	CGG	2	6	270444	270449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012854	GTC	2	6	270547	270552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012854	CGT	2	6	270561	270566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_012854	GACG	2	8	270568	270575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_012854	GCT	2	6	270657	270662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_012854	TCC	2	6	272194	272199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_012854	AT	3	6	272209	272214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012854	GC	3	6	272275	272280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_012854	GGC	2	6	272293	272298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012854	CGTCAC	3	18	272383	272400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012854	AAG	2	6	272455	272460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012854	CAT	2	6	272478	272483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_012854	A	6	6	272512	272517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012854	TCG	2	6	275906	275911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012854	TGG	2	6	275930	275935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012854	TGC	2	6	276014	276019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012854	CGG	2	6	276049	276054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_012854	ATC	2	6	276060	276065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012854	CATT	2	8	276066	276073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_012854	ATCG	2	8	278131	278138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_012854	TC	3	6	278458	278463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_012854	GAG	2	6	278492	278497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012854	CGG	2	6	279473	279478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012854	CTGC	2	8	279501	279508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_012854	GGA	2	6	279532	279537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012854	CGG	2	6	279553	279558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012854	TCGC	2	8	279661	279668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_012854	CGCAG	2	10	279681	279690	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
631	NC_012854	CGA	2	6	280596	280601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012854	TC	3	6	280680	280685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_012854	CG	3	6	280919	280924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_012854	CGC	2	6	280950	280955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_012854	CTG	2	6	280962	280967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_012854	TTGG	2	8	281007	281014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012854	GTC	2	6	281048	281053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_012854	TTG	2	6	281065	281070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012854	GTT	3	9	281086	281094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012854	GCCC	2	8	281128	281135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
641	NC_012854	CAC	2	6	281165	281170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_012854	CG	3	6	281199	281204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_012854	GCA	2	6	281262	281267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_012854	AGT	2	6	281354	281359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
645	NC_012854	AGA	2	6	281409	281414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_012854	CCT	2	6	282210	282215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_012854	AGC	2	6	282219	282224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_012854	CCTC	2	8	282241	282248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
649	NC_012854	ACCTT	2	10	282276	282285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
650	NC_012854	AAT	2	6	282296	282301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_012854	CG	3	6	282356	282361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_012854	CG	5	10	282411	282420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
653	NC_012854	TCC	2	6	283970	283975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
654	NC_012854	ATC	2	6	284900	284905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_012854	GAG	2	6	284949	284954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
656	NC_012854	GAA	2	6	286453	286458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
657	NC_012854	TTC	2	6	286462	286467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_012854	ATAA	2	8	286520	286527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
659	NC_012854	T	6	6	286559	286564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
660	NC_012854	TTG	2	6	286587	286592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
661	NC_012854	CGAC	2	8	286661	286668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
662	NC_012854	CTC	2	6	286670	286675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_012854	TCG	2	6	286691	286696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_012854	AGGC	2	8	286719	286726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
665	NC_012854	CAT	2	6	286736	286741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_012854	CATG	2	8	286760	286767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
667	NC_012854	GCG	2	6	286781	286786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_012854	GGTG	2	8	287788	287795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
669	NC_012854	TCC	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
670	NC_012854	CGG	3	9	287916	287924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_012854	TGC	2	6	287930	287935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_012854	CAG	2	6	287949	287954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_012854	GAG	2	6	288026	288031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
674	NC_012854	CCA	2	6	288092	288097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
675	NC_012854	A	6	6	288149	288154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_012854	CAA	2	6	288204	288209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
677	NC_012854	GCGGTC	2	12	288297	288308	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_012854	GA	3	6	288347	288352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
679	NC_012854	GAC	2	6	288356	288361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
680	NC_012854	GCC	2	6	288462	288467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
681	NC_012854	GCAG	2	8	294507	294514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
682	NC_012854	CCTG	2	8	294521	294528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
683	NC_012854	GCT	2	6	294534	294539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
684	NC_012854	TCG	2	6	294559	294564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_012854	ACG	2	6	294585	294590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
686	NC_012854	A	7	7	294658	294664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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